8个地理种群红条毛肤石鳖COI基因的遗传多样性分析

发布时间：2022-09-27 19:40

　　[目的]分析我国8个沿海潮间带红条毛肤石鳖地理种群的COI基因的遗传多样性。[方法]利用聚合酶链式反应（PCR）技术扩增8个地区80个红条毛肤石鳖样品的COI基因。使用DNASP5.10.01、MEGA7.0等软件对所得序列进行分析,得到片段碱基含量、遗传距离以及遗传多样性参数等数据,并通过构建系统发育树的方式,结合遗传多样性数据分析结果。[结果]获得的COI基因片段长度为659 bp,COI基因位于线粒体编码区中,平均A、T、C、G的碱基含量分别20.4%、41.7%、14.9%和23.0%,存在明显的AT偏向,结合Acanthochitona crinita为外群系统发育树的结果来看,中国沿海地区红条毛肤石鳖种群分成2个明显的聚群,将它们定义为北方群体和南方群体,遗传距离为0.000 66～0.087 85。单倍型遗传多样性数据显示,多样性数值较高,但核苷酸多样性较低。[结论]红条毛肤石鳖北方群体的遗传多样性与南方群体存在差异,2个群体应该分别采取相应措施来保护遗传多样性。 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 试验方法
        1.2.1 DNA提取。
        1.2.2 PCR扩增。
        1.2.3 序列处理和分析。
2 结果与分析
    2.1 产物检测结果
    2.2 碱基含量分析
    2.3 各地区遗传距离分析
    2.4 红条毛肤石鳖COI基因遗传多样性分析
    2.5 系统发育树分析
3 结论


【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]基于线粒体DNA的长江上游四种薄鳅属鱼类遗传多样性研究[D]. 申绍祎.西南大学 2018



本文编号：3681497