喹诺酮类耐药菌及耐药基因在罗非鱼和杂交鳢养殖中的分布特征
发布时间：2021-09-02 10:33
作为全球严峻的公共卫生问题之一,细菌耐药性问题近年来在水产养殖业中愈发受到重视,喹诺酮类药物是水产养殖中较为常用的抗菌药物之一,其耐药性问题也愈发凸显。罗非鱼和杂交鳢均是我国重要的特色淡水经济鱼类,且均有着养殖产量高、养殖密度大等特点。罗非鱼和杂交鳢（斑鳢Channa maculata♀×乌鳢Channa argus♂）养殖中喹诺酮类药物耐药现象也较为普遍。目前国内外对水产养殖动物（水产品）或养殖环境的细菌耐药性研究,多限于对某一种属菌株的耐药性研究,对反映鱼体或环境中细菌耐药情况不够全面。本研究旨在通过喹诺酮类药物（萘啶酸和恩诺沙星）筛选培养的方式,了解不同养殖阶段罗非鱼和杂交鳢的鱼肠道及养殖环境中喹诺酮类耐药菌的产生比例及耐药细菌的种类,同时对罗非鱼和杂交鳢养殖中质粒介导的喹诺酮类耐药基因进行类型与丰度分析,明确喹诺酮类耐药菌及耐药基因的分布特征,评估喹诺酮类耐药传播风险,从而为建立水产品耐药防控技术提供数据支撑,以及为抗菌药物的合理使用和保障水产品质量安全提供理论依据。采用细菌平板计数法计算罗非鱼和杂交鳢在不同养殖阶段鱼肠道及养殖环境的菌落数量,结果显示,在各养殖阶段可培养菌的菌...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
罗非鱼及其养殖环境样品OUTShannon稀释曲线
上海海洋大学硕士学位论文282.3杂交鳢及其养殖环境中细菌群结构特征2.3.1杂交鳢及其养殖环境样品的微生物多样性分析根据不同养殖阶段杂交鳢及其养殖环境样品的α多样性指数结果显示，OTU稀释曲线趋于平缓并达到平台期（图2-6），说明测序量足够且能对样品中微生物组成进行较为全面的展示。根据Shannon指数和Simpson指数结果可得，杂交鳢肠道的微生物多样性高于养殖环境样品。不同养殖阶段比较，肠道的微生物多样性，中间阶段>上市阶段、苗种阶段；池塘水样品，苗种阶段、上市阶段>养殖中期；底泥样品，苗种阶段>中间阶段>上市阶段。图2-6杂交鳢及其养殖环境样品OUTShannon稀释曲线Fig.2-6Rarefactioncurvesbythehybridsnakeheadintestineandenvironmentalsamples注：CH表示杂交鳢；X、Y、Z分别表示为苗种阶段、养殖中期和上市阶段；F、W、S分别表示为杂交鳢肠道、池塘水和池塘底泥样品；O表示为无药物筛选；A、B、C表示为三个不同采样点Note:CHrepresentshybridsnakehead;X,Y,andZrepresentthefingerlingstage,juvenilestageandadultstages,respectively;F,W,andSrepresentthehybridsnakeheadintestine,pondwater,andpondsedimentsamples;Orepresentsdrug-freeselectedmedium;A,B,Crepresentthreedifferentsamplingsites
上海海洋大学硕士学位论文44图3-1罗非鱼不同养殖阶段各类样品PMQR基因绝对丰度热图Fig.3-1HeatmapofabsoluteabundanceofPMQRgenesinvarioussamplesatdifferentculturestagesoftilapia注：T表示罗非鱼；X、Y、Z分别表示为苗种阶段、养殖中期和上市阶段；F、S、W分别表示为鱼肠道、池塘水和池塘底泥样品；A、B、C表示为三个不同采样点;单位：lg（copies·g-1或copies·mL-1）。Note:Trepresentstilapia;X,Y,andZrepresentthefingerlingstage,juvenilestageandadultstages,respectively;F,W,andSrepresentthehybridsnakeheadintestine,pondwater,andpondsedimentsamples;A,B,Crepresentethreedifferentsamplingsites;Unit:lg（copies·g-1orcopies·mL-1）.
【参考文献】：
期刊论文
[1]类志贺邻单胞菌的检测方法概述[J]. 陈美群,扎西拉姆,潘瑛子. 西藏农业科技. 2019(04)
[2]广东主要水产养殖地区气单胞菌耐药状况的调查分析[J]. 邓玉婷,谭爱萍,张瑞泉,赵飞,姜兰. 南方农业学报. 2019(11)
[3]豆粕对乌鳢肠道菌群组成及微生物氨基酸代谢酶活性的影响[J]. 朱锦裕,韩蓓,卜弘毅,胡俊涛,张鑫,刘令军,苗淑彦. 水产学报. 2020(04)
[4]自然感染无乳链球菌罗非鱼的比较病理学及毒力基因谱分析[J]. 谢云丹,冯娟,刘婵,邓益琴,王江勇,苏友禄. 南方水产科学. 2019(02)
[5]罗非鱼水产品中的喹诺酮类药物耐药菌和耐药基因检测分析[J]. 郭学中,张瑞泉,姜兰,谭爱萍,邓玉婷,李金祥,赵飞,刘付翠,何山. 中国水产科学. 2018(05)
[6]肠道感染气单胞菌、邻单胞菌的流行病学分布与耐药性分析[J]. 李世荣,蒋晓飞. 检验医学. 2018(08)
[7]不同养殖阶段罗非鱼肠道微生物多样性的动态分析[J]. 佟延南,李芳远,李忠琴,赵光军,李高俊,王德强. 南方农业学报. 2018(07)
[8]应用高通量测序技术分析大菱鲆幼鱼肠道及其养殖环境的微生物群落结构[J]. 吴欢欢,王伟继,吕丁,胡玉龙,孔杰. 渔业科学进展. 2019(04)
[9]2008～2017年间北京进出口水产品中副溶血性弧菌耐药性分析[J]. 付溥博,张西萌,马丹,徐蕾蕊,魏海燕,魏咏新,曾静. 食品安全质量检测学报. 2018(14)
[10]食品动物养殖环境中细菌耐药性研究进展[J]. 史晓敏,王少林. 生物工程学报. 2018(08)
博士论文
[1]aac（6’）-Ib-cr基因对氟喹诺酮类药物耐药的作用研究[D]. 张文慧.华南农业大学 2016
硕士论文
[1]海水养殖源弧菌耐药性调查与外排泵抑制剂对其耐药性的影响[D]. 李健.上海海洋大学 2017
[2]中国罗非鱼源无乳链球菌流行特征及耐药性研究[D]. 袁伟.上海海洋大学 2017
[3]鸭-鱼混养场养殖环境抗菌药物耐药基因污染及微生物群落特征[D]. 钟晓霞.华南农业大学 2016
[4]江苏省沿海地区水产养殖主要致病菌耐药性研究[D]. 乔毅.上海海洋大学 2015
[5]四川地区斑点叉尾鮰源维氏气单胞菌的耐药性以及耐药基因检测分析[D]. 赵敏.四川农业大学 2013
本文编号：3378852
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
罗非鱼及其养殖环境样品OUTShannon稀释曲线
上海海洋大学硕士学位论文282.3杂交鳢及其养殖环境中细菌群结构特征2.3.1杂交鳢及其养殖环境样品的微生物多样性分析根据不同养殖阶段杂交鳢及其养殖环境样品的α多样性指数结果显示，OTU稀释曲线趋于平缓并达到平台期（图2-6），说明测序量足够且能对样品中微生物组成进行较为全面的展示。根据Shannon指数和Simpson指数结果可得，杂交鳢肠道的微生物多样性高于养殖环境样品。不同养殖阶段比较，肠道的微生物多样性，中间阶段>上市阶段、苗种阶段；池塘水样品，苗种阶段、上市阶段>养殖中期；底泥样品，苗种阶段>中间阶段>上市阶段。图2-6杂交鳢及其养殖环境样品OUTShannon稀释曲线Fig.2-6Rarefactioncurvesbythehybridsnakeheadintestineandenvironmentalsamples注：CH表示杂交鳢；X、Y、Z分别表示为苗种阶段、养殖中期和上市阶段；F、W、S分别表示为杂交鳢肠道、池塘水和池塘底泥样品；O表示为无药物筛选；A、B、C表示为三个不同采样点Note:CHrepresentshybridsnakehead;X,Y,andZrepresentthefingerlingstage,juvenilestageandadultstages,respectively;F,W,andSrepresentthehybridsnakeheadintestine,pondwater,andpondsedimentsamples;Orepresentsdrug-freeselectedmedium;A,B,Crepresentthreedifferentsamplingsites
上海海洋大学硕士学位论文44图3-1罗非鱼不同养殖阶段各类样品PMQR基因绝对丰度热图Fig.3-1HeatmapofabsoluteabundanceofPMQRgenesinvarioussamplesatdifferentculturestagesoftilapia注：T表示罗非鱼；X、Y、Z分别表示为苗种阶段、养殖中期和上市阶段；F、S、W分别表示为鱼肠道、池塘水和池塘底泥样品；A、B、C表示为三个不同采样点;单位：lg（copies·g-1或copies·mL-1）。Note:Trepresentstilapia;X,Y,andZrepresentthefingerlingstage,juvenilestageandadultstages,respectively;F,W,andSrepresentthehybridsnakeheadintestine,pondwater,andpondsedimentsamples;A,B,Crepresentethreedifferentsamplingsites;Unit:lg（copies·g-1orcopies·mL-1）.
【参考文献】：
期刊论文
[1]类志贺邻单胞菌的检测方法概述[J]. 陈美群,扎西拉姆,潘瑛子. 西藏农业科技. 2019(04)
[2]广东主要水产养殖地区气单胞菌耐药状况的调查分析[J]. 邓玉婷,谭爱萍,张瑞泉,赵飞,姜兰. 南方农业学报. 2019(11)
[3]豆粕对乌鳢肠道菌群组成及微生物氨基酸代谢酶活性的影响[J]. 朱锦裕,韩蓓,卜弘毅,胡俊涛,张鑫,刘令军,苗淑彦. 水产学报. 2020(04)
[4]自然感染无乳链球菌罗非鱼的比较病理学及毒力基因谱分析[J]. 谢云丹,冯娟,刘婵,邓益琴,王江勇,苏友禄. 南方水产科学. 2019(02)
[5]罗非鱼水产品中的喹诺酮类药物耐药菌和耐药基因检测分析[J]. 郭学中,张瑞泉,姜兰,谭爱萍,邓玉婷,李金祥,赵飞,刘付翠,何山. 中国水产科学. 2018(05)
[6]肠道感染气单胞菌、邻单胞菌的流行病学分布与耐药性分析[J]. 李世荣,蒋晓飞. 检验医学. 2018(08)
[7]不同养殖阶段罗非鱼肠道微生物多样性的动态分析[J]. 佟延南,李芳远,李忠琴,赵光军,李高俊,王德强. 南方农业学报. 2018(07)
[8]应用高通量测序技术分析大菱鲆幼鱼肠道及其养殖环境的微生物群落结构[J]. 吴欢欢,王伟继,吕丁,胡玉龙,孔杰. 渔业科学进展. 2019(04)
[9]2008～2017年间北京进出口水产品中副溶血性弧菌耐药性分析[J]. 付溥博,张西萌,马丹,徐蕾蕊,魏海燕,魏咏新,曾静. 食品安全质量检测学报. 2018(14)
[10]食品动物养殖环境中细菌耐药性研究进展[J]. 史晓敏,王少林. 生物工程学报. 2018(08)
博士论文
[1]aac（6’）-Ib-cr基因对氟喹诺酮类药物耐药的作用研究[D]. 张文慧.华南农业大学 2016
硕士论文
[1]海水养殖源弧菌耐药性调查与外排泵抑制剂对其耐药性的影响[D]. 李健.上海海洋大学 2017
[2]中国罗非鱼源无乳链球菌流行特征及耐药性研究[D]. 袁伟.上海海洋大学 2017
[3]鸭-鱼混养场养殖环境抗菌药物耐药基因污染及微生物群落特征[D]. 钟晓霞.华南农业大学 2016
[4]江苏省沿海地区水产养殖主要致病菌耐药性研究[D]. 乔毅.上海海洋大学 2015
[5]四川地区斑点叉尾鮰源维氏气单胞菌的耐药性以及耐药基因检测分析[D]. 赵敏.四川农业大学 2013
本文编号：3378852
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