盐渍藠头盐水细菌多样性及基因功能预测分析

发布时间：2021-09-02 06:27

　　采用Mi Seq高通量测序技术对来凤地区盐渍藠头盐水细菌多样性进行解析,并采用PICRUSt技术对其基因功能进行预测。结果表明,99.58%的基因序列长度为425～451 bp,基本覆盖16S r RNA V₃-V₄区序列;优势细菌门为硬壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）和放线菌门（Actinobacteria）,平均相对含量分别为43.94%、33.12%和18.21%;优势细菌属为乳杆菌属（Lactobacillus）、假单胞菌属（Pseudomonas）和嗜热油菌属（Thermoleophilum）,平均相对含量分别为30.28%、18.21%和16.13%;共有219个核心操作分类单元（OTU）,包含的序列数占总序列数的75.56%;盐渍藠头盐水中可能共有大量具有较强氨基酸转运和代谢功能的细菌类群。 

【文章来源】：中国酿造. 2020,39(10)北大核心

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

盐渍藠头盐水中平均相对含量>1.0%的细菌属

若某一OTU在6个盐渍藠头盐水样品中均存在，则将其定义为核心OTU[31],OTU在每个样品中的分布情况见图4。由图4可知，样品JT1～JT6分别含有3 256、2 843、3 272、4 296、2 636和2 980个OTU，其中219个为核心OTU，占OTU总数的1.63%，但包含了217998条序列，占总序列数的75.56%,14个核心OTU的平均相对含量>1.0%，累计平均相对含量为43.14%，其平均相对含量的分布见图5。

由图4可知，样品JT1～JT6分别含有3 256、2 843、3 272、4 296、2 636和2 980个OTU，其中219个为核心OTU，占OTU总数的1.63%，但包含了217998条序列，占总序列数的75.56%,14个核心OTU的平均相对含量>1.0%，累计平均相对含量为43.14%，其平均相对含量的分布见图5。由图5可知，分别有5、3、3、2和1个OTU被鉴定隶属于Thermoleophilum、Lactobacillus、Pseudomonas、Bacillus和Lactococcus，累计平均相对含量分别为7.98%、15.58%、11.96%、2.27%和5.35%。平均相对含量>1.0%核心OTU相关性的热图见图6。

【参考文献】：
期刊论文
[1]恩施市3种泡辣椒样品中细菌多样性研究[J]. 尚雪娇,折米娜,邓长阳,廖华,赵楠,郭壮.  中国酿造. 2019(02)
[2]应用Illumina MiSeq高通量测序技术解析梅干菜中细菌多样性[J]. 尚雪娇,王玉荣,杨江,折米娜,赵慧君,郭壮.  中国酿造. 2019(01)
[3]退化和正常窖泥微生物多样性的比较分析[J]. 郭壮,葛东颖,尚雪娇,刘文汇,杨少勇,张振东.  食品工业科技. 2018(22)
[4]基于Miseq高通量测序技术的辣椒酱核心细菌类群研究[J]. 沈馨,王艳,代凯文,尚雪娇,董蕴,郭壮.  食品研究与开发. 2018(10)
[5]不同盐质量分数泡白菜发酵过程中乳酸菌群落结构的变化[J]. 申文熹,陈功,唐垚,汪冬冬,王勇,伍亚龙,张红梅,张伟,朱翔,李恒,张其圣.  食品科学. 2017(10)
[6]基于16S rRNA基因V3-V4区高通量测序分析东北自然发酵酸菜中细菌群落结构[J]. 李欣蔚,丛敏,武俊瑞,岳喜庆,乌日娜.  现代食品科技. 2017(02)
[7]中国泡菜乳杆菌种质资源调查[J]. 代富英,戴雨珂,王海娟,苏森森,杜昕,潘渠.  食品研究与开发. 2016(18)
[8]基于宏基因组分析四川泡菜母水作引子的泡菜发酵过程中细菌多样性变化[J]. 佟婷婷,田丰伟,王刚,刘小鸣,张灏,陈卫.  食品工业科技. 2015(21)
[9]腌制藠头发酵过程中乳酸菌的鉴定及生物学特性比较研究[J]. 汤水平,朱泽瑞,谢伟岸,任国谱.  食品工业科技. 2008(05)
[10]盐渍藠头发酵过程中乳酸菌的分离及特性研究[J]. 汤水平,张青燕,谢伟岸,任国谱.  中国酿造. 2007(08)

博士论文
[1]传统四川泡菜盐水乳酸菌多样性的研究[D]. 曹佳璐.中国农业大学 2017
[2]四川泡菜的主要特性及其成因分析[D]. 赵楠.江南大学 2017



本文编号：3378496