猪体细胞核移植早期胚胎的合子基因激活及表观遗传修饰的研究
发布时间:2022-01-09 09:41
在哺乳动物胚胎发育过程中,合子基因激活作为一个里程碑式的事件,对于早期胚胎发育具有十分重要的意义。体细胞核移植(Somatic cell nuclear transfer,SCNT)胚胎中通常存在着异常的合子基因激活现象,异常的表观遗传修饰可能是造成合子基因激活障碍的重要因素之一。本研究以猪SCNT胚胎和体内受精(In vivo fertilization,IVV)胚胎为研究对象,通过单细胞转录组测序和基因芯片(PCR array)检测技术研究了它们早期胚胎发育过程中的合子基因激活情况以及84种表观遗传修饰酶的表达模式。结果显示:(1)猪早期IVV胚胎的转录组呈现动态的变化模式,4细胞之前以母源因子调控为主,在4细胞阶段合子基因启动激活转录。对4种哺乳动物早期胚胎的转录组/表达谱合并分析表明,合子激活是胚胎发育过程中一个物种保守的生物学事件,猪、人、小鼠和牛早期胚胎都具有其特有的合子基因激活时间和基因表达模式。四种哺乳动物合子激活时期的差异表达基因在基因功能和通路上的富集大部分具有共通性,同时也有各自特异性,其中猪与牛最为相似;(2)比较猪IVV和SCNT早期胚胎的转录组图谱发现,猪早...
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:128 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
RNA测序流程图
图 1.2 文库构建原理图Fig 1.2 The schematic diagram of library constructio测序后,将不同文库按照有效浓度及目标下机数据量的 HiSeq/MiSeq 测序。信息学分析流程流程如图 1.3:
图 1.3 生物信息学分析流程图Fig 1.3 The flow diagram of bioinformatic analysis结果母细胞及早期胚胎发育各阶段转录组图谱的建立取了发育各阶段(MII 期卵母细胞、2 细胞、4 细胞、8 细胞及 IVV 胚胎进行转录组测序,并对测序结果进行基因表 R 平台下的 Deseq2 软件包)。主成分分析结果表明,各实复性良好,证明了数据的可靠性(图 1.4)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]小鼠2细胞胚胎基因表达谱分析[J]. 吕志一,孙健红,徐薇,苏峰,权富生,华松,张涌. 西北农业学报. 2010(06)
[2]哺乳动物胚胎基因组表达起始的调控[J]. 陈雯,陈杰,刘红林. 畜牧与兽医. 2003(11)
本文编号:3578460
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:128 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
RNA测序流程图
图 1.2 文库构建原理图Fig 1.2 The schematic diagram of library constructio测序后,将不同文库按照有效浓度及目标下机数据量的 HiSeq/MiSeq 测序。信息学分析流程流程如图 1.3:
图 1.3 生物信息学分析流程图Fig 1.3 The flow diagram of bioinformatic analysis结果母细胞及早期胚胎发育各阶段转录组图谱的建立取了发育各阶段(MII 期卵母细胞、2 细胞、4 细胞、8 细胞及 IVV 胚胎进行转录组测序,并对测序结果进行基因表 R 平台下的 Deseq2 软件包)。主成分分析结果表明,各实复性良好,证明了数据的可靠性(图 1.4)。
【参考文献】:
期刊论文
[1]小鼠2细胞胚胎基因表达谱分析[J]. 吕志一,孙健红,徐薇,苏峰,权富生,华松,张涌. 西北农业学报. 2010(06)
[2]哺乳动物胚胎基因组表达起始的调控[J]. 陈雯,陈杰,刘红林. 畜牧与兽医. 2003(11)
本文编号:3578460
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3578460.html
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