花楸树小热激蛋白23.8基因(SpHSP23.8)克隆与表达分析
发布时间:2021-09-02 07:12
以花楸树[Sorbus pohuashanensis(Hance) Hedl.]为研究对象,对其小热激蛋白23.8基因(SpHSP23.8)的克隆、组织特异性表达以及响应非生物胁迫的表达进行研究。结果表明:SpHSP23.8基因开放阅读框(ORF)包含648个碱基,编码215个氨基酸,其编码氨基酸序列的理论相对分子质量约23 800,该基因包含1个内含子。氨基酸序列比对结果显示:SpHSP23.8蛋白与枇杷[Eriobotrya japonica(Thunb.) Lindl.]EjsHSP6蛋白(登录号AKP06201.1)的同源性最高。根据SpHSP23.8蛋白与模式植物小热激蛋白氨基酸序列的聚类分析结果,推测SpHSP23.8蛋白定位于线粒体中。组织特异性表达结果显示:SpHSP23.8基因在茎中的相对表达量最高,其次为果实和根,而花中的相对表达量最低。高温、NaCl及干旱胁迫下,花楸树叶片中SpHSP23.8基因的相对表达量显著升高。随着高温胁迫时间的延长,SpHSP23.8基因的相对表达量呈先升高后降低的变化趋势,且在胁迫2.00 h达到峰值;在NaCl和干旱胁迫下,SpHSP...
【文章来源】:植物资源与环境学报. 2020,29(05)北大核心CSCD
【文章页数】:12 页
【部分图文】:
花楸树SpHSP23.8基因的PCR扩增图谱(A)和结构示意图(B)
蛋白质二级结构的预测结果(图3)显示:花楸树SpHSP23.8蛋白中α螺旋包含50个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的23.26%;β转角包含9个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的4.19%;延伸链包含28个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的13.02%;无规卷曲包含128个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的59.53%。图3 花楸树SpHSP23.8蛋白的二级结构预测
由图8可以看出:花楸树茎中SpHSP23.8基因的相对表达量最高,显著(P<0.05)高于其他器官;果实和根中的相对表达量也较高;花中的相对表达量最低。由图9可以看出:随着高温胁迫时间的延长,花楸树叶片中SpHSP23.8基因的相对表达量呈先升高后降低的变化趋势。高温胁迫0.25 h,SpHSP23.8基因的相对表达量即显著升高,随后急剧升高;高温胁迫2.00 h,其相对表达量达到峰值,随后其相对表达量显著降低。
【参考文献】:
期刊论文
[1]花楸树热激蛋白70基因的克隆及表达分析[J]. 刘聪聪,张泽,关雪莲,裴鑫,郑健. 分子植物育种. 2019(19)
[2]茶树小分子热激蛋白基因CsHSP22.4、CsHSP27.4、CsHSP17.5和CsHSP25.2的克隆与表达分析[J]. 陈江飞,高童,万思卿,张永恒,周天山,余有本,杨亚军,肖斌,王伟东. 园艺学报. 2018(06)
[3]巴西橡胶树sHSP23.8基因的克隆、生物信息学及表达分析[J]. 李德军,郭会娜,邓治,刘辉,陈江淑,姜达,夏立琼,夏志辉. 植物生理学报. 2015(11)
[4]哈尔滨市主栽花楸生物学特性研究[J]. 张妍妍,白卉,卢慧颖,曹炎,王艳敏. 安徽农业科学. 2014(36)
[5]茶树小分子量热激蛋白基因CsHSP17.2的克隆与表达分析[J]. 王明乐,朱旭君,王伟东,王炫清,林明露,黎星辉. 南京农业大学学报. 2015(03)
[6]不同种源花楸树幼苗越夏能力的比较[J]. 彭松,马淼,郑勇奇,张川红. 生态学杂志. 2014(02)
[7]长白山区三种观赏树木物候与生长节律研究[J]. 林玉梅,任军,杨轶囡,王晓娜,王超,刘亚军. 吉林林业科技. 2013(05)
[8]花楸树种源间表型性状的地理变异分析[J]. 郑健,胡增辉,郑勇奇,谢育常. 植物资源与环境学报. 2012(03)
[9]花楸树体细胞胚与合子胚的发生发育[J]. 杨玲,沈海龙. 林业科学. 2011(10)
[10]高温胁迫下花楸树幼苗的生理响应[J]. 彭松,郑勇奇,马淼,张川红,杜小娟,李涛,倪延生. 林业科学研究. 2011(05)
本文编号:3378572
【文章来源】:植物资源与环境学报. 2020,29(05)北大核心CSCD
【文章页数】:12 页
【部分图文】:
花楸树SpHSP23.8基因的PCR扩增图谱(A)和结构示意图(B)
蛋白质二级结构的预测结果(图3)显示:花楸树SpHSP23.8蛋白中α螺旋包含50个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的23.26%;β转角包含9个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的4.19%;延伸链包含28个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的13.02%;无规卷曲包含128个氨基酸残基,占总氨基酸残基数的59.53%。图3 花楸树SpHSP23.8蛋白的二级结构预测
由图8可以看出:花楸树茎中SpHSP23.8基因的相对表达量最高,显著(P<0.05)高于其他器官;果实和根中的相对表达量也较高;花中的相对表达量最低。由图9可以看出:随着高温胁迫时间的延长,花楸树叶片中SpHSP23.8基因的相对表达量呈先升高后降低的变化趋势。高温胁迫0.25 h,SpHSP23.8基因的相对表达量即显著升高,随后急剧升高;高温胁迫2.00 h,其相对表达量达到峰值,随后其相对表达量显著降低。
【参考文献】:
期刊论文
[1]花楸树热激蛋白70基因的克隆及表达分析[J]. 刘聪聪,张泽,关雪莲,裴鑫,郑健. 分子植物育种. 2019(19)
[2]茶树小分子热激蛋白基因CsHSP22.4、CsHSP27.4、CsHSP17.5和CsHSP25.2的克隆与表达分析[J]. 陈江飞,高童,万思卿,张永恒,周天山,余有本,杨亚军,肖斌,王伟东. 园艺学报. 2018(06)
[3]巴西橡胶树sHSP23.8基因的克隆、生物信息学及表达分析[J]. 李德军,郭会娜,邓治,刘辉,陈江淑,姜达,夏立琼,夏志辉. 植物生理学报. 2015(11)
[4]哈尔滨市主栽花楸生物学特性研究[J]. 张妍妍,白卉,卢慧颖,曹炎,王艳敏. 安徽农业科学. 2014(36)
[5]茶树小分子量热激蛋白基因CsHSP17.2的克隆与表达分析[J]. 王明乐,朱旭君,王伟东,王炫清,林明露,黎星辉. 南京农业大学学报. 2015(03)
[6]不同种源花楸树幼苗越夏能力的比较[J]. 彭松,马淼,郑勇奇,张川红. 生态学杂志. 2014(02)
[7]长白山区三种观赏树木物候与生长节律研究[J]. 林玉梅,任军,杨轶囡,王晓娜,王超,刘亚军. 吉林林业科技. 2013(05)
[8]花楸树种源间表型性状的地理变异分析[J]. 郑健,胡增辉,郑勇奇,谢育常. 植物资源与环境学报. 2012(03)
[9]花楸树体细胞胚与合子胚的发生发育[J]. 杨玲,沈海龙. 林业科学. 2011(10)
[10]高温胁迫下花楸树幼苗的生理响应[J]. 彭松,郑勇奇,马淼,张川红,杜小娟,李涛,倪延生. 林业科学研究. 2011(05)
本文编号:3378572
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