三裂叶薯NBS-LRR类抗病基因的筛选鉴定与结构分析

发布时间：2021-11-01 08:00

　　为发掘甘薯近缘野生种三裂叶薯（Ipomoea triloba）的NBS-LRR类抗病基因,从基因数据库中对三裂叶薯基因组序列进行了筛选、鉴定和分析。结果表明,从三裂叶薯的98 025个基因中,筛选到282个编码NBS-LRR类蛋白的基因,其中N型80个,NL型83个,CN型28个,CNL型57个,TN型10个,TNL型23个,RN型1个。三裂叶薯的16条染色体上均含有NBS-LRR家族基因,数量最多的染色体含有65个,最少的只有1个。三裂叶薯基因组共有55个基因簇,包含了63.5%的NBS-LRR家族基因。在NBS-LRR抗病基因家族中,CNL和TNL亚家族分别对应到7和11个保守结构域。这为三裂叶薯抗性资源的利用提供了科学参考。 

【文章来源】：热带亚热带植物学报. 2020,28(05)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

三裂叶薯NBS-LRR基因家族中CNL亚家族蛋白保守结构域分布

将三裂叶薯的NBS-LRR家族蛋白中CC/TIR/RPW8/NBS/LRR结构域序列分别提取，使用MEGA X构建进化树(图4)，可见有3个明显的分支，分别为CNL型(蓝色)、TNL型(紫色)和RN型(黄色)。进化树分支中有些基因分支路径很长，如CP025666.1-snap.8798、CP025670.1-snap.5147等,推测这类基因的“祖先”基因在较早时即已发生分化，相应的基因序列也发生了较大的变化。有些基因序列的分支距离较近,如CP025666.1-snap.1140和CP025666.1-snap.1141、CP025663.1-snap.531和CP025663.1-snap.532，说明这些变化发生的时间较晚。图3 三裂叶薯CNL和TNL亚家族NB-ARC保守性分析

三裂叶薯CNL和TNL亚家族NB-ARC保守性分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]甘薯二倍体近缘野生种三裂叶薯MYB转录因子全基因组分析及逆境胁迫响应[J]. 石晓雯,贺立恒,焦晋华,刘霞宇,王婷,刘世芳,贾小云,李润植.  核农学报. 2018(07)
[2]小果野蕉（Musa acuminata）全基因组NBS抗病基因的鉴定与分析[J]. 刘梦雅,李伟明,吴伟,葛学军.  热带亚热带植物学报. 2014(05)
[3]五爪金龙、三裂叶薯和七爪龙水浸液对4种作物种子萌发与幼苗生长的影响[J]. 宋鑫,沈奕德,黄乔乔,李晓霞,范志伟.  热带生物学报. 2013(01)
[4]中国甘薯种质资源核心种质构建初探[J]. 赵冬兰,唐君,曹清河,周志林.  江西农业学报. 2012(10)
[5]植物抗病基因（R）与病原物无毒基因（Avr）相互作用机制的研究进展[J]. 何锋,王长春,王锋青,杨玲.  中国细胞生物学学报. 2011(09)
[6]甘薯NBS类抗病基因类似物的分离与序列分析[J]. 陈观水,周以飞,林生,潘大仁.  热带亚热带植物学报. 2006(05)
[7]甘薯品种抗旱适应性综合评价的方法研究[J]. 张明生,刘志,戚金亮,张丽霞,杨永华.  热带亚热带植物学报. 2005(06)
[8]我国甘薯种质资源研究的历史与现状[J]. 房伯平,张雄坚,陈景益,安康.  广东农业科学. 2004(S1)
[9]甘薯和近缘野生种Ipomoea triloba的种间体细胞杂种植株再生[J]. 王晶珊,刘庆昌,孟祥霞,王维华,徐丽娟,翟红.  农业生物技术学报. 2003(01)
[10]水稻NBS-LRR类R基因同源序列[J]. 郑先武,翟文学,李晓兵,王文君,徐吉臣,刘国振,朱立煌.  中国科学（C辑:生命科学）. 2001(01)



本文编号：3469806