冠心病不稳定性心绞痛血瘀证差异表达谱分析及IL6基因甲基化水平的研究

发布时间：2017-05-08 17:06

  本文关键词：冠心病不稳定性心绞痛血瘀证差异表达谱分析及IL6基因甲基化水平的研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：背景：冠心病血瘀证与微循环障碍、血液高凝滞状态、血小板活化和粘附聚集、血栓形成、免疫功能障碍等现代病理改变等密切相关。同时,冠心病血瘀证基因组学也在mRNA、 miRNA. lncRNA等层面有所研究。但至今尚未完全阐明血瘀证发生的机制,以及可以用于定量诊断的血瘀证生物标志物和用于阐明药物作用的分子靶标。目的：通过生物信息学的方法分析冠心病血瘀证差异表达谱相关的信号通路及关键差异基因,并利用表观遗传学的方法研究冠心病不稳定性心绞痛血瘀证差异基因的DNA甲基化调节机制。方法：本研究在PubMed, CNKI, VIP,万方以及SinoMed数据库中检索冠心病血瘀证差异表达谱的文献,并汇总差异表达谱的结果,应用DAVID平台对差异表达谱基因进行功能注释、功能富集分析、以及通路分析；利用GeneCards对目的基因在亚细胞结构中的分布情况和表达蛋白STRING相互作用网络进行分析。临床纳入不稳定性心绞痛血瘀证患者6例和不稳定型心绞痛非血瘀证患者6例,收集血样,通用型柱式试剂盒法提取基因组DNA, ZYMO RESEARCH试剂盒法重亚硫酸盐处理,UCSC查阅目的基因注释信息,针对目的基因利用Epidesigner设计引物,甲基化特异性PCR, SAP处理,T7DNA聚合酶转录,碱基特异性酶切,最后运用Sequenom公司推出的MassARRAY分子量阵列技术平台检测目的序列甲基化程度。结果：差异表达谱Go的分析结果富集在炎症反应(inflammatory response)这一生物过程。差异表达谱BIOCARTA基因富集的信号通路是“Cells and Molecules involved in local acute inflammatory response",涉及IL6、ITGB2、 C3这三个基因。IL6基因转录起始位点前-1118bp至-826bp序列(IL6_1)中7个位点CpG位点甲基化程度血瘀证组存在高于非血瘀证组的趋势,但差异尚无统计学意义。而IL6基因转录起始位点前-1471bp至-1184bp序列(IL6-2)4个CpG位点甲基化程度血瘀证组与非血瘀证组之间的差异尚不明显。结论：冠心病血瘀证与炎症反应密切相关。IL6基因转录起始位点前2000bp内两段序列的甲基化程度,发现转录起始位点前-1118bp至-826bp序列(IL6_1)中7个位点CpG位点甲基化程度血瘀证组存在高于非血瘀证组的趋势,而IL6基因转录起始位点前-1471bp至-1184bp序列(IL6-2)4个CpG位点甲基化程度血瘀证组与非血瘀证组之间的差异尚不明显。本研究在一定程度上提示DNA甲基化可能调节血瘀证进程。
【关键词】：冠心病 血瘀证 差异表达谱 DNA甲基化 表观遗传学 生物信息学
【学位授予单位】：北京中医药大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R259
【目录】：

• 摘要5-7
• ABSTRACT7-9
• 符号说明9-10
• 第一部分 文献综述10-21
• 冠心病血瘀证基因组学及表观遗传学研究进展10-21
• 1 SNP研究10-11
• 2 基因表达谱研究11-13
• 3 DNA甲基化13-14
• 4 非编码RNA14-16
• 5 表观遗传学研究展望16-18
• 参考文献18-21
• 前言21-25
• 参考文献23-25
• 第二部分 实验研究25-62
• 第一节 基于文献的冠心病血瘀证差异表达谱生物信息学研究25-41
• 材料25-26
• 方法26-27
• 结果27-36
• 小结36
• 讨论36-39
• 参考文献39-41
• 第二节 冠心病不稳定性心绞痛血瘀证差异基因启动子甲基化水平研究41-62
• 材料41-43
• 方法43-47
• 结果47-57
• 小结57
• 讨论57-61
• 参考文献61-62
• 结语62-63
• 致谢63-64
• 在学期间主要研究成果64-65
• 个人简历65

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