利用酵母双杂交技术筛选与马铃薯StNAC262互作的功能基因
发布时间：2021-09-29 23:49
NAC命名来源于矮牵牛（Petunia hybrida）NO APICAL MERISTEM（NAM）基因和拟南芥（Arabidopsis thaliana）ATAF1/ATAF2基因和CUP-SHAPED COTYLEDON2（CUC2）基因。NAC蛋白质是植物特异性转录因子（Transcription factors,TF）最大家族组成之一,大多数NAC TF在植物发育和应激反应中起着重要作用。研究发现在转基因植物中过表达时,许多非生物胁迫上调的NAC蛋白可促进根生长或改变根结构,表明NAC基因在渗透胁迫下有调节根生长和改变根结构的作用。这些发现有助于解析由NAC蛋白控制的信号传导和转录重编程的复杂机制。但有关NAC转录因子靶基因的知识仍然有限。因此,本研究利用与NAC的功能蛋白相互作用的宿主因子为突破口,利用酵母双杂交技术筛选与之互作的宿主因子,以期研究NAC基因对马铃薯干旱胁迫响应的影响,更好的了解NAC的生物学特性、抗旱机制,从而为进一步研究NAC基因在马铃薯干旱胁迫中的作用提供一定的理论基础。取得的主要研究结果如下:1.StNAC262的生物信息学分析预测表明,St NAC...
【文章来源】：甘肃农业大学甘肃省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
NAC蛋白的结构和调控Fig.1.1StructureandregulationofNACproteins
气孔保卫细胞中表达，在不影响光合速率的前提下使气孔关闭，这使得植株性大大提高，也不会影响产量[32]。SNAC2 在水稻中可以抗旱、抗盐、抗冷械损伤和 ABA，且不会影响萌发率和生长率。受高盐和 ABA 胁迫诱导的AC1 为海茄冬 NAC 蛋白与番茄和马铃薯中 NAC 高度同源。花生中的AC2/3 与拟南芥 RD26 同源，它们都受 ABA、GA3、低温的诱导表达。SINACINAM1 是在番茄中发现的的盐敏感 NAC 基因，主要在花和成熟果实中表达萄中发现的 VpNAC1 是 NAC 转录因子，可以提高对白粉病菌和烟草黑胫病抵抗能力。已发现的 NAC 基因大多对生物胁迫和非生物胁迫都有响应，拟在盐溶液处理下，仅在根中就发现了 33 个 NAC 基因受到影响[59]，功能明只占很少一部分，大多数基因研究尚处于基因克隆、结构鉴定和表达分析层，在不同的植物中分离鉴定 NAC 尤其重要。因此我们认为 NAC 在病害生逆境发挥着重要作用如图 2.1[21]。
甘肃农业大学 2018 届硕士学位论文3 结果与分析3.1 StNAC 的生物信息学分析.1.1 马铃薯 StNAC262 基因进化分析用软件 CluxtalX1.8 和 MEGA 5.0 程序对所有 StNAC 和 AtNAC TFs 进行序列比对，使用邻接法，用多序列比对文件构建无根系统发育树(如图 2.果表明目标基因属于马铃薯 NAC 转录因子的 NAM 亚家族。StNAC 和 AtN度保守，具有高度相似的基因结构。利用在线软件 NCBI 分析发现 StNAC有两个保守区(如图 2.2)。为了进一步了解其进化关系，用软件 CluxtalX1.AC262 基因以及烟草属的 NAC100-like 基因、番茄 NAC100 基因进行蛋白多序列比对，结果显示尽管这些基因存在结构上的差异，但是仍然具有一个的 NAC DNA-binding 结构域。
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物种子发育相关NAC家族转录因子研究进展[J]. 黄娟,邓娇,朱丽伟,陈庆富. 种子. 2017(11)
[2]蛋白质亚细胞定位预测研究进展[J]. 郑珊珊,石卓兴,代琦,姚玉华. 科技视界. 2014(15)
[3]植物NAC转录因子的研究进展[J]. 康桂娟,曾日中,聂智毅,黎瑜,代龙军,段翠芳. 生物技术通报. 2012(11)
[4]植物NAC转录因子的种类、特征及功能[J]. 李伟,韩蕾,钱永强,孙振元. 应用与环境生物学报. 2011(04)
[5]植物蛋白质的亚细胞定位研究进展[J]. 邢浩然,刘丽娟,刘国振. 华北农学报. 2006(S2)
[6]马铃薯不同品系贮藏期品质分析[J]. 田丰,张永成,师理,孙海林,阮建平,纳添仓. 中国马铃薯. 2006(01)
[7]Predicting Protein Subcellular Localization: Past, Present, and Future[J]. Pierre Dnnes,Annette Hglund. Genomics Proteomics & Bioinformatics. 2004(04)
硕士论文
[1]基于多标记学习的蛋白质亚细胞定位预测[D]. 赵青.济南大学 2016
[2]马铃薯miRNA164及其靶基因功能研究[D]. 姚磊.甘肃农业大学 2016
本文编号：3414693
【文章来源】：甘肃农业大学甘肃省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
NAC蛋白的结构和调控Fig.1.1StructureandregulationofNACproteins
气孔保卫细胞中表达，在不影响光合速率的前提下使气孔关闭，这使得植株性大大提高，也不会影响产量[32]。SNAC2 在水稻中可以抗旱、抗盐、抗冷械损伤和 ABA，且不会影响萌发率和生长率。受高盐和 ABA 胁迫诱导的AC1 为海茄冬 NAC 蛋白与番茄和马铃薯中 NAC 高度同源。花生中的AC2/3 与拟南芥 RD26 同源，它们都受 ABA、GA3、低温的诱导表达。SINACINAM1 是在番茄中发现的的盐敏感 NAC 基因，主要在花和成熟果实中表达萄中发现的 VpNAC1 是 NAC 转录因子，可以提高对白粉病菌和烟草黑胫病抵抗能力。已发现的 NAC 基因大多对生物胁迫和非生物胁迫都有响应，拟在盐溶液处理下，仅在根中就发现了 33 个 NAC 基因受到影响[59]，功能明只占很少一部分，大多数基因研究尚处于基因克隆、结构鉴定和表达分析层，在不同的植物中分离鉴定 NAC 尤其重要。因此我们认为 NAC 在病害生逆境发挥着重要作用如图 2.1[21]。
甘肃农业大学 2018 届硕士学位论文3 结果与分析3.1 StNAC 的生物信息学分析.1.1 马铃薯 StNAC262 基因进化分析用软件 CluxtalX1.8 和 MEGA 5.0 程序对所有 StNAC 和 AtNAC TFs 进行序列比对，使用邻接法，用多序列比对文件构建无根系统发育树(如图 2.果表明目标基因属于马铃薯 NAC 转录因子的 NAM 亚家族。StNAC 和 AtN度保守，具有高度相似的基因结构。利用在线软件 NCBI 分析发现 StNAC有两个保守区(如图 2.2)。为了进一步了解其进化关系，用软件 CluxtalX1.AC262 基因以及烟草属的 NAC100-like 基因、番茄 NAC100 基因进行蛋白多序列比对，结果显示尽管这些基因存在结构上的差异，但是仍然具有一个的 NAC DNA-binding 结构域。
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物种子发育相关NAC家族转录因子研究进展[J]. 黄娟,邓娇,朱丽伟,陈庆富. 种子. 2017(11)
[2]蛋白质亚细胞定位预测研究进展[J]. 郑珊珊,石卓兴,代琦,姚玉华. 科技视界. 2014(15)
[3]植物NAC转录因子的研究进展[J]. 康桂娟,曾日中,聂智毅,黎瑜,代龙军,段翠芳. 生物技术通报. 2012(11)
[4]植物NAC转录因子的种类、特征及功能[J]. 李伟,韩蕾,钱永强,孙振元. 应用与环境生物学报. 2011(04)
[5]植物蛋白质的亚细胞定位研究进展[J]. 邢浩然,刘丽娟,刘国振. 华北农学报. 2006(S2)
[6]马铃薯不同品系贮藏期品质分析[J]. 田丰,张永成,师理,孙海林,阮建平,纳添仓. 中国马铃薯. 2006(01)
[7]Predicting Protein Subcellular Localization: Past, Present, and Future[J]. Pierre Dnnes,Annette Hglund. Genomics Proteomics & Bioinformatics. 2004(04)
硕士论文
[1]基于多标记学习的蛋白质亚细胞定位预测[D]. 赵青.济南大学 2016
[2]马铃薯miRNA164及其靶基因功能研究[D]. 姚磊.甘肃农业大学 2016
本文编号：3414693
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3414693.html
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