高原鼢鼠p53基因对低氧的应答及对下游靶基因表达调控的特异性

发布时间：2022-07-01 10:15

　　高原鼢鼠（Myospalax baileyi）生活在海拔2 800 m-4 200 m的地区,是世居青藏高原的一种地下鼠,对严重的低氧环境有很强的适应性。p53是一个重要的肿瘤抑制因子,通过一系列下游靶基因调控细胞周期、细胞凋亡、DNA损伤修复和血管生成等,对动物寿命和防癌具有重要的作用。为了进一步探讨高原鼢鼠对高海拔洞道严重低氧环境的适应机制,本文采用RT-PCR技术克隆得到了高原鼢鼠p53的编码区序列,利用生物信息学方法对p53及其下游细胞周期、细胞凋亡、DNA修复相关基因序列进行了进化特异性分析,并以SD大鼠为对照,研究了p53及其下游基因在不同海拔条件下（3 300 m和2 260 m）的表达模式。结果表明:（1）高原鼢鼠p53基因的编码区序列长1179bp,编码372个氨基酸残基。高原鼢鼠p53基因序列与编码的氨基酸序列与甘肃鼢鼠和以色列鼹鼠p53的同源性最高,分别为98.47%、98.98%和93.30%、95.41%;高原鼢鼠与甘肃鼢鼠、以色列鼹鼠、裸鼹鼠和大鼠p53氨基酸序列相比,分别有4、17、48和59处变异,其中在DNA结合域分别有2、3、12和16处变异;高原鼢... 

【文章页数】：143 页

【学位级别】：博士

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中文摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 青藏高原
        1.1.1 青藏高原自然环境
        1.1.2 高原低氧环境对人和动物的影响及其适应
    1.2 地下鼠及其对低氧环境的适应
        1.2.1 地下鼠及其生境特点
        1.2.2 地下鼠对地下洞道生境的适应
        1.2.3 高原鼢鼠及其生境特征
        1.2.4 高原鼢鼠对地下低氧环境的适应
        1.2.5 地下鼠长寿抗癌的机制
    1.3 p53
        1.3.1 p53及其结构
        1.3.2 p53功能
        1.3.3 p53突变
        1.3.4 低氧与p53
        1.3.5 地下鼠与p53
    1.4 本论文的主要科学问题、研究内容、目的及意义
        1.4.1 本论文的主要科学问题
        1.4.2 本论文的研究内容
        1.4.3 本论文的目的及意义
第二章 高原鼢鼠p53基因的克隆及其对不同低氧环境的应答
    2.1 材料与方法
        2.1.1 实验动物
        2.1.2 主要实验仪器
        2.1.3 主要试剂
        2.1.4 实验方法
    2.2 结果
        2.2.1 高原鼢鼠p53基因的克隆及序列分析
        2.2.2 高原鼢鼠p53变异位点分析
        2.2.3 物种树的构建
        2.2.4 高原鼢鼠p53选择压力分析
        2.2.5 高原鼢鼠p53序列进化分析
        2.2.6 高原鼢鼠p53变异位点对其功能影响的评估
        2.2.7 不同海拔条件下高原鼢鼠和SD大鼠组织中p53表达水平
        2.2.8 HIF-1α 与p53结合位点比对分析
    2.3 讨论
第三章 高原鼢鼠p53下游细胞周期相关基因的进化和表达
    3.1 材料与方法
        3.1.1 实验动物
        3.1.2 高原鼢鼠细胞周期相关基因序列获取
        3.1.3 高原鼢鼠细胞周期相关基因序列分析
        3.1.4 高原鼢鼠细胞周期相关基因选择压力、进化分析
        3.1.5 高原鼢鼠细胞周期相关基因变异位点对其功能影响的评估
        3.1.6 表达水平测定
    3.2 结果
        3.2.1 高原鼢鼠细胞周期相关基因序列分析及同源性比对
        3.2.2 高原鼢鼠细胞周期相关基因选择压力分析
        3.2.3 高原鼢鼠细胞周期相关基因序列进化分析
        3.2.4 高原鼢鼠细胞周期相关基因序列变异位点对其功能影响的评估
        3.2.5 高原鼢鼠和SD大鼠肝脏组织中细胞周期基因表达水平
        3.2.6 高原鼢鼠和SD大鼠肺脏组织中细胞周期基因表达水平
        3.2.7 高原鼢鼠和SD大鼠骨骼肌组织中细胞周期基因表达水平
    3.3 讨论
第四章 高原鼢鼠p53下游细胞凋亡相关基因的进化和表达
    4.1 材料与方法
        4.1.1 实验动物
        4.1.2 高原鼢鼠细胞凋亡相关基因序列获取
        4.1.3 高原鼢鼠细胞凋亡相关基因序列分析
        4.1.4 高原鼢鼠细胞凋亡相关基因选择压力、进化分析
        4.1.5 高原鼢鼠细胞凋亡相关基因变异位点对其功能影响的评估
        4.1.6 表达水平测定
    4.2 结果
        4.2.1 高原鼢鼠细胞凋亡相关基因序列分析及同源性比对
        4.2.2 高原鼢鼠细胞凋亡相关基因选择压力分析
        4.2.3 高原鼢鼠细胞凋亡相关基因序列进化分析
        4.2.4 高原鼢鼠细胞凋亡相关基因序列变异位点对其功能影响的评估
        4.2.5 高原鼢鼠和SD大鼠组织中细胞凋亡基因表达水平
    4.3 讨论
第五章 高原鼢鼠p53下游DNA修复相关基因的进化和表达
    5.1 材料与方法
        5.1.1 实验动物
        5.1.2 高原鼢鼠DNA修复相关基因序列获取
        5.1.3 高原鼢鼠DNA修复相关基因序列分析
        5.1.4 高原鼢鼠DNA修复相关基因选择压力、进化分析
        5.1.5 高原鼢鼠DNA修复相关基因变异位点对其功能影响的评估
        5.1.6 表达水平测定
    5.2 结果
        5.2.1 高原鼢鼠DNA修复相关基因序列分析及同源性比对
        5.2.2 高原鼢鼠DNA修复相关基因选择压力分析
        5.2.3 高原鼢鼠DNA修复相关基因序列进化分析
        5.2.4 高原鼢鼠DNA修复相关基因序列变异位点对其功能影响的评估
        5.2.5 高原鼢鼠和SD大鼠组织中DNA修复基因表达水平
    5.3 讨论
第六章 全文总结
    6.1 主要结论
    6.2 论文创新点
    6.3 论文的不足
参考文献
致谢
作者简历


【参考文献】：
期刊论文
[1]青藏高原史前人类定居历史与藏族人群对高原低氧环境的适应机制[J]. 崔超英,祁学斌,欧珠罗布,吴天一,宿兵.  高原科学研究. 2017(01)
[2]藏、汉族中遗传差异与高原低氧适应研究[J]. 李小薇,李翠莹.  中国输血杂志. 2017(08)
[3]祁连山东段高原鼢鼠采食洞道气体研究[J]. 田永亮,牛钰杰,姬程鹏,周延山,楚彬,花立民.  兽类学报. 2017(02)
[4]环境低氧对高原鼢鼠和高原鼠兔肝脏组织VEGFxxx的表达和微血管密度的影响[J]. 魏莲,陈林,许丽娜,魏登邦.  青海大学学报(自然科学版). 2015(03)
[5]利用转录组数据分析高原鼢鼠和裸鼹鼠基因的趋同进化[J]. 邓小弓,王堃,张守栋,苏建平,张同作,林恭华.  兽类学报. 2014(02)
[6]低氧应激下甘肃鼢鼠与SD大鼠心脏抗氧化酶和ATP酶活性的比较[J]. 唐燕红,王剑,李金钢,谢惠春,李涛,何建平.  兽类学报. 2013(02)
[7]细胞凋亡通路研究进展[J]. 赵彦超,顾耘.  现代医学. 2013(04)
[8]模拟高原低氧对p53及其靶基因表达的调节[J]. 王铭洋,赵阳,张圣婷,陈学群,杜继曾.  中国应用生理学杂志. 2013(02)
[9]藏羚羊与藏绵羊心肌、骨骼肌中肌红蛋白含量和乳酸脱氢酶活性的比较[J]. 马兰,杨应忠,靳国恩,格日力.  动物学杂志. 2012(03)
[10]高原习服与低氧预适应[J]. 陈良恩,安瑞卿.  国际病理科学与临床杂志. 2012(02)

博士论文
[1]藏羚羊STAT3、HIF-1α和HIF-2α基因表达的生物学意义[D]. 刘芳.青海大学 2012

硕士论文
[1]高原鼢鼠血红蛋白氧合特性及其分子机制[D]. 蒲鹏.兰州大学 2018
[2]高原鼢鼠和甘肃鼢鼠MDM2转录调节及p53甲基化分析[D]. 杨志.浙江大学 2017
[3]高原鼢鼠洞道气体变化研究[D]. 张小刚.兰州大学 2016
[4]甘肃鼢鼠血氧亲和力与血液酸碱特性研究[D]. 严婷婷.陕西师范大学 2011
[5]高原鼢鼠（Myospalax baileyi）血红蛋白的基因克隆[D]. 刘丹.曲阜师范大学 2010
[6]高原鼢鼠、高原鼠兔的骨骼肌对低氧环境的适应机制[D]. 朱世海.青海大学 2009
[7]高原鼢鼠HIF-1α及HO-1在组织中的季节性表达[D]. 张建梅.青海大学 2007



本文编号：3654052