基于生物信息学对与结肠癌预后相关SNPs位点及下游基因的研究分析
发布时间：2021-10-08 01:28
结直肠癌（Colorectal Cancer,CRC）在全球所有癌症中致死率排名第二,也是第三大常见恶性肿瘤。CRC的5年存活率约为64%,但是在转移后骤降至12%。现有的对于CRC治疗方式及治疗靶点等的局限性极大地限制了CRC患者的预后生存情况。对于CRC预后风险相关单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs）及基因的研究可以帮助人们了解CRC潜在的致病机制,并且为药物治疗提供潜在靶点,帮助人们提高CRC预防策略并降低患病风险,还可以帮助改善CRC患者预后。尽管全基因组关联研究（Genome-Wide Association Studies,GWAS）已经发现了许多和CRC风险相关的SNPs及候选基因座,但是对于它们之间的功能注释及潜在调节机制却研究甚少。本研究通过GWAS联合表达数量性状基因座（Expression Quantitative Trait Loci,eQTL）分析以及生存分析等生物信息学方法发现了几个新的潜在的CRC风险相关的关键SNPs及对应的候选靶基因。SNPs及其对应的候选靶基因关系为:rs10490785对应ABH...
【文章来源】：兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：71 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
标准化年龄后全球结肠癌的发病率[3]
兰州大学硕士学位论文基于生物信息学分析对结肠癌预后相关SNPs位点及基因的研究2图1-1标准化年龄后全球结肠癌的发病率[3]图1-2标准化年龄后全球结肠癌的死亡率[3]1.1.1CRC的区域、年龄、性别和种族间差异性根据2018年的国际癌症研究机构估计，CRC在全球范围内每年约有180万新病例和90万人死亡，这也是使其成为全球癌症中第三大最常见和第二大死亡率最高的原因[1]。一般而言，工业化国家的经济发展比较迅速，但是伴随而来的就是饮食模式和久坐不动等不健康的生活方式也司空见惯，这些都是导致CRC发病率上升的因素。因此，世界各国的西方化往往伴随着CRC发病率的上升[13]。全球范围内CRC发病率的时间模式也各不相同，在南美、东欧和亚洲一些经济转型国家的发病率正在上升（例如巴西、斯洛伐克和中国）[4]。在北美、欧洲和大洋洲的高收入国家，发病率在高峰之后下降（例如美国、法国和新西兰），或者相对稳定（例如英国和澳大利亚）或增加（例如意大利、挪威和西班牙）[4]。在男性比女性发病率的波动方面则更为明显，这可能与关键风险因素的分布变化
畚幕?谏?镄畔⒀Х治龆越岢Π┰ず笙喙豐NPs位点及基因的研究10和存活。当该通路失调时，可通过促进细胞增殖、延长生存期、血管生成、抗凋亡、侵袭和转移而导致恶性转化和肿瘤进展。EGFR/MAPK信号通路与肿瘤发生过程密切相关，在肿瘤生长和CRC进展中发挥重要作用。据报道，该通路的异常表达环节是CRC治疗的靶点[129]。除此之外还有其它的信号通路也在CRC的形成发展中起了作用，比如PI3K/Akt信号通路、HH、ErbB、RHOA、BMP、Hippo、AMPK、NF-κB和JNK等信号通路。而且不同的信号通路之间也存在着一定的串扰[133]。图1-3CRC相关信号通路之间的串扰和旁路机制[134]1.3.2CRC的治疗现状之前已经提到，结肠癌的5年存活率约为64%，但是在转移后骤降至12%[5]。所以尚需进一步研究开发有效的药物干预方法。一般最经典的CRC治疗方法就是实现肿瘤和转移的完全清除，而在大多数情况下都需要手术来进行干预[135]。虽然现在已经有了很多关于CRC的筛查方法，但是还是有四分之一的CRC患者确诊时已经发生了晚期转移，剩余病例中也有20%可能在不同时间也发生转移，这导致了CRC进行手术根治的困难[136]。而对于不能进行手术切除的患者，现在能做的就是最大限度的抑制和缩小肿瘤。值得注意的一点是，在有些情况下，在术前或者术后以化疗的方法进行辅助，可以极大限度地减小和稳定肿瘤[137]。近几十年来的研究数据表明，在CRC患者（尤其是转移性患者）中使用化疗已将其总生存时间（OverallSurvival，OS）延长至将近20个月，从而使化学疗法成为CRC治疗的基础[138]。化学疗法也有着一定的局限性，如现有的全身性毒性，令人不满意的反应速度，不可预测的先天和获得性抗性和肿瘤低特异性选择相关联。因此，开发新的方法来完善甚至替代现有的CRC化疗也
本文编号：3423162
【文章来源】：兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：71 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
标准化年龄后全球结肠癌的发病率[3]
兰州大学硕士学位论文基于生物信息学分析对结肠癌预后相关SNPs位点及基因的研究2图1-1标准化年龄后全球结肠癌的发病率[3]图1-2标准化年龄后全球结肠癌的死亡率[3]1.1.1CRC的区域、年龄、性别和种族间差异性根据2018年的国际癌症研究机构估计，CRC在全球范围内每年约有180万新病例和90万人死亡，这也是使其成为全球癌症中第三大最常见和第二大死亡率最高的原因[1]。一般而言，工业化国家的经济发展比较迅速，但是伴随而来的就是饮食模式和久坐不动等不健康的生活方式也司空见惯，这些都是导致CRC发病率上升的因素。因此，世界各国的西方化往往伴随着CRC发病率的上升[13]。全球范围内CRC发病率的时间模式也各不相同，在南美、东欧和亚洲一些经济转型国家的发病率正在上升（例如巴西、斯洛伐克和中国）[4]。在北美、欧洲和大洋洲的高收入国家，发病率在高峰之后下降（例如美国、法国和新西兰），或者相对稳定（例如英国和澳大利亚）或增加（例如意大利、挪威和西班牙）[4]。在男性比女性发病率的波动方面则更为明显，这可能与关键风险因素的分布变化
畚幕?谏?镄畔⒀Х治龆越岢Π┰ず笙喙豐NPs位点及基因的研究10和存活。当该通路失调时，可通过促进细胞增殖、延长生存期、血管生成、抗凋亡、侵袭和转移而导致恶性转化和肿瘤进展。EGFR/MAPK信号通路与肿瘤发生过程密切相关，在肿瘤生长和CRC进展中发挥重要作用。据报道，该通路的异常表达环节是CRC治疗的靶点[129]。除此之外还有其它的信号通路也在CRC的形成发展中起了作用，比如PI3K/Akt信号通路、HH、ErbB、RHOA、BMP、Hippo、AMPK、NF-κB和JNK等信号通路。而且不同的信号通路之间也存在着一定的串扰[133]。图1-3CRC相关信号通路之间的串扰和旁路机制[134]1.3.2CRC的治疗现状之前已经提到，结肠癌的5年存活率约为64%，但是在转移后骤降至12%[5]。所以尚需进一步研究开发有效的药物干预方法。一般最经典的CRC治疗方法就是实现肿瘤和转移的完全清除，而在大多数情况下都需要手术来进行干预[135]。虽然现在已经有了很多关于CRC的筛查方法，但是还是有四分之一的CRC患者确诊时已经发生了晚期转移，剩余病例中也有20%可能在不同时间也发生转移，这导致了CRC进行手术根治的困难[136]。而对于不能进行手术切除的患者，现在能做的就是最大限度的抑制和缩小肿瘤。值得注意的一点是，在有些情况下，在术前或者术后以化疗的方法进行辅助，可以极大限度地减小和稳定肿瘤[137]。近几十年来的研究数据表明，在CRC患者（尤其是转移性患者）中使用化疗已将其总生存时间（OverallSurvival，OS）延长至将近20个月，从而使化学疗法成为CRC治疗的基础[138]。化学疗法也有着一定的局限性，如现有的全身性毒性，令人不满意的反应速度，不可预测的先天和获得性抗性和肿瘤低特异性选择相关联。因此，开发新的方法来完善甚至替代现有的CRC化疗也
本文编号：3423162
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