小麦转录因子基因TaMYB70的分离和表达分析

发布时间：2021-10-14 11:21

　　为了探究小麦MYB转录因子基因TaMYB70的功能,采用同源克隆方法分离TaMYB70（MK024291）基因cDNA序列,运用生物信息学手段分析该基因序列特征,采用实时荧光定量反转录PCR（qRT-PCR）检测其在不同逆境胁迫下的表达模式。结果表明,分离得到的TaMYB70部分序列长度为1 272bp,包含一个长度为1 008bp的开放阅读框,编码335个氨基酸残基。TaMYB70蛋白含有2个螺旋-转角-螺旋结构的Mybtype HTH DNA结合结构域。TaMYB70氨基酸序列与粗山羊草、二穗短柄草等植物MYB44同源性较高,与拟南芥R2R3-MYB转录因子第22亚族成员属于同一分支。qRT-PCR分析表明,TaMYB70在脱落酸胁迫下表达量升高,在PEG和NaCl胁迫下表达量下降,该转录因子可能参与小麦逆境胁迫应答。 

【文章来源】：作物杂志. 2020,(04)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

小麦TaMYB70基因扩增结果

用Protparam分析氨基酸序列的理化性质结果表明，小麦Ta MYB70蛋白分子质量为35 799.56Da，等电点9.27，负电荷氨基酸残基数（Asp+Glu）为29，正电荷氨基酸残基数（Arg+Lys）为35，不稳定指数为90.43，为不稳定蛋白，亲水性平均系数为-0.638，为亲水蛋白。Prosite预测该蛋白的结构域，发现在氨基酸残基位点14～67和69～118处各有1个Myb-type HTH DNA结合结构域（图2）。用SWISS-MODEL预测其三级结构模型，发现该蛋白含有2个螺旋-转角-螺旋结构（图3），与蛋白质结构域预测相符，Ta MYB70蛋白具有R2R3-MYB转录因子典型的结构特征，预测该蛋白为R2R3-MYB转录因子。图3 小麦TaMYB70蛋白三级结构模型

小麦TaMYB70蛋白三级结构模型

【参考文献】：
期刊论文
[1]AtMYB73基因正调控拟南芥对盐胁迫的响应[J]. 庞茜,赵亚婷,樊锦涛,邢红侠,张靖,邢继红,董金皋.  河北农业大学学报. 2017(05)
[2]AtMYB44与ABI1竞争性结合ABA受体RCAR1的研究[J]. 赵哲,李德款,袁德志,王晓玉,李旭锋.  四川大学学报(自然科学版). 2015(03)
[3]拟南芥R2R3-MYB家族第22亚族的结构与功能[J]. 樊锦涛,蒋琛茜,邢继红,董金皋.  遗传. 2014(10)
[4]植物MYB类转录因子研究进展[J]. 陈俊,王宗阳.  植物生理与分子生物学学报. 2002(02)

硕士论文
[1]拟南芥AtMYB73响应干旱机制初探[D]. 樊锦涛.河北农业大学 2015



本文编号：3436061