亚麻荠油脂相关转录因子CsLEC2基因家族的鉴定及表达分析

发布时间：2022-09-27 17:07

　　对亚麻荠CsLEC2家族进行全基因组鉴定、半定量RT-PCR、qRT-PCR,检测CsLEC2基因的时空表达特性并通过转录组数据预测CsLEC2下游靶基因,以解析CsLEC2调控亚麻荠种子油脂合成和积累等生物学功能。结果表明,在亚麻荠基因组中共鉴定到3个亚麻荠CsLEC2基因（CsLEC2.1、CsLEC2.2和CsLEC2.3）。蛋白理化性质和高级结构分析显示,亚麻荠CsLEC2蛋白具有与拟南芥AtLEC2相似的理化性质,且其二级结构的主体也相似。系统进化分析表明,亚麻荠CsLEC2蛋白与模式植物拟南芥AtLEC2蛋白及拟南芥琴亚种AlLEC2蛋白亲缘关系最近。qRT-PCR结果显示亚麻荠CsLEC2在未成熟的种子中高表达。转录组数据分析显示下游基因CsWRI1和CsOLE3高表达,推测CsLEC2可能直接上调CsWRI1和CsOLE3的转录表达,参与油脂代谢调控。 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 数据来源与序列鉴定
    1.3 Cs LEC2基因及编码蛋白的基本结构分析
    1.4 Cs LEC2蛋白的保守结构域和系统进化分析
    1.5 Cs LEC2启动子序列顺式元件分析
    1.6 Cs LEC2基因的实时定量PCR表达分析
    1.7 Cs LEC2下游基因预测
2 结果与分析
    2.1 Cs LEC2家族基因结构与编码蛋白序列基本特征分析
    2.2 Cs LEC2蛋白高级结构分析
    2.3 Cs LEC2氨基酸多序列比对
    2.4 Cs LEC2家族蛋白保守基序和系统进化分析
    2.5 Cs LEC2启动子的功能元件分析
    2.6 Cs LEC2基因的表达分析
    2.7 Cs LEC2调控的下游基因预测
3 讨论
    3.1 Cs LEC2的序列特征分析
    3.2 Cs LEC2的表达模式分析
    3.3 Cs LEC2的下游基因预测分析
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]玉米ZmCOL3pro217启动子的克隆及功能分析[J]. 果天宇,尹悦佳,贾伟,柳青,郭嘉,刘洋,陈子奇,郝东云,刘相国.  玉米科学. 2020(02)
[2]LAFL基因在种子发育和萌发中的功能[J]. 郭秀芬,张海龙,王明晶,赵振杰,宋扬,李立新.  植物生理学报. 2019(04)
[3]新型工业油料作物亚麻荠:从基因组到代谢工程[J]. 苑丽霞,毛雪,高昌勇,张莉,薛金爱,李润植.  植物生理学报. 2015(08)
[4]植物脂肪酸的生物合成及其生理功能的研究进展[J]. 李昌珠,李正茂.  湖南林业科技. 2009(06)
[5]番木瓜proteinase omega基因启动子的克隆及功能初步研究[J]. 杨英军,周鹏.  云南植物研究. 2005(05)

硕士论文
[1]植物中油脂调节基因ABSCISIC ACID INSENSITIVE3、FUSCA3和LEAFY COTYLEDON2的鉴定、系统进化和结构特征分析[D]. 唐通.西北农林科技大学 2019
[2]大豆GmLEC2基因的克隆及再生功能的初步分析[D]. 马彦龙.东北农业大学 2016



本文编号：3681267