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基于数据库分析CK-19基因在乳腺癌中的表达及与患者预后相关性

发布时间:2021-11-13 18:12
  目的探讨肿瘤芯片数据库(Oncomine),生存分析数据库(Kaplan-Meier Plotter)和蛋白-蛋白相互作用数据库(String)平台中CK-19基因在乳腺癌中的表达及临床意义。方法分别对Oncomine、KaplanMeier Plotter和String进行乳腺癌CK-19基因表达情况数据挖掘。比较乳腺癌组织和对应正常组织中CK-19mRNA表达是否存在差异。根据CK-19高低表达情况绘制生存曲线进行CK-19与乳腺癌患者预后关系分析。同时分析CK-19蛋白共表达网路,推测CK-19可能的相互作用蛋白及其生物学功能。结果检索Oncomine数据库发现,在乳腺癌中有9个数据集均显示乳腺癌中CK-19高表达。CK-19 mRNA聚类分析显示,CK-19mRNA与KRT18,ERBB3,PRR5等基因mRNA存在共表达;在String蛋白互作数据库中对CK-19蛋白共表达进行了分析,结果显示CK-19与KRT8,KRT18等蛋白具有共表达关系。Oncomine数据库中,有3项基因表达芯片数据关于CK-19 mRNA在乳腺癌与正常组织中的差异表达分数数据,结果显示乳腺癌组织中... 

【文章来源】:转化医学杂志. 2020,9(04)

【文章页数】:4 页

【部分图文】:

基于数据库分析CK-19基因在乳腺癌中的表达及与患者预后相关性


CK-19基因mRNA在多种实体肿瘤与对应正常组织中的整体表达

基因,乳腺癌,聚类分析,蛋白


Oncomine数据库中对CK-19 mRNA在乳腺癌中的共表达基因进行聚类分析显示,CK-19 mRNA与KRT18,ERBB3,PRR5等基因mRNA存在共表达,提示上述基因在生物学功能上可能具相关性,图2。进一步在String蛋白数据库中对CK-19蛋白共表达进行了分析,结果显示CK-19与KRT8,KRT18等蛋白具有共表达关系,图3。图3 CK-19基于String数据库的基因共表达分析

基因,乳腺癌,数据库,乳腺


CK-19基于String数据库的基因共表达分析

【参考文献】:
期刊论文
[1]非小细胞肺癌患者淋巴组织CK19、TTF-1的表达及其临床意义[J]. 梁新梅,梁克诚,芩玉兰,龚广,陆薇,杨莹.  内科. 2019(01)
[2]乳腺癌多基因检测及研究进展[J]. 王君,何志贤.  转化医学杂志. 2019(01)
[3]21基因检测对激素受体阳性类乳腺癌的预后及治疗指导作用[J]. 黄晶晶,李顺波,郭丹.  转化医学杂志. 2019(01)
[4]联合检测CK19、BRAF及FAK在甲状腺乳头状癌中的诊断价值[J]. 史国恩,包万智,李轶春,陈晓明,蔡汉章,潘能武.  系统医学. 2019(01)
[5]CK-19mRNA表达与乳腺癌关系的研究[J]. 黄英,董秀玲,高亚杰.  临床肿瘤学杂志. 2008(11)



本文编号:3493478

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