水稻OsGBP转录因子家族基因的功能研究及雌雄配子不育基因MFS的定位与功能分析
发布时间：2021-11-13 10:41
转录调控机制是真核生物基因表达中的重要调节方式,在植物的生长发育、抗逆和抗病响应、信号转导以及次生代谢过程中发挥着重要的作用。转录因子（Transcription factor）,也称反式作用因子,它作为转录调控的主体,在植物基因组中大量存在,并参与了植物的众多生物学过程。GAGA-binding protein（GBP）是植物特有的一类转录因子,能特异地与GAGA重复序列结合而调控下游基因的表达。本研究通过生物信息学方法,从全基因组水平上对水稻OsGBP基因家族进行了鉴定以及对该家族进行进化分析;通过转基因方法,对其水稻家族基因的功能进行了研究,主要结果如下:1.水稻基因组中OsGBP家族含4个同源基因,系统发生进化分析表明该家族被划分为两个亚类,其中OsGBP1属于第一亚类,而OsGBP2、OsGBP3、OsGBP4属于第二个亚类,并且串联分布在第10染色体上。基因相似性分析发现OsGBP1同其它基因最高相似度为53%,其它三个基因相似度在82%以上,并且OsGBP2与OsGBP3是两个相同拷贝的基因;氨基酸序列分析显示OsGBP家族的蛋白在C端含有一个非常保守的锌指类的DNA-b...
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：166 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
水稻和拟南芥GBP蛋白的序列比对用CLUSTALW软件对来源于拟南芥和水稻的GBP蛋白序列进行多序列比对
3 GBPs 的共线性分析于水稻、高粱、玉米、大麦和短柄草的 GBPs 的共线分析. 3 Extensive microsynteny of GBPs across several speciesza sativa (Os), Sorghum bicolor (Sb), Zea mays (Zm), Hordeum vulgare (Hv), Brachypodium distachyon). Orthologues of GBPs in these four grasses are shown in the circle. Color Lines show syntenic relationships.2 OsGBP1 基因的功能分析2.1 osgbp1 突变体影响幼苗生长和种子粒型为了研究 OsGBP1 基因的功能，本研究从韩国 Postech 突变体库中获得一编号为 1B-11615.L 的突变体，该突变体的 T-DNA 插入位点位于 OsGBP1 的二个内含子，位于 ATG 下游 662bp 处（图 4A）。根据 T-DNA 插入位点两端
OsGBP 转录因子家族基因的功能研究及雌雄配子不育基因 MFS 的定位与功则为纯合 T-DNA 插入，若引物 LP/RP 扩增为阳性，而 RP分离的野生型植株，若两组引物均扩增为阳性，则为杂合。根据 DNA 检测结果，抽提突变体叶片 RNA，检测 OsG发现在突变体 osgbp1 中 OsGBP1 基本不表达（图 4B, C）录Ⅰ附表 1。
【参考文献】：
期刊论文
[1]OsGRF4 controls grain shape, panicle length and seed shattering in rice[J]. Pingyong Sun,Wuhan Zhang,Yihua Wang,Qiang He,Fu Shu,Hai Liu,Jie Wang,Jianmin Wang,Longping Yuan,Huafeng Deng. Journal of Integrative Plant Biology. 2016(10)
[2]Stamen specification and anther development in rice[J]. WILSON Zoe A. Chinese Science Bulletin. 2009(14)
[3]植物转录因子的结构与调控作用[J]. 刘强,张贵友,陈受宜. 科学通报. 2000(14)
[4]水稻胚囊形成过程与分期[J]. 刘向东,徐雪宾,卢永根,徐是雄. 中国水稻科学. 1997(03)
硕士论文
[1]水稻GAGA Element的预测与分析[D]. 张韬.电子科技大学 2008
本文编号：3492873
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：166 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
水稻和拟南芥GBP蛋白的序列比对用CLUSTALW软件对来源于拟南芥和水稻的GBP蛋白序列进行多序列比对
3 GBPs 的共线性分析于水稻、高粱、玉米、大麦和短柄草的 GBPs 的共线分析. 3 Extensive microsynteny of GBPs across several speciesza sativa (Os), Sorghum bicolor (Sb), Zea mays (Zm), Hordeum vulgare (Hv), Brachypodium distachyon). Orthologues of GBPs in these four grasses are shown in the circle. Color Lines show syntenic relationships.2 OsGBP1 基因的功能分析2.1 osgbp1 突变体影响幼苗生长和种子粒型为了研究 OsGBP1 基因的功能，本研究从韩国 Postech 突变体库中获得一编号为 1B-11615.L 的突变体，该突变体的 T-DNA 插入位点位于 OsGBP1 的二个内含子，位于 ATG 下游 662bp 处（图 4A）。根据 T-DNA 插入位点两端
OsGBP 转录因子家族基因的功能研究及雌雄配子不育基因 MFS 的定位与功则为纯合 T-DNA 插入，若引物 LP/RP 扩增为阳性，而 RP分离的野生型植株，若两组引物均扩增为阳性，则为杂合。根据 DNA 检测结果，抽提突变体叶片 RNA，检测 OsG发现在突变体 osgbp1 中 OsGBP1 基本不表达（图 4B, C）录Ⅰ附表 1。
【参考文献】：
期刊论文
[1]OsGRF4 controls grain shape, panicle length and seed shattering in rice[J]. Pingyong Sun,Wuhan Zhang,Yihua Wang,Qiang He,Fu Shu,Hai Liu,Jie Wang,Jianmin Wang,Longping Yuan,Huafeng Deng. Journal of Integrative Plant Biology. 2016(10)
[2]Stamen specification and anther development in rice[J]. WILSON Zoe A. Chinese Science Bulletin. 2009(14)
[3]植物转录因子的结构与调控作用[J]. 刘强,张贵友,陈受宜. 科学通报. 2000(14)
[4]水稻胚囊形成过程与分期[J]. 刘向东,徐雪宾,卢永根,徐是雄. 中国水稻科学. 1997(03)
硕士论文
[1]水稻GAGA Element的预测与分析[D]. 张韬.电子科技大学 2008
本文编号：3492873
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3492873.html
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