GLDN基因在结直肠癌中的表达及其意义

发布时间：2021-11-13 19:39

　　目的探讨GLDN基因在结直肠癌中的表达及其意义。方法从GEO数据库下载GSE50760数据包。利用R语言对数据包进行分析,得出与结直肠癌相关的差异表达基因,并绘制热图和火山图。运用starbase在线数据库对获得的差异基因在结直肠癌与癌旁组织中的表达水平进行分析。进一步利用Onco Lnc在线数据库进行差异基因与结直肠癌的预后分析。在临床样本层面,利用q PCR及免疫组化技术探索GLDN基因在结直肠癌中的表达差异。结果通过分析GSE50760数据包获得前100个差异表达的基因。利用starbase在线数据库对这100个差异表达基因的表达水平进行分析发现,GLDN基因在结直肠癌组织中的表达比癌旁组织明显下调。生存分析也提示,当GLDN基因高表达时,结直肠癌患者的预后相对较好。q PCR及免疫组化技术也验证了GLDN临床样本的癌旁组织中高表达,并且GLDN表达量与患者预后密切相关。结论 GLDN是结直肠癌的潜在抑癌基因,并且可以作为判断结直肠癌患者预后的重要生物学标记物。 

【文章来源】：临床和实验医学杂志. 2020,19(16)

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

GSE50760基因芯片数据分析

OncoLnc(包含220例CRC和220例癌旁组织)在线数据库对GLDN基因在CRC患者中的表达数据进行生存分析，结果显示，相对于GLDN基因高表达组，GLDN基因低表达患者的预后相对较好，差异具有统计学意义(P=0.008)。见图2。2.3 GLDN在临床样本中的表达差异

运用q PCR技术对CRC临床样本中的GLDN基因表达差异进行验证，结果显示，GLDN在CRC组织中低表达(见图3A)。免疫组化结果也显示，GLDN在CRC组织中低表达(见图3B)。多因素相关性分析发现，GLDN基因的表达与肿瘤大小(P=0.018)和临床分期(P=0.016)有关。见表1。3 讨论


本文编号：3493597