前列腺癌中致病基因与核心转录因子的识别与功能分析

发布时间：2021-11-16 18:41

　　目的:通过分析识别前列腺癌功能基因模块并挖掘影响这些模块的核心转录因子与关键基因,探讨前列腺癌的发病机制。方法:通过加权基因共表达网络分析（weighted gene co-expressed network analysis, WGCNA）识别与前列腺癌病理分期、Gleason分级等重要临床特征相关的枢纽基因模块,利用OPOSSUM在线工具分析富集调控这些基因的转录因子,应用通路富集分析和蛋白质相互作用网络分析识别前列腺癌的关键基因及其对前列腺癌患者重要临床特征和无病生存率（disease free survival,DFS）的影响。结果:识别出3个枢纽模块,分别与前列腺癌病理T分期、病理N分期、Gleason分级高度相关。进一步筛选得到13个前列腺癌核心转录因子参与调控这3个枢纽模块。这些转录因子调控的差异表达基因显著富集于Calcium、c GMP-PKG、cAMP前列腺癌相关信号通路,其组成的基因网络中14个关键基因（PRKG1、PRKG2、CYSLTR2、GRPR、CHRM3、ADCY5、ADRA1D、EDNRA、EDNRB、CYSLTR2、AGTR1、GRPR、GRIA1和... 

【文章来源】：中国肿瘤生物治疗杂志. 2020,27(10)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

前列腺癌异常样本检测与WGCN构建

以上结果表明，筛选的核心转录因子通过调控枢纽模块对前列腺癌起重要作用，并且前列腺癌中转录因子的活性高低往往会导致调控靶基因数目的变化。图3 13个核心转录因子表达(A)和调控DEG的情况分析(B)

13个核心转录因子表达(A)和调控DEG的情况分析(B)

【参考文献】：
期刊论文
[1]FOXM1在结直肠癌中的作用及其机制[J]. 王思毓,刘珊,蒋永新.  中国肿瘤生物治疗杂志. 2020(05)
[2]前列腺癌Gleason分级[J]. 周桥.  中华病理学杂志. 2005(04)

硕士论文
[1]基于加权基因共表达网络的肿瘤中特异表达基因筛选方法研究[D]. 刘毅.哈尔滨工程大学 2018



本文编号：3499373