中国大陆手足口病相关的肠道病毒71型基因特征分析

发布时间：2021-11-20 18:11

　　目的了解中国大陆肠道病毒71型（EV71）VP1区基因特征和基因亚型,为更好地预防和控制儿童感染EV71型手足口病提供参考。方法在GenBank检索并下载中国大陆1996至2018年全部EV71病毒株（除去重复序列,共计3 102株）及已知EV71基因亚型参考株（30株）的VP1基因序列,使用MEGA 6.0软件进行比对分析和构建种系进化树,分析VP1蛋白氨基酸同源性、遗传变异情况和基因亚型。结果 3 102株分离株（不包括参考株）的同源性为88.33%～100.00%,包括参考株的同源性为87.34%～100.00%,与疫苗株H07的氨基酸同源性为93.47%～100.00%,与疫苗株FY7VP5及FY-23K-B的氨基酸同源性均为93.04%～100.00%。2000年起,EV71的流行株以C4亚型为主,2005至2018年以C4a亚型为主,C4b亚型次之,其他亚型散在出现。EV71的VP1区部分氨基酸变异频率较高,包括A293S（16.75%）、S283T（15.73%）、A289T（12.44%）、E98K（7.22%）、H22Q（6.66%）、N31D（4.50%）和V249... 

【文章来源】：中华临床感染病杂志. 2020,13(05)CSCD

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【参考文献】：
期刊论文
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[2]2008-2010年湖南省哨点医院手足口病病原学检测结果及基因特征分析[J]. 黄威,周帅锋,张帆,陈雨,刘运芝,檀晓娟,许文波,张红.  实用预防医学. 2011(05)
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