长角血蜱两性生殖和孤雌生殖种群线粒体基因组及卵巢发育相关基因的比较研究

发布时间：2021-09-02 02:50

　　长角血蜱Haemaphysalis longicornis是一种专性吸血的体外寄生虫,广泛分布于澳大利亚、新西兰和东亚等地区。在我国,长角血蜱是华北地区的优势种之一,具有极强的繁殖扩散能力,包括两性生殖种群（H.longicornis bisexual population,HLBP）和孤雌生殖种群（H.longicornis parthenogenetic population,HLPP）,对其繁殖机制和种群特性的深入比较研究具有重要的科学意义。本文对HLBP和HLPP线粒体基因组进行测序和比较分析,发现两个生殖种群在基因结构、数量和位置上无明显变化。系统发育分析显示,HLBP和HLPP的分化水平较低,亲缘关系紧密,遗传距离小于亚种水平。线粒体蛋白编码基因的定量分析显示,在HLBP和HLPP不同发育时期线粒体基因的转录模式存在明显差异,但遗传序列的研究结果依然支持两个生殖种群隶属同一物种。为从分子水平阐明长角血蜱卵巢发育相关的基因功能,对HLBP和HLPP不同吸血时期的卵巢进行转录组测序。分析结果显示,参与卵巢发育功能的基因主要集中在细胞分化、组织发育、信号转导、翻译修饰、脂类代谢、... 

【文章来源】：河北师范大学河北省

【文章页数】：114 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

蜱类线粒体基因组的重排特征Fig.1.1Generearrangementinthetickmitochondrialgenomes

10图1.2蜱类完整线粒体基因组构建的系统发育分析Fig.1.2Phylogeneticanalysisofthetickscompletemitochondrialgenome1.4.6线粒体基因组研究方向蜱螨类占螯肢亚门寄生动物的53%（ShaoandBarker,2007），对农业发展和人类健康造成了巨大危害，线粒体基因组已被证明可以有效应用于蜱类分类学研究，但90%以上的蜱类完整蜱线粒体基因组还未报道，一些物种线粒体基因组数据的缺失和物种采集的地理偏差会影响系统发育研究的可靠性，因此需要更多完

2.2.1 测序数据质控 对测序 reads 进行碱基含量分布和碱基错误率统计，可以反映出样本的测序质量，针对每个样本原始数据进行测序相关的质量评估。碱基含量分布可以检查样本有无碱基分离现象，理论上每个测序循环上 GC 和 AT 的含量相等，且在整个测序过程基本不变（图 2.1）。测序错误率会随着序列长度的增加而升高，在测序片段前端和末端几个循环的错误率会偏高（图 2.2）。测序结果显示，该文库碱基质量良好，可用于后续分析。

【参考文献】：
期刊论文
[1]孤雌生殖长角血蜱的哈氏器超微结构与发育[J]. 王多,胡永红,刘敬泽.  昆虫学报. 2013(03)
[2]孤雌生殖长角血蜱各虫期形态的扫描电镜观察[J]. 杨彩明,杨光友,谢幼新,吴开波,贾小勇.  寄生虫与医学昆虫学报. 2007(02)
[3]我国长角血蜱孤雌生殖种群的发现和生物学特性的研究[J]. 周金林,周勇志,龚海燕,陈灵芝,曹杰.  中国媒介生物学及控制杂志. 2004(03)



本文编号：3378157