食管癌细胞敲减LncRNA BC200后的基因表达谱芯片数据分析

发布时间：2022-07-14 20:25

　　目的分析食管癌细胞敲减LncRNA BC200后的基因表达改变,并对差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）进行生物信息学分析,以探讨BC200在食管癌细胞中的功能及作用机制。方法将食管癌细胞系EC9706细胞分为BC200敲减组、阴性对照组和空白对照组。构建的BC200慢病毒干扰载体和无关序列载体分别感染前两组EC9706细胞。分别应用荧光显微镜和实时定量聚合酶链式反应（quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR）检测慢病毒载体感染比率和干扰效率;利用DNA微阵列技术分析敲减BC200后的EC9706细胞的基因表达改变;采用通路分析软件（Ingenuity Pathway Analysis,IPA）分析DEGs所富集的经典信号通路、疾病与功能以及基因相互作用网络,应用qRT-PCR技术验证从癌症相关的基因相互作用网络图中筛选出来的差异倍数（Fold Change,FC）较高的DEGs。结果本研究中慢病毒介导的靶向BC200的干扰序列和无关序列均可成功感染EC9706细胞... 

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

慢病毒介导的靶向BC200的干扰序列和无关序列转染EC9706细胞(100×)

BC200-shRNA可显著降低EC9706细胞BC200的表达(***P<0.001)

DNA微阵列数据信号值分布曲线图

【参考文献】：
期刊论文
[1]Updates on esophageal and gastric cancers[J]. Amy Gallo,Charles Cha.  World Journal of Gastroenterology. 2006(20)

硕士论文
[1]长链非编码RNA BCYRN1在食管鳞癌中的表达水平及其生物学功能的研究[D]. 刘青青.郑州大学 2018



本文编号：3661819