基于线粒体COⅠ基因序列的2种仿对虾遗传差异

发布时间：2021-10-13 21:37

　　哈氏仿对虾和细巧仿对虾是东海经济虾类资源中主要的仿对虾属种类,为调查研究浙江省舟山市近海这2种虾类种质资源现状及亲缘关系,通过PCR扩增获得2种仿对虾线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基Ⅰ,基因长度为632 bp的序列片段,共检测到101个变异位点,其中简约信息位点99个,哈氏仿对虾有4种单倍型,细巧仿对虾有3种单倍型。统计碱基组成发现,二者在目的片段上的A+T含量分别为62.0%、62.9%,均显著高于C+G含量。细巧仿对虾的单倍型多样性与核苷酸多样性均高于哈氏仿对虾,采用邻接法构建分子系统树,并基于木村双参数遗传距离计算2种仿对虾的分化时间约在5.93百万年前。初步摸清了哈氏仿对虾和细巧仿对虾遗传多样性现状并比较了两者间的遗传差异,研究结果以期为仿对虾属经济物种的遗传信息和系统发育提供分子生物学参考依据。 

【文章来源】：江苏农业科学. 2020,48(16)

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料采集和DNA提取
    1.2 PCR扩增
    1.3 数据处理
2 结果与分析
    2.1 COⅠ基因序列分析
    2.2 遗传多样性分析
    2.3 遗传距离和聚类分析
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于线粒体Cyt b和COⅠ基因序列的华南鲤群体遗传结构分析[J]. 王桢璐,姚东林,谢少林,范兰芬,邹记兴,周爱国.  江苏农业科学. 2018(18)
[2]基于线粒体COⅠ的DNA条形码在对虾科种类鉴定中的研究[J]. 易啸,王攀攀,王军,苏永全,毛勇.  水产学报. 2018(01)
[3]哈氏仿对虾线粒体16S rRNA和COⅠ基因的序列比较及其与仿对虾属之间的系统进化分析[J]. 毛智超,段亚飞,刘萍,李健,陈萍.  水产学报. 2016(07)
[4]哈氏仿对虾人工育苗技术研究[J]. 张曹进,姚国兴,吴国钧,任忠宏,陈爱华.  水产科技情报. 2011(06)
[5]基于线粒体Cytb基因探讨我国日本囊对虾4个地理群体的遗传结构及种群分化[J]. 曾凡荣,王军,周孔霖,游欣欣,毛勇.  厦门大学学报(自然科学版). 2010(05)
[6]东海北部哈氏仿对虾资源量评估[J]. 徐开达,薛利建,贺舟挺,宋海棠.  福建水产. 2010(01)
[7]东海哈氏仿对虾的数量分布和生长特性研究[J]. 宋海棠,俞存根,薛利建.  水生生物学报. 2009(01)
[8]3种中华绒螯蟹群体线粒体CO Ⅱ基因序列测定与进化分析[J]. 王成辉,李思发,刘至治,龚小玲,黄雷,宋晓,赵岩.  水产学报. 2008(01)
[9]遗传多样性及其保存[J]. 施立明.  生物科学信息. 1990(04)
[10]中国近海仿对虾属的研究[J]. 刘瑞玉,王永良.  海洋与湖沼. 1987(06)

博士论文
[1]密码子及密码子对使用偏好性的研究[D]. 谭生军.南京大学 2012

硕士论文
[1]中国近海仿对虾属分子系统演化和近似种问题的研究[D]. 徐琰.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2005



本文编号：3435445