花生AhARF基因家族鉴定与表达分析

发布时间：2021-10-14 09:03

　　生长素响应因子（Auxin response factor,ARF）是生长素信号转导途径中的一类重要转录因子,在种子萌发、器官形成、果实成熟、胚胎发生等多个生长发育过程发挥作用。为了揭示花生基因组中AhARF基因家族的特征,本研究利用生物信息学方法从花生基因组中鉴定了62个花生AhARF家族基因,它们不均匀分布于除1号和11号之外的其他18条染色体上,在A和B亚基因组对应关系的染色体上数目大体相同。依据系统发生关系,62个花生AhARFs与拟南芥AtARFs家族基因共同聚在除ClassIII（仅包含拟南芥AtARFs）外的其余4个分支。共线性分析共检测到33对片段重复基因,其Ka/Ks比值均小于1,受到环境压力的纯化选择。本研究还分析了它们的理化性质、蛋白保守结构域等特征。此外,基于22个组织转录组数据,绘制了62个花生AhARF家族基因的表达模式热图。进一步应用qRT-PCR方法,分析了可能与萌发相关的4个AhARF基因（AhARF10、AhARF20、AhARF23和AhARF46）的时空表达模式。本研究可为种子萌发相关AhARF基因的挖掘与功能鉴定提供基础。 

【文章来源】：中国油料作物学报. 2020,42(06)北大核心CSCD

【文章页数】：11 页

【部分图文】：

花生Ah ARF家族基因在染色体上的定位

花生与拟南芥ARF基因的系统进化树

花生Ah ARF家族重复基因分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]花生种子萌发过程中内源激素含量的变化[J]. 崔维佩,唐桂英,徐平丽,李鹏祥,朱洁琼,单雷.  中国油料作物学报. 2020(05)
[2]大麦ARF基因家族的全基因组分析[J]. 郭宝健,李赢,袁泽宸,吕超,张新忠,许如根.  麦类作物学报. 2016(11)
[3]普通烟草ARF基因家族序列的鉴定与表达分析[J]. 孙亭亭,张磊,陈乐,龚达平,王大伟,陈雅琼,陈蕾,孙玉合.  植物遗传资源学报. 2016(01)



本文编号：3435861