辣椒PSY基因家族分析及CaPSY1功能研究
发布时间:2021-09-19 15:39
八氢番茄红素合成酶(PSY,phytoene synthase)是类胡萝卜素合成途径的第一个限制酶,在果实发育中起着重要的作用。然而,CaPSY基因在果实成熟过程中基因组范围内的表达模式还不清楚。本研究中,我们对辣椒中PSY基因家族进行了鉴定,并用生物信息学方法对PSY基因家族进行了分析,并对其与非生物胁迫之间的关系进行了研究。为探究CaPSY1基因在辣椒果实中的作用,我们构建了GFP荧光定位载体分析其定位情况;我们还构建了VIGS-CaPSY1沉默载体,在辣椒转色期沉默果实CaPSY1基因,分析其表型及相关基因表达量;我们还构建了过表达载体,在拟南芥中遗传转化。结果如下:(1)通过已公布的辣椒遵辣1号基因组数据库,运用Pfam数据库和Blast等技术,我们在辣椒中共鉴定出3个同源PSY基因,对其命名CaPSY1、CaPSY2.a和CaPSY2.b。通过生物信息学分析,我们发现3个PSY基因中都只含有5个内含子,并且我们在其蛋白序列中发现8个motif,PSY基因的活性位点DXXXD只存在于motif 2和motif 3中。在对单子叶和双子叶植物中PSY基因进化关系的研究中,我们发现C...
【文章来源】:郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】:80 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
类胡萝卜素合成途径(引自[24]
员与拟南芥 PSY 基因氨基酸序列比对发现所有的基因都含有 DXXXD 保守结构域,并且该结构域高度保守(图 2.1)。所以辣椒 PSY 基因可能与拟南芥 PSY 基因行驶相同的功能。
图 2.2 辣椒 PSY 基因染色体定位igure 2.2 Chromosome localization of pepper PS家族结构分析构和基序分布分析能更好理解它们结构构是相似的。PSY 蛋白中鉴定出来 8 PSY1 和 CaPSY2.b,预测活性位点 DXX位点(图 2.3)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]芒果八氢番茄红素合成酶基因PSY的结构分析及功能预测[J]. 黄建峰,秦于玲,高爱平,赵志常,党志国,罗睿雄,陈业渊. 西南农业学报. 2017(03)
[2]辣椒CaWRKY13基因克隆及非生物胁迫下表达分析[J]. 魏小春,姚秋菊,原玉香,赵艳艳,王志勇,姜俊,蒋武生,张晓伟. 分子植物育种. 2016(10)
[3]基于绿色荧光蛋白瞬时表达的植物亚细胞定位方法[J]. 于一帆,朱小彬,葛会敏,陈云. 江苏农业科学. 2014(12)
[4]几种经济植物UFGT基因的生物信息学分析[J]. 付海辉,辛培尧,许玉兰,刘岩,韦援教,董娇,曹有龙,周军. 基因组学与应用生物学. 2011(01)
[5]Tissue differential expression of lycopene β-cyclase gene in papaya[J]. RachelLSkelton,RajeswariSrinivasan,RichardManshardt,Paul H Moore,Ray Ming. Cell Research. 2006(08)
本文编号:3401883
【文章来源】:郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】:80 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
类胡萝卜素合成途径(引自[24]
员与拟南芥 PSY 基因氨基酸序列比对发现所有的基因都含有 DXXXD 保守结构域,并且该结构域高度保守(图 2.1)。所以辣椒 PSY 基因可能与拟南芥 PSY 基因行驶相同的功能。
图 2.2 辣椒 PSY 基因染色体定位igure 2.2 Chromosome localization of pepper PS家族结构分析构和基序分布分析能更好理解它们结构构是相似的。PSY 蛋白中鉴定出来 8 PSY1 和 CaPSY2.b,预测活性位点 DXX位点(图 2.3)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]芒果八氢番茄红素合成酶基因PSY的结构分析及功能预测[J]. 黄建峰,秦于玲,高爱平,赵志常,党志国,罗睿雄,陈业渊. 西南农业学报. 2017(03)
[2]辣椒CaWRKY13基因克隆及非生物胁迫下表达分析[J]. 魏小春,姚秋菊,原玉香,赵艳艳,王志勇,姜俊,蒋武生,张晓伟. 分子植物育种. 2016(10)
[3]基于绿色荧光蛋白瞬时表达的植物亚细胞定位方法[J]. 于一帆,朱小彬,葛会敏,陈云. 江苏农业科学. 2014(12)
[4]几种经济植物UFGT基因的生物信息学分析[J]. 付海辉,辛培尧,许玉兰,刘岩,韦援教,董娇,曹有龙,周军. 基因组学与应用生物学. 2011(01)
[5]Tissue differential expression of lycopene β-cyclase gene in papaya[J]. RachelLSkelton,RajeswariSrinivasan,RichardManshardt,Paul H Moore,Ray Ming. Cell Research. 2006(08)
本文编号:3401883
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3401883.html
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