基于放射组学筛选的差异基因对非小细胞肺癌免疫检查点抑制剂疗效预测指标的探索
发布时间:2021-09-05 23:45
目的肺癌是全球所有恶性肿瘤中发病率及死亡率非常高的疾病,其中非小细胞肺癌(NSCLC)是其最常见的组织学亚型。针对PD-(L)1的检查点抑制剂提高了晚期NSCLC患者的长期生存率,然而,PD-1/PD-L1抗体单一疗法只对一小部分患者少部分患者有益,而且现在唯一在临床批准应用的PD-L1表达水平对PD-1/PD-L1免疫检查点抑制剂的疗效预测并不十分理想,因此,需要特异性和检出率较高的生物标志物来预测PD-1/PD-L1免疫检查点抑制剂的疗效。放射组学是从CT等影像图像中提取高通量影像学特征,利用计算机分析技术充分挖掘医学影像中隐藏的信息,分析疾病不同临床表型,如基因分型、疾病诊断、治疗疗效和临床结局等。相对于病理活检的有创、局限、取样误差等多方面的不足,放射组学能通过非侵入性的方法全面分析病灶信息,帮助临床制定更好的诊治方案,从而实现精准医疗。近几年,随着放射组学的快速发展,其在预测免疫检查的抑制剂疗效方面已有一些研究进展。本研究应用放射组学和基因组学相结合的方法,对非小细胞肺癌患者术前CT图像进行三维肿瘤立体切割及放射组学特征提取,根据放射组学特征进行聚类,分析不同影像学亚型之间的...
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:53 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
原发病灶的三维立体图像
第3章结果14达水平均与CD8+T淋巴细胞浸润情况呈正相关(cor>0),CYP21A2表达水平与与CD8+T淋巴细胞浸润情况呈负相关(cor<0),在肺腺癌中CCL19是与CD8+T淋巴细胞浸润情况相关性最强的正相关基因(cor=0.3346,P<0.0001)(见图3.2)。在肺鳞癌中,共有18个差异基因与CD8+T淋巴细胞浸润情况相关性有统计学意义(P<0.05)(见表3.4),FRZB、ITGA8、ADH1B、MS4A1、MFAP4、SFTPC、PTGDS、CCL19、DARC、CR2、SCGB3A1、CCL15、CCL14、CD79A、INMT、C4BPA表达水平与与CD8+T淋巴细胞浸润情况呈正相关(cor>0),SLC2A1、IL20RB表达水平均与CD8+T淋巴细胞浸润情况呈负相关(cor<0),肺鳞癌中CCL19是与CD8+T淋巴细胞浸润情况相关性最强的正相关基因(cor=0.4224,P<0.0001)(见图3.2)。CCL19在肺腺癌(cor=0.3346,P<0.0001)及肺鳞癌(cor=0.4224,P<0.0001)中与CD8+T淋巴细胞浸润的相关性均为中等程度正相关。图3.2CCL19在肺腺癌与肺鳞癌中与CD8+T淋巴细胞浸润的相关性
第3章结果163.5差异基因的蛋白-蛋白相互作用网络建设及功能分析STRING分析发现了其中的关键节点基因之一正是CCL19(见图3.3),GO分析包括3个独立部分:生物过程(biologicalprocess,BP)、细胞组成(cellcularcomponent,CC)和分子功能(molecularfunction,MF),高表达差异基因的的功能富集分析发现,差异基因主要参与的生物过程主要包括免疫反应、B细胞增殖、淋巴细胞趋化性、淋巴细胞活化等,细胞成分分析发现相关分子集中在细胞外区域,涉及的分子功能有细胞因子活性、趋化因子活性、CCR趋化因子受体结合等。图3.3STRING蛋白质互作网络模式图
【参考文献】:
期刊论文
[1]非小细胞肺癌免疫治疗预测标志物研究进展[J]. 权阳,赵征,姚俊涛. 肿瘤学杂志. 2019(11)
[2]K-Means聚类算法研究综述[J]. 杨俊闯,赵超. 计算机工程与应用. 2019(23)
[3]CCR7在肿瘤中的研究应用进展[J]. 郑炎焱,林一均,缪一艇,杨晓国,谢璟,姚琼. 浙江医学. 2019(04)
[4]免疫检查点抑制剂治疗胰腺癌的进展[J]. 田宏,金锷,郭晓钟,李宏宇. 中华胰腺病杂志. 2018 (06)
[5]聚类算法研究[J]. 孙吉贵,刘杰,赵连宇. 软件学报. 2008(01)
[6]数据挖掘中的聚类算法综述[J]. 贺玲,吴玲达,蔡益朝. 计算机应用研究. 2007(01)
[7]基于MATLAB的自组织竞争神经网络聚类研究[J]. 汪海波,张海臣,段雪丽. 邢台职业技术学院学报. 2005(01)
本文编号:3386302
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:53 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
原发病灶的三维立体图像
第3章结果14达水平均与CD8+T淋巴细胞浸润情况呈正相关(cor>0),CYP21A2表达水平与与CD8+T淋巴细胞浸润情况呈负相关(cor<0),在肺腺癌中CCL19是与CD8+T淋巴细胞浸润情况相关性最强的正相关基因(cor=0.3346,P<0.0001)(见图3.2)。在肺鳞癌中,共有18个差异基因与CD8+T淋巴细胞浸润情况相关性有统计学意义(P<0.05)(见表3.4),FRZB、ITGA8、ADH1B、MS4A1、MFAP4、SFTPC、PTGDS、CCL19、DARC、CR2、SCGB3A1、CCL15、CCL14、CD79A、INMT、C4BPA表达水平与与CD8+T淋巴细胞浸润情况呈正相关(cor>0),SLC2A1、IL20RB表达水平均与CD8+T淋巴细胞浸润情况呈负相关(cor<0),肺鳞癌中CCL19是与CD8+T淋巴细胞浸润情况相关性最强的正相关基因(cor=0.4224,P<0.0001)(见图3.2)。CCL19在肺腺癌(cor=0.3346,P<0.0001)及肺鳞癌(cor=0.4224,P<0.0001)中与CD8+T淋巴细胞浸润的相关性均为中等程度正相关。图3.2CCL19在肺腺癌与肺鳞癌中与CD8+T淋巴细胞浸润的相关性
第3章结果163.5差异基因的蛋白-蛋白相互作用网络建设及功能分析STRING分析发现了其中的关键节点基因之一正是CCL19(见图3.3),GO分析包括3个独立部分:生物过程(biologicalprocess,BP)、细胞组成(cellcularcomponent,CC)和分子功能(molecularfunction,MF),高表达差异基因的的功能富集分析发现,差异基因主要参与的生物过程主要包括免疫反应、B细胞增殖、淋巴细胞趋化性、淋巴细胞活化等,细胞成分分析发现相关分子集中在细胞外区域,涉及的分子功能有细胞因子活性、趋化因子活性、CCR趋化因子受体结合等。图3.3STRING蛋白质互作网络模式图
【参考文献】:
期刊论文
[1]非小细胞肺癌免疫治疗预测标志物研究进展[J]. 权阳,赵征,姚俊涛. 肿瘤学杂志. 2019(11)
[2]K-Means聚类算法研究综述[J]. 杨俊闯,赵超. 计算机工程与应用. 2019(23)
[3]CCR7在肿瘤中的研究应用进展[J]. 郑炎焱,林一均,缪一艇,杨晓国,谢璟,姚琼. 浙江医学. 2019(04)
[4]免疫检查点抑制剂治疗胰腺癌的进展[J]. 田宏,金锷,郭晓钟,李宏宇. 中华胰腺病杂志. 2018 (06)
[5]聚类算法研究[J]. 孙吉贵,刘杰,赵连宇. 软件学报. 2008(01)
[6]数据挖掘中的聚类算法综述[J]. 贺玲,吴玲达,蔡益朝. 计算机应用研究. 2007(01)
[7]基于MATLAB的自组织竞争神经网络聚类研究[J]. 汪海波,张海臣,段雪丽. 邢台职业技术学院学报. 2005(01)
本文编号:3386302
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3386302.html
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