基于WGCNA方法对三阴乳腺癌预后相关基因的研究

发布时间：2022-02-22 04:17

　　研究背景三阴乳腺癌（triple-negative breast cancer,TNBC）是一种独立临床病理类型的乳腺癌,其肿瘤细胞表面雌激素受体（estrogen receptor,ER）、孕激素受体（progesterone receptor,PR）及人表皮生长因子受体 2（human epidermal growth factor receptor 2,HER-2）均为阴性,约占所有乳腺癌类型的10%～20%。基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analysis,WGCNA）是基于高通量的微阵列技术,在mRNA水平上探索基因网络与疾病或者研究者关注的性状之间的关联关系,致力于寻找与研究目的相关的基因模块及基因。因此,本研究旨在基于WGCNA方法对公共数据库中的TNBC数据进行分析,在mRNA水平上研究基因网络与TNBC预后的关系,探讨影响TNBC预后的相关基因及其发生发展的分子机制。研究目的1.建立基于公共数据库中TNBC样本的基因表达数据库和临床信息数据库;2.构建TNBC的基因共表达网络,确定与其预后相关的基因模块及基因... 

【文章来源】：苏州大学江苏省211工程院校

【文章页数】：63 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
中文摘要
Abstract
引言
对象和方法
    1. 数据库的获取
        1.1 数据来源
        1.2 检索策略
    2. 数据库的建立
    3. 数据预处理
    4. 数据的分析方法
        4.1 加权基因共表达网络分析
        4.2 生存分析
        4.3 富集分析
    5. 数据处理流程
结果
    1. 基本情况
    2. 加权基因共表达网络的构建
    3. 关键基因模块的确定
    4. 生物学过程和通路
    5. 预后相关基因的筛选
讨论与结论
    1. 生物学过程和通路
    2. 枢纽基因
    3. 研究结论
    4. 研究的局限性与展望
参考文献
综述
    参考文献
攻读学位期间发表论文
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]P53、EGFR、Ki67在不同分子分型乳腺癌中表达差异临床意义探讨[J]. 石钰,冉立,李凤虎,常建英,冷建彬,何明媛,罗代琴.  世界最新医学信息文摘. 2018(30)
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[3]136例转移性三阴性乳腺癌患者的临床病理特征与预后分析[J]. 谭晶波,宋艳利,张宏伟.  中国综合临床. 2017 (07)
[4]三阴性乳腺癌分子分型与个体化靶向治疗现状[J]. 徐倩倩,王常珺,孙强.  中华肿瘤防治杂志. 2017(11)
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[7]三阴乳腺癌的研究及治疗进展[J]. 高志艳,李文新.  内蒙古医科大学学报. 2016(03)
[8]三阴性乳腺癌雄激素受体研究进展[J]. 刘晓丽,姜达,崔彦芝.  中国癌症杂志. 2016(05)
[9]三阴乳腺癌的特点及研究进展[J]. 杜娟,阮祥燕.  首都医科大学学报. 2015(04)
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本文编号：3638680