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花楸树小热激蛋白23.8基因(SpHSP23.8)克隆与表达分析

发布时间:2021-09-02 07:12
  以花楸树[Sorbus pohuashanensis(Hance) Hedl.]为研究对象,对其小热激蛋白23.8基因(SpHSP23.8)的克隆、组织特异性表达以及响应非生物胁迫的表达进行研究。结果表明:SpHSP23.8基因开放阅读框(ORF)包含648个碱基,编码215个氨基酸,其编码氨基酸序列的理论相对分子质量约23 800,该基因包含1个内含子。氨基酸序列比对结果显示:SpHSP23.8蛋白与枇杷[Eriobotrya japonica(Thunb.) Lindl.]EjsHSP6蛋白(登录号AKP06201.1)的同源性最高。根据SpHSP23.8蛋白与模式植物小热激蛋白氨基酸序列的聚类分析结果,推测SpHSP23.8蛋白定位于线粒体中。组织特异性表达结果显示:SpHSP23.8基因在茎中的相对表达量最高,其次为果实和根,而花中的相对表达量最低。高温、NaCl及干旱胁迫下,花楸树叶片中SpHSP23.8基因的相对表达量显著升高。随着高温胁迫时间的延长,SpHSP23.8基因的相对表达量呈先升高后降低的变化趋势,且在胁迫2.00 h达到峰值;在NaCl和干旱胁迫下,SpHSP... 

【文章来源】:植物资源与环境学报. 2020,29(05)北大核心CSCD

【文章页数】:12 页

【部分图文】:

花楸树小热激蛋白23.8基因(SpHSP23.8)克隆与表达分析


花楸树SpHSP23.8基因的PCR扩增图谱(A)和结构示意图(B)

氨基酸序列,花楸,残基,氨基酸


蛋白质二级结构的预测结果(图3)显示:花楸树SpHSP23.8蛋白中α螺旋包含50个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的23.26%;β转角包含9个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的4.19%;延伸链包含28个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的13.02%;无规卷曲包含128个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的59.53%。图3 花楸树SpHSP23.8蛋白的二级结构预测

花楸,器官,基因,树茎


由图8可以看出:花楸树茎中SpHSP23.8基因的相对表达量最高,显著(P<0.05)高于其他器官;果实和根中的相对表达量也较高;花中的相对表达量最低。由图9可以看出:随着高温胁迫时间的延长,花楸树叶片中SpHSP23.8基因的相对表达量呈先升高后降低的变化趋势。高温胁迫0.25 h,SpHSP23.8基因的相对表达量即显著升高,随后急剧升高;高温胁迫2.00 h,其相对表达量达到峰值,随后其相对表达量显著降低。

【参考文献】:
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本文编号:3378572

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