黄瓜果实早期发育中基因的时空表达与调控

发布时间：2021-09-30 14:36

　　黄瓜（Cucumis sativus L.）是世界十大蔬菜之一,具有重要的经济价值。黄瓜以其幼嫩的瓠果为产品器官,但果实发育中相关基因及其调控机制研究较少。为进一步揭示黄瓜商品果形成过程中的关键基因和调控机制,本研究首先提高了黄瓜参考基因组的准确性和连续性,并进一步对黄瓜早期果实发育关键时间节点（开花前3天以及花后0、1、3、5、8、16天）和组织部位（头部胎座和中果皮、中部胎座和中果皮、瓜把）的基因和microRNA进行动态变化分析;同时发掘果实形态建成过程中的基因表达变化规律,得到了一系列具有重要功能的候选基因,并分析了基因表达与microRNA调控的关系,主要结果如下:1)获得高连续性和完整性的参考基因组（V3.0）。新拼接的基因组总长度为226.2 Mb,仅包含174条contgs,N50长度为8.9 Mb,与上一版本（V2.0）相比,基因组的连接性改善约234.8倍,长度增加29.0Mb。V3.0基因组鉴定出82.0Mb重复序列,占基因组36.43%,比V2.0（54.4Mb）中预测的重复序列增加27.6Mb。在V3.0中预测得到1,374个FL-LTR,比V2.0中的（26... 

【文章来源】：中国农业科学院北京市

【文章页数】：56 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１．１番前果实生长发育时期（引自Ｓｔｅｉｎｈａｕｓｅｒｅｔａｌ．，２０１０）??Ｆｉｕｒｅ．?１．１?Ｇｒｏｗｔｈ?ａｎｄ?ｄｅｖｅｌｏｍｅｎｔ?ｏｆ?ｔｏｍａｔｏ?ｆｒｕｉｔｓｃｉｔｅｄ?ｆｒｏｍ?Ｓｔｅｉｎｈａｕｓｅｒ?ｅｔ?ａｌ．，?２０１０

段：细胞分裂、细胞伸长和果实成熟期（Ｇｉｌｌａｓｐｙｅｔａｌ．，１９９３）：开花后０－３天是细胞的快速分裂阶??段，果实长度和直径增长缓慢；３－５天由快速分裂转入快速伸长，果实长度増长尤其明显，５－８天??快速伸长时期；１２天后趋于平缓，１６天基本完成果实成熟（图１．２）。??在黄瓜早期果实发育过程中，细胞数目和体积也随之呈现动态变化趋势：开花之前主要是细??胞数目的增加，开花前到花后５天为细胞快速分裂期；５天后转换为细胞快速膨大期，一直持续??到开花后１６天左右，开花后的１２－１６天的细胞膨大主要与果实直径的增长相关。果实的快速生长??和伸长阶段是果实发育过程中的重要阶段，细胞分裂时期是影响果实大小和产量的重要阶段。此??夕卜，细胞伸长时期也越来越被认为是果实品质性状的重要决定因素，例如此过程中糖和有机酸的??积累以及细胞壁和角质层的建立（Ａｎｄｏｅｔａｌ．，２０１２）。同时１０－１２天的细胞伸长期被发现存在果实??敏感性的转变，可能与抗性变化有关。??在果实发育过程中还伴随着棱和刺瘤的变化

中国农业科学院硕士学位论文?第二章基因组组装与分析??额外的１９．１１＼＾序列（图２．２）。由于缺乏１１丨－（：数据的支持，其余７８个超级３〇３０＇〇记３（１５．２：＼＜１１））??不能锚定到七条染色体中的任何一条，这表明这些序列可能主要由重复序列覆盖，难以锚定到染??色体上。??１－１?－?１－３?＇?１－５?１－７?１－８?１－１０?１－１２??ｃｈｒ１?＇?？??Ｃｏｎｔｉｇ?ｉ．ｉｉ?丨丨——??Ｒｅｐｅａｔ??ｔｙｐｅ?Ｉ川?ｏｒ?ｔｙｐｅ?ＩＶ??ｃｈｒ２?＇?Ｙ?。Ｘ?＞?ｕｍ?ｔｙｐｅｌｌｌ??＇＿Ｂ■■丨?＿＿■■?＿■?１?＿■■？？■■＿?丨１?■＿??丨■■■丨丨＿＿丨丨ｉ?丨丨■丨，■丨一??Ｉ?ｉｔ?Ｉ?ｒａ??Ｃｅｎ??３－１?：?３－３＾－４?３－５?丄?３－６??３－８??１，１，１?■■?＿■■丨?―丨１１?，■■■■?－丨》＿?丨?圓丨丨Ｉ??ｒ．，ｌ繫■?出丨ｄ：‘＇?＇?ｒ：！?＇??４－１?４－２?４－３?４－４?４－５?＾?４?６?４－７?４－６?４－９－?：４－ｔ１??ｃｈｒ４?＾９??—圓丨丨丨■■■丨■？?？■■??■■Ｗ丨丨丨１?■ＭＩＮＩ??ｉ?？?Ｐ?：?１?晒Ｉ??—■－ｒ－—ｖ－ｖ＿＿■■?■—■■■■■■■■＿??—■■一?■?■??？?ｓ＊？ｉＬｆｒｗ?ｆａｍｍ?＾?＊：?ｉ??ｃｈｒ６?纖??—＿丨丨—ｎ


本文编号：3416066