结缕草转录因子基因ZjDREB 1.4功能研究
发布时间:2021-09-19 03:40
高温、低温、干旱和高盐等非生物胁迫是影响草坪种植和观赏性的重要因素,因而非生物胁迫抗性及其机制一直是草坪草研究的重要内容。结缕草属(Zoysia Willd.)是我国重点开发的暖季型草种之一,具有抗旱、耐热、耐盐碱、抗病等特点,其抗逆性的分子机制有待深入研究。植物转录因子DREB(Dehydration responsive element binding)与多种非生物胁迫响应密切相关,通过激活多个抗逆相关基因的表达使植物获得抗逆能力。结缕草DREB转录因子的功能尚未有系统的研究报道。本研究以日本结缕草’Meyer’(Zoysia japonica Steud.)为材料对DREB类转录因子基因ZjDREB1.4开展研究,主要研究结果如下:(1)ZjDREB1.4基因编码区长681 bp,无内含子,推测编码226个氨基酸,含有一个AP2结构域,其上下游具有DREB转录因子A-1亚组的典型特征序列。在禾本科植物DREB1同源基因的系统进化树中,ZjDREB1.4基因属于在暖季型植物中得到选择性扩张的Ⅲa分支。根据qRT-PCR分析结果,ZjDREB1.4基因的表达受高温、低温和干旱胁迫诱导...
【文章来源】:中央民族大学北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】:88 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-1研究技术流程图??Fig.?1-1?The?flowthart?of?research??
M:?DL2000Marker;a:基因扩增结果,1:模板为cDNA;2:模板为基因组DNA;?b:菌液PCR结果:??\-4:?ZjDREBU?基面??结缕草冷基因编码区全长为681个碱基,推测编码226个氨基酸(图2-2),??其中含量最高的两种氨基酸分别是甘氨酸(Gly?35.4%)和半胱氨酸(Cys?35.1%),蛋白??分子式为Ci90gH312iN681〇78〇S239,相对分子量大小为24.6kDa,等电点为4.9,不稳定指数为??50.68?(>40),总平均疏水指数为0.907,推测为不稳定的疏水性蛋白。NCBI保守结构域??在线预测结果表明,该基因编码的蛋白有一个保守的AP2结构域(E-ValueiSASe-11),在??其上、下游含有DREB1类基因的特征性序列PKKPAGRTKFRETRH和DSAW,因而属于??中的A-1亚组。??17??
?1G0?150??图2-3?ZjDREB1.4蛋白二级结构预测??Fig.?2-3?The?predicted?secondary?structure?of?ZjDREB?1.4??横坐标代表氨基酸所在位置;长竖线为a-螺旋,中长竖线为0-折叠片,短竖线为无规则卷曲。??C?端C-terminal?V???j?N?端N-terminai??图2-4?ZjDREB1.4蛋白三级结构模型预测??Fig.?2-4?The?predicted?tertiary?structure?of?ZjDREB1.4??虚线框内为AP2结构域??3.2?ZjDREB1.4的系统进化分析??为进一步研究ZyT)狀5/.?/在DREB1家族中的系统进化地位,按照DREB1组的分类特??征[93】,筛选出来自于玉米、水稻、高梁、小米、小麦、大麦和短柄草等7种植物(表2-2)??的DREB1同源基因的氨基酸序列,利用MEGA7.0软件对包括基因在内的91??个基因的全长序列构建系统进化树。如图2-5所示,禾本科植物中的DREB1同源物被分为??11个单系分支,10个分支与Badawi文章中的分类一致,其中水稻的和??CWM五5A7基因与玉米ZmD狀57.6、高粱劭C5F9基因共同组成第H个分支,名为CBF??V。狀5/.*/基因被分配到DREB1家族的Ilia分支中
本文编号:3400939
【文章来源】:中央民族大学北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】:88 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-1研究技术流程图??Fig.?1-1?The?flowthart?of?research??
M:?DL2000Marker;a:基因扩增结果,1:模板为cDNA;2:模板为基因组DNA;?b:菌液PCR结果:??\-4:?ZjDREBU?基面??结缕草冷基因编码区全长为681个碱基,推测编码226个氨基酸(图2-2),??其中含量最高的两种氨基酸分别是甘氨酸(Gly?35.4%)和半胱氨酸(Cys?35.1%),蛋白??分子式为Ci90gH312iN681〇78〇S239,相对分子量大小为24.6kDa,等电点为4.9,不稳定指数为??50.68?(>40),总平均疏水指数为0.907,推测为不稳定的疏水性蛋白。NCBI保守结构域??在线预测结果表明,该基因编码的蛋白有一个保守的AP2结构域(E-ValueiSASe-11),在??其上、下游含有DREB1类基因的特征性序列PKKPAGRTKFRETRH和DSAW,因而属于??中的A-1亚组。??17??
?1G0?150??图2-3?ZjDREB1.4蛋白二级结构预测??Fig.?2-3?The?predicted?secondary?structure?of?ZjDREB?1.4??横坐标代表氨基酸所在位置;长竖线为a-螺旋,中长竖线为0-折叠片,短竖线为无规则卷曲。??C?端C-terminal?V???j?N?端N-terminai??图2-4?ZjDREB1.4蛋白三级结构模型预测??Fig.?2-4?The?predicted?tertiary?structure?of?ZjDREB1.4??虚线框内为AP2结构域??3.2?ZjDREB1.4的系统进化分析??为进一步研究ZyT)狀5/.?/在DREB1家族中的系统进化地位,按照DREB1组的分类特??征[93】,筛选出来自于玉米、水稻、高梁、小米、小麦、大麦和短柄草等7种植物(表2-2)??的DREB1同源基因的氨基酸序列,利用MEGA7.0软件对包括基因在内的91??个基因的全长序列构建系统进化树。如图2-5所示,禾本科植物中的DREB1同源物被分为??11个单系分支,10个分支与Badawi文章中的分类一致,其中水稻的和??CWM五5A7基因与玉米ZmD狀57.6、高粱劭C5F9基因共同组成第H个分支,名为CBF??V。狀5/.*/基因被分配到DREB1家族的Ilia分支中
本文编号:3400939
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