茶树PPO基因家族的表达及SNP分析
发布时间：2022-07-27 15:20
茶树多酚氧化酶（PPO）是一类含铜氧化还原酶,是红茶加工中品质形成的关键酶。本研究克隆了茶树PPO基因家族,优化了PPO诱导表达条件,定量分析了茶树PPO基因家族在不同品种、不同季节中的表达,并分析了不同品种茶树单核苷酸多态性。主要研究结果如下:1、利用生物信息学方法分析PPO基因的核酸和氨基酸序列,预测了编码蛋白质的PPO基因的物理化学性质和结构功能。在PPO基因家族转录的氨基酸序列中相对分子量最小的是PPO2,为22.01KD,最大的是PPO1,为65.9KD;PPO1和PPO3编码蛋白定位于叶绿体中的可能性最大,预测这两个蛋白含有叶绿体转运肽;4个PPO基因编码的蛋白不存在信号肽,均为亲水性蛋白,属于非分泌蛋白,合成后不进入内质网和高尔基体分泌途径,直接释放于细胞质中。PPO2和PPO4编码的蛋白定位于非叶绿体和非线粒体的其他位置的可能性最大,PPO1和PPO3基因编码的蛋白可能存在一个或多个跨膜螺旋。2、根据公布的茶树基因组,应用PCR技术克隆PPO1和PPO3碱基序列,获得1800bp左右的特异性条带,将DH5α感受态细胞成功转入PPO重组质粒,经Bam HI、Not I两种...
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
1.1 多酚氧化酶的研究进展
1.2 茶树多酚氧化酶的研究进展
1.3 多酚氧化酶的酶学性质研究
1.3.1 温度对多酚氧化酶的影响
1.3.2 pH对多酚氧化酶的影响
1.3.3 底物对多酚氧化酶的影响
1.3.4 抑制剂对多酚氧化酶的影响
1.4 多酚氧化酶的提取方法
1.4.1 传统提取法
1.4.2 新型提取法
1.5 多酚氧化酶的细胞定位
1.6 PPO的抗病性
1.7 单核苷酸多态性研究现状
1.8 茶树单核苷酸多态性研究现状
1.9 研究目的及意义
1.10 研究内容
第二章 茶树PPO基因的生物信息学分析
2.1 茶树PPO基因家族的核酸序列的基本分析
2.2 茶树PPO家族基因编码蛋白的理化性质分析
2.3 茶树PPO基因编码蛋白的信号肽与细胞定位分析
2.4 茶树PPO基因编码蛋白跨膜结构域的预测与分析
2.5 小结与讨论
第三章 茶树PPO基因的克隆及原核表达
3.1 材料与方法
3.1.1 材料
3.1.2 方法
3.2 结果与分析
3.2.1 茶树鲜叶RNA提取
3.2.2 PPO基因PCR克隆
3.2.3 PPO基因原核表达
3.3 小结与讨论
第四章 不同茶树品种的PPO比较分析
4.1 材料与方法
4.1.1 材料
4.1.2 方法
4.2 结果与分析
4.2.1 多酚氧化酶在不同品种中变化规律
4.2.2 不同茶树品种real-time PCR分析
4.2.3 酶活性与荧光定量的关联分析
4.3 小结与讨论
第五章 茶树PPO基因的SNP分析
5.1 材料和方法
5.1.1 材料
5.1.2 方法
5.2 结果与分析
5.2.1 PPO基因外显子的SNPs分析
5.2.2 SNP与茶树品种鉴定
5.2.3 导致氨基酸变异的SNP
5.2.4 PPO的酶活性与SNP位点关联分析
5.2.5 SNPs与茶树品种基因型的关联分析
5.3 小结与讨论
第六章 总结与展望
参考文献
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]microRNA-146a单核苷酸多态性与大肠癌遗传易感性的关联研究[J]. 朱文劲,徐飞鹏,许庆文,鲁珏,林琳,黄哲,王玮尉,黄先进. 现代医院. 2019(03)
[2]SUMO化和磷酸化的相互作用与共同修饰[J]. 吴树强,朱水山. 中国生物化学与分子生物学报. 2019(02)
[3]金银花多酚氧化酶抑制剂的筛选[J]. 李菁,马东来,刘宏伟,冯建明,李静娟,郑玉光. 中成药. 2019(02)
[4]广东客家茶树种质资源儿茶素特性分析[J]. 乔小燕,黄华林,李波,姜晓辉,陈栋. 江西农业学报. 2019(01)
[5]利用CRISPR/Cas9敲除葡萄VviPDS1基因的研究[J]. 郭晔,万东艳,柴壮壮,王跃进,文颖强. 园艺学报. 2019(04)
[6]抑制山药中多酚氧化酶活性的研究[J]. 段勇. 食品工程. 2018(04)
[7]橄榄多酚氧化酶和过氧化物酶的抑制剂筛选及其热失活动力学[J]. 吴倩,余元善,刘淑媚,肖更生,徐玉娟. 现代食品科技. 2019(02)
[8]RBM20基因新发错义突变致家族性儿童扩张性心肌病1例报告[J]. 彭昌,徐合平,王世远. 临床儿科杂志. 2018(12)
[9]儿茶素对软脂酸导致的大鼠原代肝细胞损伤的保护作用[J]. 苗良生,王晓娟,关新江,李万鹏,董小章,倪秀梅,李雪,张勇. 延安大学学报(医学科学版). 2018(04)
[10]利用CRISPR/Cas9技术定点敲除烟草多酚氧化酶基因NtPPO1[J]. 姚恒,杨大海,白戈,谢贺. 生物技术通报. 2018(11)
博士论文
[1]拟南芥抗逆相关泛素连接酶SINA2的调控分析及小麦SINA同源基因的克隆[D]. 陈阳.西北农林科技大学 2018
[2]茶多酚氧化酶基因的克隆及其工程菌的构建[D]. 王乃栋.山东农业大学 2012
[3]机械伤害诱导豌豆幼苗防御性反应及其调控机制[D]. 刘艳.中国农业大学 2005
硕士论文
[1]黄颡鱼生长激素基因多态性与生长性状的关联性研究[D]. 李美娟.华南农业大学 2016
[2]茶树AMP脱氨酶基因的克隆及咖啡碱合成酶基因（TCS1）的cSNP分析[D]. 魏艳丽.安徽农业大学 2013
[3]茶树咖啡碱与可可碱含量、关键酶基因表达量及cSNP相关性分析[D]. 李金.安徽农业大学 2013
[4]黄牛KLF7、KLF11和KLF15基因的单核苷酸多态性及其与生长性状的关联研究[D]. 马亮.西北农林科技大学 2010
[5]茶树多酚氧化酶的基因克隆与原核表达[D]. 刘敬卫.华中农业大学 2009
[6]亚洲玉米螟幼虫酚氧化酶原纯化及其组织定位研究[D]. 吕文静.扬州大学 2009
[7]膜蛋白跨膜螺旋预测的研究[D]. 李吉.上海交通大学 2010
[8]姜黄素、槲皮素等八种效应物对光肩星天牛幼虫PPO影响的试验研究[D]. 叶雅杰.东北师范大学 2006
本文编号：3665696
【文章页数】：72 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
1.1 多酚氧化酶的研究进展
1.2 茶树多酚氧化酶的研究进展
1.3 多酚氧化酶的酶学性质研究
1.3.1 温度对多酚氧化酶的影响
1.3.2 pH对多酚氧化酶的影响
1.3.3 底物对多酚氧化酶的影响
1.3.4 抑制剂对多酚氧化酶的影响
1.4 多酚氧化酶的提取方法
1.4.1 传统提取法
1.4.2 新型提取法
1.5 多酚氧化酶的细胞定位
1.6 PPO的抗病性
1.7 单核苷酸多态性研究现状
1.8 茶树单核苷酸多态性研究现状
1.9 研究目的及意义
1.10 研究内容
第二章 茶树PPO基因的生物信息学分析
2.1 茶树PPO基因家族的核酸序列的基本分析
2.2 茶树PPO家族基因编码蛋白的理化性质分析
2.3 茶树PPO基因编码蛋白的信号肽与细胞定位分析
2.4 茶树PPO基因编码蛋白跨膜结构域的预测与分析
2.5 小结与讨论
第三章 茶树PPO基因的克隆及原核表达
3.1 材料与方法
3.1.1 材料
3.1.2 方法
3.2 结果与分析
3.2.1 茶树鲜叶RNA提取
3.2.2 PPO基因PCR克隆
3.2.3 PPO基因原核表达
3.3 小结与讨论
第四章 不同茶树品种的PPO比较分析
4.1 材料与方法
4.1.1 材料
4.1.2 方法
4.2 结果与分析
4.2.1 多酚氧化酶在不同品种中变化规律
4.2.2 不同茶树品种real-time PCR分析
4.2.3 酶活性与荧光定量的关联分析
4.3 小结与讨论
第五章 茶树PPO基因的SNP分析
5.1 材料和方法
5.1.1 材料
5.1.2 方法
5.2 结果与分析
5.2.1 PPO基因外显子的SNPs分析
5.2.2 SNP与茶树品种鉴定
5.2.3 导致氨基酸变异的SNP
5.2.4 PPO的酶活性与SNP位点关联分析
5.2.5 SNPs与茶树品种基因型的关联分析
5.3 小结与讨论
第六章 总结与展望
参考文献
致谢
作者简介
【参考文献】：
期刊论文
[1]microRNA-146a单核苷酸多态性与大肠癌遗传易感性的关联研究[J]. 朱文劲,徐飞鹏,许庆文,鲁珏,林琳,黄哲,王玮尉,黄先进. 现代医院. 2019(03)
[2]SUMO化和磷酸化的相互作用与共同修饰[J]. 吴树强,朱水山. 中国生物化学与分子生物学报. 2019(02)
[3]金银花多酚氧化酶抑制剂的筛选[J]. 李菁,马东来,刘宏伟,冯建明,李静娟,郑玉光. 中成药. 2019(02)
[4]广东客家茶树种质资源儿茶素特性分析[J]. 乔小燕,黄华林,李波,姜晓辉,陈栋. 江西农业学报. 2019(01)
[5]利用CRISPR/Cas9敲除葡萄VviPDS1基因的研究[J]. 郭晔,万东艳,柴壮壮,王跃进,文颖强. 园艺学报. 2019(04)
[6]抑制山药中多酚氧化酶活性的研究[J]. 段勇. 食品工程. 2018(04)
[7]橄榄多酚氧化酶和过氧化物酶的抑制剂筛选及其热失活动力学[J]. 吴倩,余元善,刘淑媚,肖更生,徐玉娟. 现代食品科技. 2019(02)
[8]RBM20基因新发错义突变致家族性儿童扩张性心肌病1例报告[J]. 彭昌,徐合平,王世远. 临床儿科杂志. 2018(12)
[9]儿茶素对软脂酸导致的大鼠原代肝细胞损伤的保护作用[J]. 苗良生,王晓娟,关新江,李万鹏,董小章,倪秀梅,李雪,张勇. 延安大学学报(医学科学版). 2018(04)
[10]利用CRISPR/Cas9技术定点敲除烟草多酚氧化酶基因NtPPO1[J]. 姚恒,杨大海,白戈,谢贺. 生物技术通报. 2018(11)
博士论文
[1]拟南芥抗逆相关泛素连接酶SINA2的调控分析及小麦SINA同源基因的克隆[D]. 陈阳.西北农林科技大学 2018
[2]茶多酚氧化酶基因的克隆及其工程菌的构建[D]. 王乃栋.山东农业大学 2012
[3]机械伤害诱导豌豆幼苗防御性反应及其调控机制[D]. 刘艳.中国农业大学 2005
硕士论文
[1]黄颡鱼生长激素基因多态性与生长性状的关联性研究[D]. 李美娟.华南农业大学 2016
[2]茶树AMP脱氨酶基因的克隆及咖啡碱合成酶基因（TCS1）的cSNP分析[D]. 魏艳丽.安徽农业大学 2013
[3]茶树咖啡碱与可可碱含量、关键酶基因表达量及cSNP相关性分析[D]. 李金.安徽农业大学 2013
[4]黄牛KLF7、KLF11和KLF15基因的单核苷酸多态性及其与生长性状的关联研究[D]. 马亮.西北农林科技大学 2010
[5]茶树多酚氧化酶的基因克隆与原核表达[D]. 刘敬卫.华中农业大学 2009
[6]亚洲玉米螟幼虫酚氧化酶原纯化及其组织定位研究[D]. 吕文静.扬州大学 2009
[7]膜蛋白跨膜螺旋预测的研究[D]. 李吉.上海交通大学 2010
[8]姜黄素、槲皮素等八种效应物对光肩星天牛幼虫PPO影响的试验研究[D]. 叶雅杰.东北师范大学 2006
本文编号：3665696
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3665696.html
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