SELL基因与蛋白质的生物信息学分析

发布时间：2021-11-14 07:48

　　[目的]分析SELL基因的基因表达情况、Cp G岛、启动子、转录因子结合位点;分析SELL蛋白的亚细胞定位、同源性、理化性质、信号肽和跨膜区域、蛋白质二三级结构及相互作用蛋白。[方法]利用Promoter2.0、MethPrime、Ali Baba2.1、Prot Param、Prot Scale、Clustal Omega、PSORTII、Signal P4.1、TMHMM、SWISS-MODEL、STRING等生物信息学软件对SELL进行系统分析。[结果]SELL基因至少含有1个启动子,启动子区不存在Cp G岛。SELL基因在人体多种正常组织中均有表达,在全血中表达最高。SELL蛋白是有信号肽由372个氨基酸组成的、有跨膜区域的亲水蛋白。主要定位于细胞质和细胞核,二级结构以随机卷曲为主。分析结果显示SELPLG、MADCAM1、CD34、CD44、PTPRC、CD69、CCR7、ITGAM、FOXP3、IL7R蛋白可能与SELL蛋白存在相互作用。[结论]对人SELL基因和编码蛋白进行生物信息学分析,获得了基因的特征及蛋白发挥的功能。 

【文章来源】：生物技术. 2020,30(06)

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

SELL基因在多种组织中的表达

EMBOSS CPGplot软件预测CpG岛结果

Meth Prime软件预测CpG岛结果

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]探讨DDB2基因对痤疮增生性瘢痕形成及TGF-β/Smads信号通路的影响[D]. 熊梦媛.西南医科大学 2019
[2]SELL基因在中国汉族重型痤疮分子水平的研究[D]. 郑琪.昆明医科大学 2015



本文编号：3494243