青枯菌诱导的马铃薯StSl-1基因的表达特征分析
发布时间：2021-11-04 16:28
马铃薯（Solanum tuberosum）在许多国家都是一种重要的主粮和经济作物。马铃薯也是病原体青枯菌（茄科雷尔氏菌Ralstonia solanacearum）的寄主,除此以外,冷、热、旱、盐等非生物胁迫因子对马铃薯生长栽培等有显著影响。研究马铃薯抗病的分子机制,是保持和提高马铃薯产量的重点。在高等植物中,Scarecrow-like蛋白（SCL）是一个属于GRAS家族的转录因子。SCL可以调节根系生长和细胞周期,也可以抵抗环境胁迫。SCL作为转录因子可以编码参与植物的信息传递和信号转导。植物特异的SCL转录因子调节植物发育过程,参与抗胁迫反应。然而到目前为止,马铃薯中的SCL基因研究较少。本研究从马铃薯抗病基因型ED13中获得了Scarecrow-like 21（SCL21）基因的全长cDNA序列,命名为StSl-1。利用qRT-PCR技术分析了该基因受青枯菌诱导和受三种植物激素水杨酸（SA）、茉莉酸甲酯（MeJA）和脱落酸（ABA）激发的基因表达谱,并利用原位杂交技术分析了该基因表达的组织和细胞学定位。主要结果如下:序列分析表明该基因序列长2,139bp。系统进化分析发现St...
【文章来源】：山西师范大学山西省
【文章页数】：75 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
ABA和NO3ˉ对拟南芥根尖中SCR基因的表达有调节作用（Harrisetal,2017）
山西师范大学硕士学位论文18图3-1StSl-1基因的DNA序列和预测的氨基酸序列马铃薯StSl-1序列的全长。该图显示了StSl-1基因的核苷酸和氨基酸序列，共2139bp和537个氨基酸。其中CDS区为313bp-1926bp。Figure3-1DNAsequenceandthepredictedaminoacidsequenceThefullDNAsequenceofthepotatoStSl-1genewereshowed.ThisfigureshowsthenucleotideandaminoacidsequencesoftheStSl-1gene,whichis2139bpand537aminoacidsintotal.TheCDSregionis313bp-1926bp.
山西师范大学硕士学位论文20图3-2StSl-1基因编码SCL蛋白的保守结构域及其三级结构StSl-1基因碱基顺序和蛋白质氨基酸残基起止号显示在示意框上方，氨基酸残基及序号显示在下方。AStSl-1的GRAS超家族结构域，pfam03514，氨基酸残基169-537。BStSl-1羧基末端GRAS超家族结构域的三级结构，C：羧基末端，N：氨基末端。CStSl-1基因DNA序列上游启动子区的顺式元件：cis-1：TCAbox，涉及水杨酸反应的順式元件；cis-2：TC-richbox，参与防御和胁迫反应的順式元件；cis-3：TATAbox，在-30附近开始转录的核心启动子元件；cis-*，其他順式元件（具体见附录）。Figure3-2ConservedDomainandTertiarystructureofSCLproteinencodedbyStSl-1GeneThebasesequenceofStSl-1geneandthestartandstopnumberofproteinaminoacidresidueswereshownabovetheschematicbox,andtheaminoacidresiduesandsequencenumberswereshownbelow.ATheGRASsuperfamilydomainofStSl-1,pfam03514,aminoacidresidues169-537.BThetertiarystructureoftheStSl-1carboxy-terminalGRASsuperfamilydomain,C:carboxyterminus,N:aminoterminus.CThecis-elementofthepromoterregionupstreamoftheStSl-1geneDNAsequence:cis-1:TCAbox,aciselementinvolvedinsalicylicacidreaction;cis-2:TC-richbox,aciselementinvolvedindefenseandstressresponse;cis-3:TATAbox,acorepromoterelementthatstartstranscriptionnear-30;cis-*,otherciselements(DetailsaregiveninAppendix1andAppendix2).
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物GRAS家族蛋白结构和功能的研究进展[J]. 殷龙飞,张中保,于荣,吴忠义. 分子植物育种. 2019(19)
[2]番茄青枯病生物防治策略研究[J]. 陈胜华. 农业与技术. 2018(06)
[3]马铃薯主要病害抗性育种研究进展[J]. 邓仁菊,邓宽平,何天久,雷尊国,陈恩发. 西南农业学报. 2014(03)
[4]GRAS家族基因在植物生长、代谢及逆境胁迫中的功能研究进展[J]. 周莲洁,张富春,王艳. 植物生理学报. 2013(09)
[5]葡萄SCARECROW基因家族的分析与表达[J]. 陈丽华,葛晖,柴丽娟,陈尚武,马会勤. 中国农业大学学报. 2012(01)
[6]马铃薯青枯病抗性的分子标记[J]. 郜刚,屈冬玉,连勇,金黎平,冯兰香. 园艺学报. 2000(01)
博士论文
[1]青枯菌诱导的马铃薯防卫相关基因克隆与表达[D]. 郜刚.中国农业科学院 2008
硕士论文
[1]水稻GRAS转录因子家族的系统分析与功能研究[D]. 刘子玮.南京大学 2018
[2]马尾松GRAS家族SHR和SCR同源基因的克隆与功能初步分析[D]. 朱沛煌.南京林业大学 2016
本文编号：3476087
【文章来源】：山西师范大学山西省
【文章页数】：75 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
ABA和NO3ˉ对拟南芥根尖中SCR基因的表达有调节作用（Harrisetal,2017）
山西师范大学硕士学位论文18图3-1StSl-1基因的DNA序列和预测的氨基酸序列马铃薯StSl-1序列的全长。该图显示了StSl-1基因的核苷酸和氨基酸序列，共2139bp和537个氨基酸。其中CDS区为313bp-1926bp。Figure3-1DNAsequenceandthepredictedaminoacidsequenceThefullDNAsequenceofthepotatoStSl-1genewereshowed.ThisfigureshowsthenucleotideandaminoacidsequencesoftheStSl-1gene,whichis2139bpand537aminoacidsintotal.TheCDSregionis313bp-1926bp.
山西师范大学硕士学位论文20图3-2StSl-1基因编码SCL蛋白的保守结构域及其三级结构StSl-1基因碱基顺序和蛋白质氨基酸残基起止号显示在示意框上方，氨基酸残基及序号显示在下方。AStSl-1的GRAS超家族结构域，pfam03514，氨基酸残基169-537。BStSl-1羧基末端GRAS超家族结构域的三级结构，C：羧基末端，N：氨基末端。CStSl-1基因DNA序列上游启动子区的顺式元件：cis-1：TCAbox，涉及水杨酸反应的順式元件；cis-2：TC-richbox，参与防御和胁迫反应的順式元件；cis-3：TATAbox，在-30附近开始转录的核心启动子元件；cis-*，其他順式元件（具体见附录）。Figure3-2ConservedDomainandTertiarystructureofSCLproteinencodedbyStSl-1GeneThebasesequenceofStSl-1geneandthestartandstopnumberofproteinaminoacidresidueswereshownabovetheschematicbox,andtheaminoacidresiduesandsequencenumberswereshownbelow.ATheGRASsuperfamilydomainofStSl-1,pfam03514,aminoacidresidues169-537.BThetertiarystructureoftheStSl-1carboxy-terminalGRASsuperfamilydomain,C:carboxyterminus,N:aminoterminus.CThecis-elementofthepromoterregionupstreamoftheStSl-1geneDNAsequence:cis-1:TCAbox,aciselementinvolvedinsalicylicacidreaction;cis-2:TC-richbox,aciselementinvolvedindefenseandstressresponse;cis-3:TATAbox,acorepromoterelementthatstartstranscriptionnear-30;cis-*,otherciselements(DetailsaregiveninAppendix1andAppendix2).
【参考文献】：
期刊论文
[1]植物GRAS家族蛋白结构和功能的研究进展[J]. 殷龙飞,张中保,于荣,吴忠义. 分子植物育种. 2019(19)
[2]番茄青枯病生物防治策略研究[J]. 陈胜华. 农业与技术. 2018(06)
[3]马铃薯主要病害抗性育种研究进展[J]. 邓仁菊,邓宽平,何天久,雷尊国,陈恩发. 西南农业学报. 2014(03)
[4]GRAS家族基因在植物生长、代谢及逆境胁迫中的功能研究进展[J]. 周莲洁,张富春,王艳. 植物生理学报. 2013(09)
[5]葡萄SCARECROW基因家族的分析与表达[J]. 陈丽华,葛晖,柴丽娟,陈尚武,马会勤. 中国农业大学学报. 2012(01)
[6]马铃薯青枯病抗性的分子标记[J]. 郜刚,屈冬玉,连勇,金黎平,冯兰香. 园艺学报. 2000(01)
博士论文
[1]青枯菌诱导的马铃薯防卫相关基因克隆与表达[D]. 郜刚.中国农业科学院 2008
硕士论文
[1]水稻GRAS转录因子家族的系统分析与功能研究[D]. 刘子玮.南京大学 2018
[2]马尾松GRAS家族SHR和SCR同源基因的克隆与功能初步分析[D]. 朱沛煌.南京林业大学 2016
本文编号：3476087
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