2010年-2015年重庆地区手足口病患儿肠道病毒71型VP1基因序列分析
发布时间:2021-09-25 12:21
目的:了解重庆地区近6年来手足口病患儿肠道病毒71型(EV71)VP1基因特征,并为肠道病毒71型VP1基因相关研究提供依据。方法:收集2011年至2015年手足口病住院患儿粪便标本,检测病原类型,利用巢式PCR方法,使用特异性诊断引物进行肠道病毒71型VP1基因片段的扩增,得到VP1基因全长段并测序。通过随机抽样的方法,共选择出116株病毒分离株,进行同源性分析,构建系统进化树,用疫苗株FY7VP5为对照比较重庆地区肠道病毒71型VP1氨基酸变异情况。结果:1.2011年至2015年重庆地区病毒分离株全为C4a亚型,与Genebank上下载的C4a亚型代表株同源性高,且同时存在两个大的流行分支,其中一个大流行分支中还存在4个小流行分支。重庆地区EV71病毒存在时间聚集性,每年EV71流行分布也存在差异。2.3株EV71疫苗株FY7VP5、H07、FY-23K-B与该地区病毒分离株同源性高。3.以疫苗株FY7VP5为对照病毒株,共39株病毒分离株发现存在氨基酸变异,共发现15个氨基酸变异位点。结论:基因序列研究分析表明,2010年到2015年重庆地区EV71病毒分离株均属于C4a亚型,...
【文章来源】:重庆医科大学重庆市
【文章页数】:44 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
病毒检测流程
本文编号:3409729
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