基于数据挖掘分析SLC22A1基因在肝细胞癌组织中的表达及其预后意义

发布时间：2022-02-21 08:00

　　目的探讨阳离子转运蛋白1（SLC22A1）基因在肝细胞癌中的表达情况和预后意义。方法用The Human Protein Atlas（HAP）数据库分析SLC22A1蛋白在肝细胞癌中的表达情况。利用Oncomine和GEPIA数据库分析SLC22A1基因在肝细胞癌和肝正常组织中的表达水平。利用GEPIA和Linked Omics数据库分析SLC22A1基因与肝细胞癌患者临床相关性:总生存期（OS）、无瘤生存期（DFS）、病理分期和种族。采用Metascape在线工具对SLC22A1相关基因进行功能和通路富集分析。结果 LC22A1蛋白和m RNA在肝细胞癌组织中显著低于正常组织,且与肝细胞癌预后呈正相关（P<0.001）。肝细胞癌中SLC22A1基因表达水平与预后、病理分期存在显著差异性（P<0.05）,与种族无相关性。功能富集分析显示,SLC22A1基因通过影响小分子分解代谢过程、对异源生物刺激的反应和有机酸生物合成过程等发挥作用。通路富集分析显示,SLC22A1基因通过作用于过氧化物酶体、脂肪酸降解和精氨酸和脯氨酸代谢等通路起作用。结论细胞癌组织中SLC22A1蛋白和m... 

【文章来源】：现代药物与临床. 2020,35(07)

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 资料和方法
    1.1 SLC22A1蛋白差异表达分析方法
    1.2 Oncomine数据库挖掘分析方法
    1.3 TCGA数据库挖掘分析方法
    1.4 肝细胞癌组织中与SLC22A1基因相关性最高的100个基因及富集分析
    1.5 统计学分析
2 结果
    2.1 SLC22A1蛋白在肝细胞癌组织和正常组织中表达情况
    2.2 SLC22A1基因在肝细胞癌组织和正常组织中表达情况
    2.3 GEPIA数据库验证结果
    2.4 SLC22A1基因表达水平与肝细胞癌患者临床相关性分析
    2.5 肝细胞癌组织中SLC22A1相关基因及其富集分析
3 讨论



本文编号：3636835