基于毒性相关基因序列的稻瘟病菌群体遗传多样性分析

发布时间：2021-10-24 19:06

　　选用16对毒性相关基因特异性引物对四川和重庆9个县（市）分离到的200个稻瘟病菌单孢菌株进行PCR扩增,并采用最长距离法进行聚类分析,结果显示各引物均能扩增出其目的条带,多态位点百分率（P）高达93.75%,扩增频率差异较大;200个菌株可归为70个不同的单元型,其中单元型SCH13为优势单元型;在0.86遗传相似水平上,200个菌株可划分为27个遗传宗谱,包括1个优势宗谱,3个亚优势宗谱,14个次要宗谱,9个小宗谱,层次丰富;在群体平均水平上,病菌群体具有丰富的遗传多样性（H=0.324 4,I=0.484 2）,且群体间差异较大;9个种群在遗传距离为0.05水平上可分为4个类群,种群遗传谱系与地理区域分布呈一定相关性。同时,该地区的群体存在一定的遗传分化（HT=0.320 0）,群体内多样性大于群体间多样性（Hs=0.179 6,Dst=0.140 4）,总遗传变异的56.13%存在于群体内（Gst=0.438 7）,群体间基因流动性较小（Nm=0.639 6）。本研究揭示了四川和重庆部分区域稻瘟病菌群体遗传结构、遗传多样性及其与地理分布之间的关系,为抗病育种和品种布局奠定了基础。 

【文章来源】：植物病理学报. 2016,46(01)北大核心CSCD

【文章页数】：12 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 供试菌株
    1.2 菌丝体培养
    1.3 病菌基因组DNA提取
    1.4 引物的选择及PCR检测
    1.5 数据统计与分析
2 结果与分析
    2.1 供试菌株的PCR扩增结果
        2.1.1致病基因特异性引物扩增结果
        2.1.2无毒基因特异性引物扩增结果
    2.2 稻瘟病菌群体遗传结构
        2.2.1稻瘟病菌群体单元型分析
        2.2.2稻瘟病菌群体遗传宗谱分析
        2.2.3稻瘟病菌遗传结构的地理分布特点
    2.3 西南地区稻瘟病菌群体遗传多样性分析
        2.3.1稻瘟病菌群体遗传多样性水平
        2.3.2稻瘟病菌群体遗传分化
    2.4 西南地区稻瘟病菌群体间的聚类分析
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3455818