mTOR复合物（mTORC1和mTORC2）中基因遗传变异与胃癌风险的相关性研究

发布时间：2022-07-09 16:29

　　研究目的mTOR复合物（mTORC1和mTORC2）中基因的单核苷酸多态性与胃恶性肿瘤的遗传易感性的关系。研究方法通过全基因组关联研究（GWAS）数据库来评估mTOR复合物（mTORC1和mTORC2）中的9个候选基因的单核苷酸多态性（SNPs）与胃癌风险的关系,并采用logistic回归模型计算SNPs对胃癌易感性的相关性。结合表达量性状位点（eQTL）分析,筛选出候选SNP。通过不同的模型分层分析候选SNP在不同亚组中胃癌风险之间的相关性。在PubMed、万方数据、中国知网数据库、维普数据库上搜索关于候选靶基因与消化道肿瘤的有关文献,并使用STATA12.0等软件进行Meta分析,评估候选靶基因表达量与消化道肿瘤临床及预后的关联性,通过下载公共数据库TCGA（The Cancer Genome Atlas）中数据,分析候选靶基因在胃癌中表达水平以及与胃癌临床及预后的关系,并在GEO（Gene Expression Omnibus）数据库中验证靶基因在胃癌中表达情况。采用双荧光素酶报告基因实验,探讨靶结合区域SNP的生物学功能。研究结果通过使用全基因组关联研究（GWAS）数据库来评估... 

【文章页数】：66 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
中文摘要
Abstract
中英文主要缩略词对照
绪论
    1.1 胃癌的流行病学
    1.2 胃癌的发病因素与机制研究
    1.3 GWAS数据库概述及在胃癌中的应用
    1.4 mTOR复合体的概述
    1.5 研究方法及目的
第二章 基于GWAS数据库筛选mTOR复合体中与胃癌相关SNPs
    2.1 研究对象
    2.2 选点策略
    2.3 候选SNP与胃癌相关性的分层分析
    2.4 统计学方法
    2.5 结果
        2.5.1 mTOC1/2 复合物的候选基因确定
        2.5.2 候选SNPs的筛选与确定
        2.5.3 候选SNPs的功能性研究
        2.5.4 候选SNP在 GTEx数据集中验证
        2.5.5 rs4871819 与胃癌相关性的分层分析
    2.6 讨论
第三章 DEPTOR在消化道肿瘤中的荟萃分析
    3.1 资料的搜集与纳入
    3.2 数据整理与质量评估
    3.3 统计学方法
    3.4 结果
        3.4.1 DEPTOR表达与消化道肿瘤患者LNM,临床分期相关性分析
        3.4.2 DEPTOR表达与消化道肿瘤患者预后相关性分析
    3.5 讨论
第四章 DEPTOR的表达与胃癌的相关性研究
    4.1 公共数据库下载和使用
        4.1.1 TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库使用
        4.1.2 GEO(Gene Expression Omnibus)数据库使用
    4.2 统计学方法
    4.3 结果
        4.3.1 DEPTOR在胃癌中及正常组织中的表达情况
        4.3.2 DEPTOR的表达水平与胃癌患者临床分期及预后的相关性分析
    4.4 讨论
第五章 rs4871819 位点的不同等位基因在胃癌细胞中的活性检测
    5.1 主要实验仪器和试剂
        5.1.1 主要实验仪器和设备
        5.1.2 主要实验试剂
        5.1.3 实验材料
    5.2 实验方法
        5.2.1 试剂配制
        5.2.2 细胞培养
        5.2.3 细胞的瞬时转染
        5.2.4 荧光素酶活性的检测
    5.3 统计分析
    5.4 双荧光素酶报告基因实验结果
    5.5 讨论
第六章 全文小结
参考文献
综述
    参考文献
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]DEPTOR在直肠癌中的表达及对预后的影响[J]. 王娟,张朝阳,邵志林,闫国林,张甜甜,李燕,钟春生.  局解手术学杂志. 2018(10)
[2]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He.  Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[3]mTOR结合蛋白的研究进展[J]. 陈莉君,史道华.  现代肿瘤医学. 2012(11)
[4]Impact of human leukocyte antigen mismatching on outcomes of liver transplantation:A meta-analysis[J]. Xiang Lan,Ming-Man Zhang,Cong-Lun Pu,Chun-Bao Guo,Quan Kang,Ying-Chun Li,Xiao-Ke Dai,Yu-Hua Deng,Qiang Xiong,Zhi-Mei Ren,Department of Hepatobiliary Surgery and Liver Transplantation Centre,Children’s Hospital of Chongqing Medical University,136,Zhongshan 2nd Road,Yuzhong District,Chongqing 400014,China.  World Journal of Gastroenterology. 2010(27)
[5]雷帕霉素的作用机制和临床应用[J]. 李民.  国外医学.药学分册. 2002(03)



本文编号：3657443