野茼蒿黄脉病毒的田间寄主范围及其基因多样性特征
发布时间:2021-11-01 00:09
为明确野茼蒿黄脉病毒(Crassocephalum yellow vein virus,CraYVV)的田间寄主范围及其群体基因结构特征,分别采用克隆和测序技术对采自云南省西双版纳傣族州、红河哈尼族彝族自治州的7种杂草和2种作物进行CraYVV的分离和鉴定,并通过生物信息学软件对分离到的CraYVV进行基因组结构、重组及基因遗传结构分析。结果显示,在赛葵、龙葵、臭牡丹、水茄、豨莶、野茼蒿和一点红7种杂草以及茄子和草莓2种作物中均分离到CraYVV,共获得20条CraYVV全长序列;CraYVV所有分离物分属2个株系,将其命名为YJ株系和JH株系;JH株系具有地理隔离特征,与YJ株系存在一定的遗传距离;重组分析显示,CraYVV是由烟草曲茎病毒(tobacco curly shoot virus,TbCSV)和云南烟草曲叶病毒(tobacco leaf curl Yunnan virus,TbLCYnV)重组产生;遗传结构分析显示,CraYVV中C1基因变异最显著,其次是C4基因和基因间隔区。表明CraYVV能侵染5科9种杂草和作物,具有较广的寄主范围,且菜豆金色花叶病毒属病毒能够侵染草...
【文章来源】:植物保护学报. 2020,47(03)北大核心CSCD
【文章页数】:10 页
【部分图文】:
云南省西双版纳州及红河州田间感染野茼蒿黄脉病毒的植株症状
RDP重组分析显示,本研究中CraYVV分离物YN5946-4、YN5947-10、YN5949-9、YN5951-3、YN5952-3、YN5953-6、YN5955-14、YN5958-18、YN5959-30、YN5960-35、YN6130-2、YN6136-43、YN6166-8以及GenBank下载的CraYVV分离物Jinghong(EF165536)和YYJi3(FN401520)的DNA序列中均检测到1次明显的重组事件。该重组事件显示,以上CraYVV分离物是由TbCSV-282(AJ971266)和TbLCYnV-Y283(AJ971267)重组而来,TbCSV-282(AJ971266)是主要的母本,而TbLCYnV-Y283(AJ971267)则是次要的母本,重组区段位于以上分离物444~1 072 nt之间(V2和部分V1区),该区段来自TbLCYnV-Y283(表2)。表明上述重组事件普遍存在于CraYVV中,CraYVV可能是由TbCSV和TbLCYnV重组形成的病毒新种。2.6 CraYVV的遗传结构及进化机制分析
【参考文献】:
硕士论文
[1]云南赛葵上双生病毒的分子鉴定[D]. 刘培.浙江大学 2008
本文编号:3469134
【文章来源】:植物保护学报. 2020,47(03)北大核心CSCD
【文章页数】:10 页
【部分图文】:
云南省西双版纳州及红河州田间感染野茼蒿黄脉病毒的植株症状
RDP重组分析显示,本研究中CraYVV分离物YN5946-4、YN5947-10、YN5949-9、YN5951-3、YN5952-3、YN5953-6、YN5955-14、YN5958-18、YN5959-30、YN5960-35、YN6130-2、YN6136-43、YN6166-8以及GenBank下载的CraYVV分离物Jinghong(EF165536)和YYJi3(FN401520)的DNA序列中均检测到1次明显的重组事件。该重组事件显示,以上CraYVV分离物是由TbCSV-282(AJ971266)和TbLCYnV-Y283(AJ971267)重组而来,TbCSV-282(AJ971266)是主要的母本,而TbLCYnV-Y283(AJ971267)则是次要的母本,重组区段位于以上分离物444~1 072 nt之间(V2和部分V1区),该区段来自TbLCYnV-Y283(表2)。表明上述重组事件普遍存在于CraYVV中,CraYVV可能是由TbCSV和TbLCYnV重组形成的病毒新种。2.6 CraYVV的遗传结构及进化机制分析
【参考文献】:
硕士论文
[1]云南赛葵上双生病毒的分子鉴定[D]. 刘培.浙江大学 2008
本文编号:3469134
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3469134.html
最近更新
教材专著