油菜杂交种宁杂21号及其双亲苗期在盐胁迫条件下差异表达基因分析

发布时间：2021-10-08 17:57

　　为了解甘蓝型油菜杂种优势在盐胁迫中的表现,遏制减产,以油菜强优势杂交种宁杂21号及其亲本为材料,通过转录组测序,筛选鉴定得到1078个芽苗期差异表达基因（DEG）与耐盐杂种优势密切相关,并能被已有盐胁迫相关QTL注释,部分基因的表达能被荧光定量PCR验证,说明所得DEG具有可靠性,有潜在的油菜耐盐育种价值。杂交组合中耐盐杂种优势相关DEG表达模式与母本更为类似,大部分表现为正调控,功能倾向于生物合成的同化作用,而表达模式类似父本的DEG其功能倾向于氧化还原等调节作用。本研究还对耐盐性杂种优势特异的SNP位点进行了预测和注释,以期为杂交油菜耐盐分子标记的开发以及耐盐育种提供理论依据。 

【文章来源】：中国油料作物学报. 2020,42(04)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料与耐盐处理
    1.2 RNA提取与转录组测序
    1.3 序列分析
    1.4 差异表达基因（DEG）筛选
    1.5 耐盐杂种优势相关差异基因分析
    1.6 实时荧光定量PCR
    1.7 统计分析
2 结果与分析
    2.1 耐盐杂种优势表型鉴定
    2.2 耐盐杂种优势DEG鉴定
    2.3 耐盐杂种优势相关基因的表达模式分析
    2.4 耐盐杂种优势相关基因的功能注释
    2.5 耐盐杂种优势相关DEG的QTL注释
    2.6 qPCR验证
    2.7 耐盐杂种优势相关SNP位点解析
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]油菜宁杂21号在江苏沿海滩涂盐碱地的种植表现及高产栽培技术要点[J]. 张培通,张萼,郭文琦,陈建平,李春宏,王永慧,胡茂龙,蔡立旺,施庆华.  江苏农业科学. 2014(06)
[2]甘蓝型单、双低油菜细胞质雄性不育杂种的抗逆性研究[J]. 张书芬,傅廷栋,宋文光.  河南农业科学. 1993(10)



本文编号：3424665