基于GTEx数据库对COVID-19结合基因ACE2的分析

发布时间：2021-11-23 11:25

　　目的探讨血管紧张素转化酶2受体基因（ACE2）在正常人组织器官中的表达,结合新型冠状病毒肺炎（COVID-19）患者临床症状分析两者间的关系,利用生物信息学方法揭示ACE2可能的效应通路。方法从基因型-组织表达（GTEx）数据库下载ACE2在人体各组织的表达数据,并用R软件对数据进行处理。通过GO富集分析其相关机制,并探讨长链非编码RNA和ACE2的相关性。结果 ACE2在正常人体不同器官均有一定程度的表达,表达量从高到低依次为:心、肾、肺、肝、胃、脑、脾,差异有统计学意义（F=820.03,P<0.001）。ACE2在不同组织中也有一定程度的表达,表达量从高到低依次为:睾丸、脂肪、神经、肌肉、血,差异有统计学意义（F=3592.75,P<0.001）。GO富集结果提示,基因ACE2主要参与调节肽和激素的分泌、调节蛋白质异二聚活性;同时长链非编码LINCO2082 与ACE2成显著正相关性。结论　ACE2在人体各组织器官均有一定程度的表达,可能与COVID-19患者器官损害存在一定的相关性,临床应密切观察。 

【文章来源】：中南药学. 2020,18(09)

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

ACE2在人体组织中的表达

采用R包(ggstatsplot)对ACE2在人体各系统中的表达差异进行对比分析,结果如图2所示。ACE2在睾丸、脂肪组织、肌肉、神经和血里面也有一定的表达(F=3592.75,P<0.001),根据各组织的中位数,ACE2的表达从高到低依次为:睾丸(5.1)>脂肪(1.2)>神经(-1.35)>肌肉(-2.49)>血(-7.51)。2.3 COVID-19感染的临床特点

GO是Gene Ontology的简称,分为分子功能(molecular function,MF)、生物过程(biological process,BP)和细胞组成(cellular component,CC)3个部分。每个部分取10个功能,按P值和相关性大小两个指标进行排序,图中每个点对应一个功能,点的颜色越深,比例值越大,说明ACE2与这个功能的相关性越强。由图3可知,ACE2生物过程中的主要作用是调节肽和激素的分泌,在分子功能中的作用主要是调节蛋白质异二聚体活性,从细胞组成来说,ACE2主要存在于细胞外基质和染色质上。2.5 ACE2与长链非编码RNA的相关性

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3513781