基因AL360181.1调节结直肠癌进展及预后的生物信息学分析
发布时间:2021-11-20 20:00
目的通过生物信息学方法分析基因AL360181.1在结直肠癌进展及预后中的作用,并进一步预测可能的分子机制。方法从TCGA数据库下载结直肠癌基因表达数据及临床数据,应用Perl及R软件对数据整理后筛选出差异表达的基因,进一步对差异基因批量化行生存、独立预后及临床病理相关性分析,选取相关性最强的差异基因作为目的基因;分析目的基因的表达与结直肠癌不同临床病理特征的相关性及对患者预后的影响;采用R软件对不同的临床病理特征行独立预后分析;分析目的基因以及不同临床病理与患者生存预后的关系;应用GSEA对目的基因行KEGG通路富集分析并利用R软件分析目的基因与潜在靶基因的相关性,预测目的基因调控结直肠癌进展及预后可能的机制。结果基因AL360181.1在结直肠癌组织中显著高表达(P<0.01);AL360181.1与结直肠癌的分级、TNM分期具有相关性(P<0.05);基因AL360181.1、年龄、肿瘤分级、TNM分期与患者预后相关(P<0.05),且基因AL360181.1及年龄可作为评价患者预后的独立风险因子;基因AL360181.1的表达水平、患者年龄、分级及TNM分期与...
【文章来源】:西安交通大学学报(医学版). 2020,41(05)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
TCGA数据库中基因AL360181.1在结直肠癌中的差异表达
分析不同临床病理特征与基因AL360181.1表达之间的关系,结果显示,基因AL360181.1的表达与患者肿瘤分级、TNM分期呈正相关(P<0.05),与患者年龄、性别无关(P>0.05,图2)。推测基因AL360181.1可作为调节结直肠癌进展并影响患者预后的潜在靶标。2.4 临床病理特征独立预后分析情况
对各临床病理特征进行单因素独立预后分析的结果显示,基因AL360181.1、年龄、分级及TNM分期与患者预后相关(P<0.05),患者性别与预后无关(P=0.653,图3A);对各临床病理特征的多因素独立预后分析结果显示,基因AL360181.1、年龄可作为评价患者预后的独立危险因子(图3B)。以上结果提示,基因AL360181.1可作为调节结直肠癌进展及预后的潜在靶标。2.5 生存分析结果
本文编号:3508013
【文章来源】:西安交通大学学报(医学版). 2020,41(05)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
TCGA数据库中基因AL360181.1在结直肠癌中的差异表达
分析不同临床病理特征与基因AL360181.1表达之间的关系,结果显示,基因AL360181.1的表达与患者肿瘤分级、TNM分期呈正相关(P<0.05),与患者年龄、性别无关(P>0.05,图2)。推测基因AL360181.1可作为调节结直肠癌进展并影响患者预后的潜在靶标。2.4 临床病理特征独立预后分析情况
对各临床病理特征进行单因素独立预后分析的结果显示,基因AL360181.1、年龄、分级及TNM分期与患者预后相关(P<0.05),患者性别与预后无关(P=0.653,图3A);对各临床病理特征的多因素独立预后分析结果显示,基因AL360181.1、年龄可作为评价患者预后的独立危险因子(图3B)。以上结果提示,基因AL360181.1可作为调节结直肠癌进展及预后的潜在靶标。2.5 生存分析结果
本文编号:3508013
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