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SPL家族基因复制及功能分化分析

发布时间:2021-10-22 10:13
  【目的】基因复制及随后的功能分化是基因组和物种演化的重要驱动力。植物特有的转录因子家族SPL(SQUAMOSA-promoter binding protein like)广泛参与调控植物生长发育及响应逆境胁迫,为研究重复基因的起源方式和进化命运提供了良好的研究系统。本研究对葡萄(Vitis vinifera)、番木瓜(Carica papaya)、毛果杨(Populus trichocarpa)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)4种模式植物的SPL基因家族开展基因复制及功能分化分析,为进一步研究SPL基因功能、预测种属特异性的功能基因提供系统进化角度的参考。【方法】利用SBP特征结构域,鉴定葡萄、番木瓜、毛果杨和拟南芥4种模式植物中SPL基因家族成员,并利用最大似然法构建系统进化树。基于物种内、物种间基因组共线性,分析SPL基因家族发生基因复制的方式及差异保留情况,并计算保留的SPL直系和旁系同源基因的同义、非同义替换率,分析功能分化情况。【结果】在4种模式植物中共鉴定出SPL基因73个,其中42个是miR156的靶基因。系统进化分析显示:73个SPL基因聚类为9个... 

【文章来源】:南京林业大学学报(自然科学版). 2020,44(05)北大核心CSCD

【文章页数】:12 页

【参考文献】:
期刊论文
[1]SPL转录因子调控植物花发育及其分子机制研究进展[J]. 田晶,赵雪媛,谢隆聖,权晋谊,姚连梅,王国东,郑要强,刘雪梅.  南京林业大学学报(自然科学版). 2018(03)
[2]Conservation and Diversity of MicroRNA-associated Copper-regulatory Networks in Populus trichocarpa[J]. Vincent L.Chiang.  Journal of Integrative Plant Biology. 2011(11)
[3]重复基因的进化--回顾与进展[J]. 孙红正,葛颂.  植物学报. 2010(01)



本文编号:3450892

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