菊花DNA甲基化相关酶基因鉴定及MET1- RNAi 材料转录组分析

发布时间：2021-11-04 14:06

　　菊花（Chrysanthemum×morifolium Ramat）是世界上重要的观赏植物之一,具备观赏、食用、药用和茶用等多种价值。作为一种起源于我国的重要花卉,菊花变异之丰富在栽培植物中是比较罕见的,而且是在只有1600多年的栽培历史中发生如此巨大变化,所以这种变异起源的问题一直是菊花研究者普遍关注的一个重要命题。DNA甲基化是研究相对较多的表观遗传修饰之一,涉及许多生物学过程,包括转座子沉默和激活、基因印记和染色体失活,其在调控植物的生长发育方面有着重要的作用。DNA甲基化与菊花各种变异性状的形成是否发挥作用,是需要探讨的课题。而对菊花DNA甲基化修饰相关酶基因进行鉴定与分析是解析这一问题的重要基础。本研究以菊花‘金背大红’、‘野菊（菊花脑,Chrysanthemum×nankingense）’和MET1干涉的菊花‘紫精灵’为实验材料。对‘金背大红’和‘菊花脑’的测序数据进行生物信息学分析,初步鉴定了菊花DNA甲基转移酶和去甲基化酶基因,荧光定量PCR技术检测了其在不同组织和不同菊花品种中的表达量。此外,对MET1-_RNAi材料进行转录组测序,从转录水平上揭... 

【文章来源】：河南大学河南省

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
1 绪论
    1.1 菊花
    1.2 表观遗传学
    1.3 植物DNA甲基化
        1.3.1 DNA甲基化的特点
        1.3.2 DNA甲基化的类型
        1.3.3 DNA去甲基化
        1.3.4 主要的DNA甲基转移酶和去甲基化酶
    1.4 DNA甲基化的研究
        1.4.1 DNA甲基化对植物表型和种子萌发的影响
        1.4.2 DNA甲基化与春化作用
        1.4.3 DNA甲基化对植物基因组防御的作用
        1.4.4 DNA甲基化参与植物逆境胁迫的调控
    1.5 高通量测序技术
    1.6 转录组测序技术发展
    1.7 本研究目的及研究内容
2 植物材料和实验方法
    2.1 植物材料
        2.1.1 三代测序材料及实时荧光定量PCR所需的材料
        2.1.2 转录组测序所需的材料
    2.2 实验方法
        2.2.2 DNA甲基化相关酶基因鉴定的实验方法
        2.2.3 MET1-_(RNAi)材料转录组分析的实验方法
3 结果分析
    3.1 菊花DNA甲基转移酶和去甲基化酶基因的鉴定及表达分析
        3.1.1 DNA甲基转移酶和去甲基酶基因的理化性质分析和保守结构域分析
        3.1.2 DNA甲基转移酶和去甲基化酶基因的系统发育树分析
        3.1.3 DNA甲基转移酶和去甲基化酶基因在“金背大红”的不同组织及不同品种的表达分析
        3.1.4 DNA甲基转移酶和去甲基化酶基因在“菊花脑”不同组织的表达分析
    3.2 MET1-_(RNAi)材料转录组分析
        3.2.1 转录组测序产量分析
        3.2.2 基因注释与功能分类
        3.2.3 差异表达基因分析
        3.2.4 MET1-_(RNAi)材料与对照组差异表达基因qRT-PCR结果验证
4 讨论
    4.1 菊花DNA甲基转移酶和去甲基化酶基因鉴定及系统发育树分析
    4.2 菊花DNA甲基化相关酶基因表达分析
    4.3 MET1-_(RNAi)材料转录组分析
5 结论
参考文献
致谢
发表论文目录
附录


【参考文献】：
期刊论文
[1]植物组织培养过程中的DNA甲基化研究进展[J]. 石鹏,王永,金龙飞,张大鹏,赵志浩,曹红星,雷新涛.  热带作物学报. 2019(01)
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博士论文
[1]丹参全基因组DNA甲基化谱及DNA甲基转移酶与去甲基化酶基因的系统分析[D]. 李江.北京协和医学院 2018
[2]干旱胁迫诱导水稻产生可遗传表观遗传变异及其相关生理代谢变化的研究[D]. 张春玉.东北师范大学 2013
[3]基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究[D]. 王丽鸳.中国农业科学院 2011
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硕士论文
[1]低温胁迫对桂花生理生化及表观遗传修饰的影响[D]. 沈尧.河南大学 2014
[2]人参根、茎、叶转录组测序及差异表达基因分析[D]. 林艳玲.长春中医药大学 2013
[3]外源肉桂酸对干旱胁迫下两个黄瓜品种叶片DNA甲基化的影响[D]. 孙维娟.山东农业大学 2012
[4]水稻甲基化转移酶OsMET1-1和OsMET1-2基因串联RNAi载体在粳稻中的表达[D]. 路云侠.东北师范大学 2009



本文编号：3475882