甜瓜CmFT基因的克隆及其分子标记开发

发布时间：2021-10-07 01:51

　　以"HM1-1""MS-5"甜瓜品种为试材,采用同源克隆的方法得到甜瓜FT同源基因,命名为CmFT,通过进化树分析、实时荧光定量方法以及分子标记辅助选择育种等方法初步验证了CmFT在甜瓜花发育过程中的作用。结果表明:该基因全长3 843 bp,CDS区为534 bp,编码178个氨基酸。在24个甜瓜品种中开展分子标记辅助筛选准确率达87.5%。该标记与甜瓜开花性状相关,可用于甜瓜早花育种的辅助选择,研究结果对甜瓜分子育种与开花基因调控提供了参考依据。 

【文章来源】：北方园艺. 2020,(19)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

甜瓜CmFT基因与黄瓜CsFT基因的结构

除甜瓜外,利用NCBI找到其它13个物种的FT同源基因的蛋白序列,利用DNAMAN软件进行蛋白序列比对(图2)。结果表明,CmFT与其它FT蛋白长度相似,有178个氨基酸,并且,关键性氨基酸Tyr84/Gln139(黑点)、第4个外显子中的14个保守氨基酸和LYN三联体在CmFT 中均没有发生变化,不同物种FT基因编码的氨基酸序列中间区域是高度保守的。有70个氨基酸残基在所有13个蛋白序列中高度保守,还有85个残基的保守性在80%以上。表明CmFT在氨基酸序列上高度保守。采用 MEGA 7.0 软件 Neighbor-joining(NJ)法将甜瓜FT基因预测的蛋白序列和黄瓜、拟南芥、水稻、玉米、小麦等18个物种的FT蛋白序列进行系统发育树分析,进一步分析FT基因与其它物种间的亲缘关系,由图3可知,FT 蛋白可以分为单子叶和双子叶2个不同的进化枝。CmFT与黄瓜的CsFT在同一个进化枝上,同源性为97.8%。而与拟南芥的AtFT相对进化距离较远,同源性为73.63%。不同物种间氨基酸序列高度相似说明该蛋白质在生物生命活动中执行着不可替代的重要功能。

采用 MEGA 7.0 软件 Neighbor-joining(NJ)法将甜瓜FT基因预测的蛋白序列和黄瓜、拟南芥、水稻、玉米、小麦等18个物种的FT蛋白序列进行系统发育树分析,进一步分析FT基因与其它物种间的亲缘关系,由图3可知,FT 蛋白可以分为单子叶和双子叶2个不同的进化枝。CmFT与黄瓜的CsFT在同一个进化枝上,同源性为97.8%。而与拟南芥的AtFT相对进化距离较远,同源性为73.63%。不同物种间氨基酸序列高度相似说明该蛋白质在生物生命活动中执行着不可替代的重要功能。2.3 CmFT基因的功能初步分析


本文编号：3421139