日本沼虾雌性性早熟相关基因的筛
发布时间：2021-11-02 02:41
日本沼虾是一种具有很高经济价值的十足目甲壳动物,是我国淡水养殖的主要种类之一。近年来,由于日本沼虾自然资源的锐减,其养殖规模不断扩大,但养殖的日本沼虾却出现了生产性能下降、种质资源不断退化的情况,最为严重的是出现性早熟现象。性早熟是指日本沼虾提前进入繁殖期,当其尚未达到商品规格大小时,性腺就已经发育成熟,同时个体生长停止,使虾的商品率降低、产品贬值。性早熟的雌性个体还会产生低质量的后代,这样年复一年的繁育,加重了日本沼虾种质资源退化现象,制约了日本沼虾养殖业的健康发展。因此对雌性日本沼虾的性早熟现象进行研究,对性早熟相关基因进行筛选和功能分析,对阐明日本沼虾性早熟的分子机制,解决日本沼虾种质资源退化问题具有重要的意义。本研究采用转录组测序的方法,通过差异表达分析鉴别出了性早熟的和正常性成熟的日本沼虾卵巢中的差异基因（DEGs）,通过对这些DEGs的注释、表达模式聚类分析,以及显著富集性分析筛选出可能与日本沼虾性早熟相关的基因;利用基因克隆和cDNA末端快速扩增（RACE）PCR技术获得了其中5个可能与日本沼虾性早熟相关的基因的全长cDNA序列,并对其序列进行了生物信息学分析;利用实时荧...
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：205 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
神经内分泌系统控制十足目甲壳动物卵黄形成的模型
养殖环境及饲养管理一致，性早熟的虾在同年 8 月份卵巢发育成熟，平均体长 2.8 ± 0.8 cm，平均体重 1.0 ± 0.5 g。正常性成熟的虾在第二年的 4 ~ 5 月份卵巢发育成熟，平均体长 4.5 ± 0.5 cm，平均体重 3.5 ± 1.0 g（见图 2-1）。卵巢发育成熟的判断标准为：卵巢呈深绿色或墨绿色，卵膜表面分布有褐色斑点，卵巢充满了整个头胸甲。A B
性早熟的（B）日本沼虾卵巢组织总 RNl electrophoresis of total RNA in ovaries ofense (A) and sexually precocious M. nippon组装2500 测序平台对构建的正常性成熟性早熟和正常性成熟虾的卵巢中这些原始 reads 经去除引物、接头熟虾的卵巢中获得 42,115,012 和 5。测序得到的原始数据提交至 Genb为：SRP063589。原始数据经从头组36 个 unigenes，unigene 为最长的转中，31,441 个（49.64%）为 1–4002%）为 601–800 bp、3,021 个（4.77 bp（图 2-3A）。Unigenes 的最长长
【参考文献】：
期刊论文
[1]脊尾白虾VgR基因克隆及其在卵巢发育过程中的表达分析[J]. 梁俊平,李健,李吉涛,刘萍,刘德月. 中国水产科学. 2016(04)
[2]日本沼虾卵巢发育的组织学与组织化学观察[J]. 杜玉昕,邱高峰. 广东农业科学. 2014(13)
[3]脊尾白虾（Exopalaemon carinicauda）vasa基因cDNA克隆及其在卵巢发育中的表达分析[J]. 徐文斐,刘萍,李吉涛,李健,陈萍. 海洋与湖沼. 2014(03)
[4]中国青虾产业发展研究( 六) 青虾养殖产业进一步发展的问题与对策[J]. 李家乐,陈蓝荪,刘其根. 水产科技情报. 2011(06)
[5]拟穴青蟹vasa基因cDNA的特征分析与性腺特异表达[J]. 张凤英,马凌波,蒋科技,张丹,陈立侨. 海洋渔业. 2010(04)
[6]日本沼虾DEAD-box家族基因vasa和PL10的克隆及其在卵巢发育过程中的表达[J]. 朱小玲. 海洋渔业. 2010(02)
[7]前列腺素对禽类等级卵泡发育的影响[J]. 金艳梅. 中国畜牧兽医. 2010(04)
[8]Cloning,characterization,and expression analysis of the DEAD-box family genes,Fc-vasa and Fc-PL10a,in Chinese shrimp （Fenneropenaeus chinensis）[J]. 周倩如,邵明瑜,秦贞奎,康庆浩,张志峰. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2010(01)
[9]日本沼虾不同亚型维甲酸类X受体（RXR）cDNA克隆及序列分析[J]. 王文青,朱小玲. 淡水渔业. 2010(01)
[10]卵母细胞减数分裂的调控机制研究进展[J]. 周荣,杨秀萍. 国际生殖健康/计划生育杂志. 2008(02)
博士论文
[1]日本沼虾（Macrobrachium nipponense）卵黄蛋白原代谢相关基因的克隆和表达研究[D]. 赵卫红.华东师范大学 2011
[2]日本沼虾卵巢表达序列标签分析及生殖相关基因的克隆与表达[D]. 吴萍.华东师范大学 2009
硕士论文
[1]中国明对虾（Fenneropenaeus chinensis）两个DEAD-box家族基因Fc-vasa和Fc-PL10α的克隆和表达分析[D]. 周倩如.中国海洋大学 2007
本文编号：3471176
【文章来源】：西北农林科技大学陕西省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：205 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
神经内分泌系统控制十足目甲壳动物卵黄形成的模型
养殖环境及饲养管理一致，性早熟的虾在同年 8 月份卵巢发育成熟，平均体长 2.8 ± 0.8 cm，平均体重 1.0 ± 0.5 g。正常性成熟的虾在第二年的 4 ~ 5 月份卵巢发育成熟，平均体长 4.5 ± 0.5 cm，平均体重 3.5 ± 1.0 g（见图 2-1）。卵巢发育成熟的判断标准为：卵巢呈深绿色或墨绿色，卵膜表面分布有褐色斑点，卵巢充满了整个头胸甲。A B
性早熟的（B）日本沼虾卵巢组织总 RNl electrophoresis of total RNA in ovaries ofense (A) and sexually precocious M. nippon组装2500 测序平台对构建的正常性成熟性早熟和正常性成熟虾的卵巢中这些原始 reads 经去除引物、接头熟虾的卵巢中获得 42,115,012 和 5。测序得到的原始数据提交至 Genb为：SRP063589。原始数据经从头组36 个 unigenes，unigene 为最长的转中，31,441 个（49.64%）为 1–4002%）为 601–800 bp、3,021 个（4.77 bp（图 2-3A）。Unigenes 的最长长
【参考文献】：
期刊论文
[1]脊尾白虾VgR基因克隆及其在卵巢发育过程中的表达分析[J]. 梁俊平,李健,李吉涛,刘萍,刘德月. 中国水产科学. 2016(04)
[2]日本沼虾卵巢发育的组织学与组织化学观察[J]. 杜玉昕,邱高峰. 广东农业科学. 2014(13)
[3]脊尾白虾（Exopalaemon carinicauda）vasa基因cDNA克隆及其在卵巢发育中的表达分析[J]. 徐文斐,刘萍,李吉涛,李健,陈萍. 海洋与湖沼. 2014(03)
[4]中国青虾产业发展研究( 六) 青虾养殖产业进一步发展的问题与对策[J]. 李家乐,陈蓝荪,刘其根. 水产科技情报. 2011(06)
[5]拟穴青蟹vasa基因cDNA的特征分析与性腺特异表达[J]. 张凤英,马凌波,蒋科技,张丹,陈立侨. 海洋渔业. 2010(04)
[6]日本沼虾DEAD-box家族基因vasa和PL10的克隆及其在卵巢发育过程中的表达[J]. 朱小玲. 海洋渔业. 2010(02)
[7]前列腺素对禽类等级卵泡发育的影响[J]. 金艳梅. 中国畜牧兽医. 2010(04)
[8]Cloning,characterization,and expression analysis of the DEAD-box family genes,Fc-vasa and Fc-PL10a,in Chinese shrimp （Fenneropenaeus chinensis）[J]. 周倩如,邵明瑜,秦贞奎,康庆浩,张志峰. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2010(01)
[9]日本沼虾不同亚型维甲酸类X受体（RXR）cDNA克隆及序列分析[J]. 王文青,朱小玲. 淡水渔业. 2010(01)
[10]卵母细胞减数分裂的调控机制研究进展[J]. 周荣,杨秀萍. 国际生殖健康/计划生育杂志. 2008(02)
博士论文
[1]日本沼虾（Macrobrachium nipponense）卵黄蛋白原代谢相关基因的克隆和表达研究[D]. 赵卫红.华东师范大学 2011
[2]日本沼虾卵巢表达序列标签分析及生殖相关基因的克隆与表达[D]. 吴萍.华东师范大学 2009
硕士论文
[1]中国明对虾（Fenneropenaeus chinensis）两个DEAD-box家族基因Fc-vasa和Fc-PL10α的克隆和表达分析[D]. 周倩如.中国海洋大学 2007
本文编号：3471176
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