酒精性肝病差异基因的筛选及生物信息学分析

发布时间：2022-01-16 04:21

　　目的筛选酒精性肝病差异表达基因,并进行功能分析,为酒精性肝病发病机制相关的分子标志物及药物靶点提供理论基础。方法从高通量基因表达（GEO）数据库中选取GSE28619,利用GEO2R进行生物信息学分析,筛选差异表达基因,并利用DAVID数据库对差异表达基因进行基因本体（GO）分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;通过STRING数据库和Cytoscape软件构建差异表达基因对应的蛋白质相互作用网络（PPI）,利用MCC算法,筛选出具有高度连接性的核心基因。结果通过对酒精性肝病组与正常肝脏组差异表达基因筛选,共获得357个差异表达基因,其中上调基因190个、下调基因167个。差异表达基因主要涉及细胞外基质-受体相互作用、黏着斑及p53等信号通路,通过PPI和Cytoscape软件筛选出10个具有高度连接性的核心基因。结论通过对酒精性肝病基因芯片数据进行挖掘,从基因水平探讨酒精性肝病发生发展的分子生物学过程,为酒精性肝病发生的机制研究、标志物的筛选提供参考。 

【文章来源】：现代实用医学. 2020,32(06)

【文章页数】：4 页

【参考文献】：
期刊论文
[1]黏着斑激酶在酒精性肝病中作用的研究进展[J]. 刘怡,沈哲,陈李华,虞朝辉,厉有名.  中华肝脏病杂志. 2013 (12)

博士论文
[1]酒精性肝病发生发展的基因组学和蛋白质组学研究[D]. 周宁.浙江大学 2013



本文编号：3591927