基于基因组重测序和基因编辑技术的瓯江彩鲤黑斑体色遗传机制研究

发布时间：2024-06-30 02:43

　　体色是动物最为明显的表型性状,具有多种生物学功能,同时也是自然选择和人工选择的目标之一。脊椎动物拥有最多的色素类型及图案,其中又以硬骨鱼类的色素模式最为丰富。由于脊椎动物的色素细胞均起源于神经嵴,而神经嵴又涉及到许多种类细胞的发育,因此研究鱼类体色的形成机制以及进化过程,可以为脊椎动物的进化提供深入见解。鱼类体色的形成涉及到色素的合成和转移、色素细胞的分化和迁移等过程,这些生物学活动中涉及到许多调控通路和基因的作用,同时也受到环境的影响。硬骨鱼类中,鲤科鱼类是体色类型最为丰富的种群之一。经过多年选育,本实验室已经建立了4种体色瓯江彩鲤的纯系,包括“大花”(红色底色黑色斑块,RB)、“粉花”(白色底色黑色斑块,WB)、“全红”(红色,WR)和“粉玉”(白色,WW),并且4种体色可以稳定遗传给下一代,这为瓯江彩鲤的体色遗传研究奠定了基础。为初步探明各体色鲤的进化关系,筛选与鲤体色相关的候选基因,以及体色相关基因的调控作用,本论文以上述4种体色瓯江彩鲤、兴国红鲤、荷包红鲤及野鲤为实验材料,利用基因组重测序技术挖掘鲤的体色相关基因,并通过基因编辑技术,验证这些基因的功能,相关研究成果如下:1....

【文章页数】：99 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图1-16种色素细胞注：A为黑色素细胞，B为黄色素细胞，C为蓝色素细胞，D为虹彩色素细胞，E为红色素细胞，F为白色素细胞

上海海洋大学博士学位论文2性条纹形成的关键，许多细胞表面分子与信号系统是这些交互作用的介质[25-29]。这些研究都为鱼类体色研究提供了重要的生物学信息。图1-16种色素细胞注：A为黑色素细胞，B为黄色素细胞，C为蓝色素细胞，D为虹彩色素细胞，E为红色素细胞，F为白色素细胞Fig....

图1-2黑色素合成通路Figure1-2Melaninsynthesispathway

上海海洋大学博士学位论文3在各类色素的合成机制中，当属黑色素合成通路的研究最为广泛和深入。黑色素通路的末端最终合成真黑素和褐黑素，两种色素之间的比例受到Agouti[35]、MC1R[36]等多种基因的调控。真黑素所占比例越高，呈现的颜色越偏向黑色，褐黑素所占比例越高，颜色越偏向....

图2-1文库构建与测序流程

上海海洋大学博士学位论文13Samtools软件将比对结果按照染色体位置进行进一步的排序，利用Picard软件对由于PCR过程中产生的重复reads进行标记，避免影响后续的变异检测。图2-1文库构建与测序流程Figure2-1Thebasicprcessoflibrarycons....

图2-27种鲤的主成分分析

上海海洋大学博士学位论文17Disruptiveinframeinsertion8370.0000Stopretainedvariant3750.0000Downstreamgenevariant3,708,6340.1281Synonymousvariant398,9130.0....

本文编号：3998268