盐胁迫下甜高粱WRKY50基因的功能分析
发布时间：2021-10-24 05:15
WRKY转录因子家族参与植物对逆境的响应,该家族成员均含有一个保守的WRKY结构域,可通过结合下游靶基因启动子区的W-box来调节植物的生理生化反应。本试验中,我们从转录组中筛选出一个甜高粱SbWRKY50（Sb09G005700）基因,并将该基因在野生型拟南芥中过量表达获得过表达株系W50-12,W50-13。利用在线网站对该基因的生物信息学进行了分析,构建了带有GFP标签的载体对SbWRKY50的定位进行分析,构建了pGBKT7-SbWRKY50载体对其进行了转录活性分析。测定和分析了盐处理下野生型和过表达植株在萌发期和苗期的各项生理指标,并筛选到该基因调控的下游靶基因,并通过荧光定量PCR、酵母单杂交和荧光素酶互补实验进行验证,阐明该基因调控植物抗盐的作用机制。本研究的主要结论是:1、SbWRKY50的CDS序列全长621bp,共编码207个氨基酸,其N端具有一个保守的WRKY结构域,C端具有一个C2H2的锌指结构,属于典型的II类WRKY家族蛋白。该蛋白的分子式为C969H1453N
【文章来源】：山东师范大学山东省
【文章页数】：58 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
SbWRKY50的氨基酸序列（A）和结构域（B）
山东师范大学硕士学位论文72.2SbWRKY50蛋白序列的亲疏水性分析图2-2.SbWRKY50蛋白的亲疏水性分析Fig.2-2.HydrophilicanalysisofSbWRKY50protein通过ExPASy在线网站对SbWRKY50蛋白序列进行亲疏水性分析，在该分析中，分值越大表示蛋白的疏水性越强。从图2-2可看出，SbWRKY50蛋白的分值大部分都是大于0的，所以SbWRKY50为疏水蛋白。2.3SbWRKY50信号肽及跨膜结构预测及分析通过TMHMM、Signal-5.0在线网站来分析SbWRKY50蛋白，从图2-3中可看出，SbWRKY50蛋白既无信号肽也无跨膜结构域。
山东师范大学硕士学位论文8图2-3.SbWRKY50蛋白的信号肽（A）及跨膜结构预测（B）Fig.2-3.Signalpeptide(A)andtransmembranestructureprediction(B)ofSbWRKY502.4SbWRKY50蛋白与其他同源蛋白的关系通过DNAMAN软件对甜高粱SbWRKY50蛋白序列和其他物种中的同源蛋白序列进行比对，发现他们都有WRKYGQK核心序列和C2H2型锌指结构，同源性比较高，因此SbWRKY50蛋白属于WRKY家族分类的第II类（图2-4A）。通过MEGA6软件对这些同源基因建立系统进化树发现，SbWRKY50蛋白与PhWRKY51蛋白亲缘关系最近（图2-4B）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]盐碱胁迫对植物形态和生理生化影响及植物响应的研究进展[J]. 焦德志,赵泽龙. 江苏农业科学. 2019(20)
[2]甜高粱角蛋白基因的分离及功能分析[J]. 宋玉双,隋娜. 聊城大学学报(自然科学版). 2019(04)
[3]盐胁迫对不同品种玉米苗期生长与叶片光合特性的影响[J]. 李文阳,胡秀娟,王长进,韩坤龙. 生态科学. 2019(02)
[4]盐胁迫对紫花苜蓿根系形态特征和水分利用效率的影响[J]. 黄依婷,郭鹏,许涵杰. 黑龙江农业科学. 2016(04)
[5]植物耐盐相关的生理生化机制[J]. 屈芳芳. 河南科技. 2015(23)
[6]盐胁迫对石斛兰根系特性的影响[J]. 张吉起,孟长军. 吉林农业. 2015(01)
[7]NaCl胁迫对不同耐盐性玉米自交系萌动种子和幼苗离子稳态的影响[J]. 彭云玲,保杰,叶龙山,王永健,燕利斌. 生态学报. 2014(24)
[8]盐胁迫对棉花光合作用和生理指标的影响[J]. 吴晓东,王巍,金路路,徐敏,李书涛,王子胜. 中国棉花. 2013(06)
[9]盐胁迫对甜高粱种子吸水和萌发的影响[J]. 周桂生,安琳琳,童晨,刘贵娟,夏玉荣,陆建飞,封超年. 江苏农业科学. 2012(12)
[10]盐胁迫对拟南芥叶片和下表皮细胞大小的影响[J]. 侯蕾,陈龙俊. 安徽农业科学. 2011(13)
硕士论文
[1]利用酵母双杂交技术筛选与马铃薯StSOD1互作的调控蛋白[D]. 车育章.甘肃农业大学 2019
[2]不同生境盐地碱蓬根系拒盐机制研究[D]. 刘晴晴.山东师范大学 2018
[3]水稻转录因子OsWRKY63在低温胁迫中的功能研究[D]. 张明星.吉林大学 2018
[4]盐胁迫下甜高粱NADP-ME基因的功能分析[D]. 郭元元.山东师范大学 2017
[5]盐胁迫下盐地碱蓬甘油-3-磷酸酰基转移酶基因的功能分析[D]. 王明杰.山东师范大学 2016
[6]NaCl胁迫对同德小花碱茅和朝鲜碱茅幼苗生理特性及叶片显微结构的影响[D]. 周学丽.青海大学 2009
本文编号：3454649
【文章来源】：山东师范大学山东省
【文章页数】：58 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
SbWRKY50的氨基酸序列（A）和结构域（B）
山东师范大学硕士学位论文72.2SbWRKY50蛋白序列的亲疏水性分析图2-2.SbWRKY50蛋白的亲疏水性分析Fig.2-2.HydrophilicanalysisofSbWRKY50protein通过ExPASy在线网站对SbWRKY50蛋白序列进行亲疏水性分析，在该分析中，分值越大表示蛋白的疏水性越强。从图2-2可看出，SbWRKY50蛋白的分值大部分都是大于0的，所以SbWRKY50为疏水蛋白。2.3SbWRKY50信号肽及跨膜结构预测及分析通过TMHMM、Signal-5.0在线网站来分析SbWRKY50蛋白，从图2-3中可看出，SbWRKY50蛋白既无信号肽也无跨膜结构域。
山东师范大学硕士学位论文8图2-3.SbWRKY50蛋白的信号肽（A）及跨膜结构预测（B）Fig.2-3.Signalpeptide(A)andtransmembranestructureprediction(B)ofSbWRKY502.4SbWRKY50蛋白与其他同源蛋白的关系通过DNAMAN软件对甜高粱SbWRKY50蛋白序列和其他物种中的同源蛋白序列进行比对，发现他们都有WRKYGQK核心序列和C2H2型锌指结构，同源性比较高，因此SbWRKY50蛋白属于WRKY家族分类的第II类（图2-4A）。通过MEGA6软件对这些同源基因建立系统进化树发现，SbWRKY50蛋白与PhWRKY51蛋白亲缘关系最近（图2-4B）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]盐碱胁迫对植物形态和生理生化影响及植物响应的研究进展[J]. 焦德志,赵泽龙. 江苏农业科学. 2019(20)
[2]甜高粱角蛋白基因的分离及功能分析[J]. 宋玉双,隋娜. 聊城大学学报(自然科学版). 2019(04)
[3]盐胁迫对不同品种玉米苗期生长与叶片光合特性的影响[J]. 李文阳,胡秀娟,王长进,韩坤龙. 生态科学. 2019(02)
[4]盐胁迫对紫花苜蓿根系形态特征和水分利用效率的影响[J]. 黄依婷,郭鹏,许涵杰. 黑龙江农业科学. 2016(04)
[5]植物耐盐相关的生理生化机制[J]. 屈芳芳. 河南科技. 2015(23)
[6]盐胁迫对石斛兰根系特性的影响[J]. 张吉起,孟长军. 吉林农业. 2015(01)
[7]NaCl胁迫对不同耐盐性玉米自交系萌动种子和幼苗离子稳态的影响[J]. 彭云玲,保杰,叶龙山,王永健,燕利斌. 生态学报. 2014(24)
[8]盐胁迫对棉花光合作用和生理指标的影响[J]. 吴晓东,王巍,金路路,徐敏,李书涛,王子胜. 中国棉花. 2013(06)
[9]盐胁迫对甜高粱种子吸水和萌发的影响[J]. 周桂生,安琳琳,童晨,刘贵娟,夏玉荣,陆建飞,封超年. 江苏农业科学. 2012(12)
[10]盐胁迫对拟南芥叶片和下表皮细胞大小的影响[J]. 侯蕾,陈龙俊. 安徽农业科学. 2011(13)
硕士论文
[1]利用酵母双杂交技术筛选与马铃薯StSOD1互作的调控蛋白[D]. 车育章.甘肃农业大学 2019
[2]不同生境盐地碱蓬根系拒盐机制研究[D]. 刘晴晴.山东师范大学 2018
[3]水稻转录因子OsWRKY63在低温胁迫中的功能研究[D]. 张明星.吉林大学 2018
[4]盐胁迫下甜高粱NADP-ME基因的功能分析[D]. 郭元元.山东师范大学 2017
[5]盐胁迫下盐地碱蓬甘油-3-磷酸酰基转移酶基因的功能分析[D]. 王明杰.山东师范大学 2016
[6]NaCl胁迫对同德小花碱茅和朝鲜碱茅幼苗生理特性及叶片显微结构的影响[D]. 周学丽.青海大学 2009
本文编号：3454649
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