强直性脊柱炎致病相关基因的筛选及RUNX1参与破骨细胞分化的可能机制
发布时间:2021-11-04 14:07
第一部分 基于RNA高通量测序筛选强直性脊柱炎的差异表达基因研究背景强直性脊柱炎是一种慢性自身免疫性疾病,以反复发作的炎症及进行性的骨化为特征,主要累及中轴骨关节和软组织附着点,具备高度遗传性,疾病由多因素诱发,但病因及发病机制尚未研究清楚。已经发现的与强直性脊柱炎密切相关的基因包括人类白细胞抗原B27(HLA-B27)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、人类白细胞抗原B60(HLA-B60)等,这些致病基因是强制性脊柱炎发病的遗传因素。RNA测序(RNA-Seq)更加全面、精确、经济及可行,RNA测序是第二代测序技术,成本低、精度高、测序快。RNA测序能够鉴别差异表达基因(DEGs)并精确定量外显子及其亚型。既往的研究已经用RNA测序来识别疾病的相关基因,但尚没有对强直性脊柱炎进行RNA测序的报道。通过RNA测序,可以筛选AS患者外周血差异表达基因,并构建功能注释、蛋白质互作网络及转录调控网络。研究目的筛选强直性脊柱炎患者的差异表达基因,并构建功能注释、蛋白质互作网络及转录调控网络,发现一些有意义的致病基因,并探索其生物学功能。研究方法1.血标本总RNA提取:匀浆处理、氯仿萃取、RNA纯...
【文章来源】:山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:157 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
AS患者前50位的差异表达基因热图像
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【参考文献】:
期刊论文
[1]PCR-RFLP技术与结合SYBR GreenⅠ荧光染料的实时荧光PCR技术对HBV拉米夫定耐药基因检测效果分析[J]. 卜范峰,朱晓艳,彭德志,王睿,田欣欣,王燕,周永坤. 山东医药. 2018(08)
[2]基于Cytoscape等生物信息学分析软件预测荜茇明碱抗肿瘤靶基因[J]. 滕文静,李洪霖,李雁. 广州中医药大学学报. 2017(05)
[3]柚皮素对破骨细胞特异性基因及OPG/RANKL/RANK表达的影响[J]. 吴新涛,石晶,高乐才,吴文元,庞石磊. 河北医药. 2017(02)
[4]RUNX1基因与肿瘤关系的研究进展[J]. 李娜,李勇,巩平. 大连医科大学学报. 2016(06)
[5]原发性骨质疏松症的骨骼免疫机制研究进展[J]. 刘连勇,郑胜喜,甄燕,赵东宝,胡晓晖. 中国骨质疏松杂志. 2016(07)
[6]炎症状态下NF-κB-mTOR通路及转录因子RUNX1调控肾小管上皮细胞DC-SIGN表达研究[J]. 罗茂财,周思源,冯丹颖,王红艳,许春娣,周同. 现代免疫学. 2016(03)
[7]猪戊型肝炎病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立[J]. 闫蕾,涂亚斌,李海,张交儿,王刚,刘永刚,陈志宝,蔡雪辉. 中国预防兽医学报. 2016(04)
[8]连接酶检测反应技术应用于乙型肝炎病毒拉米夫定耐药和阿德福韦耐药突变的研究[J]. 单幼兰,江培学. 暨南大学学报(自然科学与医学版). 2015(06)
[9]ERAP1基因单核苷酸多态性与中国汉族人群强直性脊柱炎的易感性关联分析[J]. 曲哲,钱邦平,邱勇,季明亮,江华,王斌,俞杨,朱泽章,蒋军,毛赛虎. 中国脊柱脊髓杂志. 2015(09)
[10]翻译后组蛋白乙酰化与骨代谢的研究进展[J]. 邓展涛,金洁雯,徐海栋,赵建宁. 临床与病理杂志. 2015(08)
博士论文
[1]Runx1及其共转录因子Cbfβ在成骨细胞分化及骨发育中作用的研究[D]. 王祎萍.浙江大学 2014
[2]Runx1在脑死亡供体肝脏中作用机制研究[D]. 赵杰.中南大学 2014
[3]TNF-α对RANKL体外诱导破骨细胞分化的促进作用及其机制探讨[D]. 夏琳.山东大学 2013
本文编号:3475884
【文章来源】:山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:157 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
AS患者前50位的差异表达基因热图像
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【参考文献】:
期刊论文
[1]PCR-RFLP技术与结合SYBR GreenⅠ荧光染料的实时荧光PCR技术对HBV拉米夫定耐药基因检测效果分析[J]. 卜范峰,朱晓艳,彭德志,王睿,田欣欣,王燕,周永坤. 山东医药. 2018(08)
[2]基于Cytoscape等生物信息学分析软件预测荜茇明碱抗肿瘤靶基因[J]. 滕文静,李洪霖,李雁. 广州中医药大学学报. 2017(05)
[3]柚皮素对破骨细胞特异性基因及OPG/RANKL/RANK表达的影响[J]. 吴新涛,石晶,高乐才,吴文元,庞石磊. 河北医药. 2017(02)
[4]RUNX1基因与肿瘤关系的研究进展[J]. 李娜,李勇,巩平. 大连医科大学学报. 2016(06)
[5]原发性骨质疏松症的骨骼免疫机制研究进展[J]. 刘连勇,郑胜喜,甄燕,赵东宝,胡晓晖. 中国骨质疏松杂志. 2016(07)
[6]炎症状态下NF-κB-mTOR通路及转录因子RUNX1调控肾小管上皮细胞DC-SIGN表达研究[J]. 罗茂财,周思源,冯丹颖,王红艳,许春娣,周同. 现代免疫学. 2016(03)
[7]猪戊型肝炎病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立[J]. 闫蕾,涂亚斌,李海,张交儿,王刚,刘永刚,陈志宝,蔡雪辉. 中国预防兽医学报. 2016(04)
[8]连接酶检测反应技术应用于乙型肝炎病毒拉米夫定耐药和阿德福韦耐药突变的研究[J]. 单幼兰,江培学. 暨南大学学报(自然科学与医学版). 2015(06)
[9]ERAP1基因单核苷酸多态性与中国汉族人群强直性脊柱炎的易感性关联分析[J]. 曲哲,钱邦平,邱勇,季明亮,江华,王斌,俞杨,朱泽章,蒋军,毛赛虎. 中国脊柱脊髓杂志. 2015(09)
[10]翻译后组蛋白乙酰化与骨代谢的研究进展[J]. 邓展涛,金洁雯,徐海栋,赵建宁. 临床与病理杂志. 2015(08)
博士论文
[1]Runx1及其共转录因子Cbfβ在成骨细胞分化及骨发育中作用的研究[D]. 王祎萍.浙江大学 2014
[2]Runx1在脑死亡供体肝脏中作用机制研究[D]. 赵杰.中南大学 2014
[3]TNF-α对RANKL体外诱导破骨细胞分化的促进作用及其机制探讨[D]. 夏琳.山东大学 2013
本文编号:3475884
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