Pb 2+ 胁迫下香蒲差异表达基因的分析及克隆

发布时间：2021-09-12 17:00

　　香蒲（Typha orientalis Presl）为多年生草本植物,具有发达的根状茎,可形成地下茎网,是一种新型的Pb富集型植物,但目前有关香蒲对Pb2+的耐性机理尚未明确。因此,本文选取香蒲为实验材料,采用Hoagland营养液水培法,在前期实验的基础上,进行0.1 mmol·L-1、0.25 mmol·L-lPb2+处理,通过转录组测序研究不同Pb2+处理组香蒲根部的差异表达基因,分析与Pb2+耐性相关的目的基因;利用qRT-PCR方法验证了 13个差异表达基因的表达量;通过RACE技术克隆获得与Pb耐性相关的谷胱甘肽S转移酶基因（ToGST）全长,并对该基因进行了生物信息学分析;研究其它非生物胁迫（干旱和盐胁迫）下ToGST基因表达量的变化,以期阐明香蒲对Pb2+的耐性机理,并为利用香蒲进行环境中的Pb2+污染修复提供理论依据。主要研究结果如下:1.转录组测序:通过对对照组以及0.1mmol·L-1、0.25mmol·L-1Pb2+处理组的根部样品进行转录组测序,拼接组装后得到84,530条Unigene,平均长度是806.04 nt,N50长度为1,422 nt。经过Unig... 

【文章来源】：扬州大学江苏省

【文章页数】：117 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２．１?Ｕｎｉｇｅｎｅ长度分布图??Ｆｉ２．１?Ｈｉｓｔｏｒａｍ?ｏｆ?ｌｅｎｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｅ?ｏｆ?ｕｎｉｅｎｅ??

据库中有重要位点，并且有２４６７７Ｕｎｉｇｅｎｅｓ至少在ＧＯ?ｔｅｒｍｓ中得到注释。??２．３．４基因表达分析??差异表达基因数目统计如下图２．２。火山图（Ｖｏｌｃａｎｏ?Ｐｌｏｔ）可以直观地展现??所有基因的ＦＤＲ与Ｆｏｌｄ?Ｃｈａｎｇｅ之间的关系（图２．３），绿色和红色的点代表有??显著性表达差异的基因

２．３．５差异基因表达水平聚类分析??对筛选出的差异表达基因做层次聚类分析，差异基因聚类分析可以快速的选??择共表达基因。Ｈｅａｔｍａｐ如图２．５所示，颜色从红到蓝表示表达水平从低到高，??红色代表高表达基因，绿色代表低表达基因，从结果可以看出，Ｔ０３表达模式变??化显著，Ｔ０１与Ｔ０２转录本的表达模式相似。??

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
[1]玉米苗期根系响应重金属铅胁迫的基因表达调控研究[D]. 张永中.四川农业大学 2015

硕士论文
[1]香蒲对铅(Pb2+)胁迫的生理响应及差异性基因筛选研究[D]. 徐义昆.扬州大学 2016
[2]RACE初步克隆胡麻β-酮脂酰-CoA合酶基因以及胡麻再生体系建立的研究[D]. 张彦萍.兰州大学 2009
[3]RACE技术克隆大菱鲆蛋白磷酸酶1催化亚基基因和金属蛋白酶基因及其序列分析[D]. 亓飞.中国海洋大学 2006



本文编号：3394604