青海地区藏、汉族胃癌差异表达基因的筛选研究

发布时间：2022-09-27 19:51

　　目的:以青海地区藏族和汉族胃癌血浆、组织标本为研究对象,采用mi RNA芯片等相关检测方法,分析青海地区藏、汉族胃癌发生发展过程中的基因表达差异。方法:收集2017年10月-2019年03月在青海省人民医院行手术治疗胃癌患者胃癌、癌旁组织及术前静脉血各80例,同时收集健康者静脉血10例（其中藏族5例,汉族5例）,并采集临床资料。从75例胃癌手术患者中随机选取5例藏族、5例汉族胃癌患者胃癌组织、术前血浆作为病例组进行mi RNA芯片检测,5例藏族、5例汉族健康者静脉血血浆为对照组进行mi RNA芯片检测,筛选出差异表达的mi RNA并通过相关软件预测差异mi RNA可能的靶基因,并对这些靶基因进行聚类分析、基因功能及信号通路分析。结果:1.通过基因芯片检测及进一步筛选得到了235个可能有意义的差异mi RNA,其中表达上调的118个,下调的117个（P＜0.05且FC≥2）。2.通过12种数据库预测得到差异mi RNA可能的靶基因,以及靶基因可能的功能、靶基因可能富集到的一些信号通路。3.根据P值及FC值从每组筛选出10个差异mi RNA共40个差异mi RNA准备进行下一步验证。结论:... 

【文章页数】：63 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
主要符号对照表
第一章 引言
第二章 材料与方法
    2.1 研究对象
    2.2 实验材料
        2.2.1 主要试剂
        2.2.2 主要仪器及设备
    2.3 资料收集
    2.4 实验方法
        2.4.1 标本采集及保存
        2.4.2 血浆样本实验步骤
        2.4.3 组织样本实验步骤
    2.5 生物信息学研究
        2.5.1 聚类分析
        2.5.2 差异miRNA靶基因预测
        2.5.3 差异miRNA靶基因功能分析(Gene Ontology,GO)和信号通路分析(Pathway)
    2.6 统计学分析
第三章 结果
    3.1 一般临床特征
    3.2 RNA质量控制
    3.3 芯片检测得到的差异miRNA
        3.3.1 血浆样本中差异miRNA数量统计
        3.3.2 组织样本中差异miRNA数量统计
    3.4 差异miRNA的靶基因富集分析
        3.4.1 汉族胃癌血浆与对照血浆组GO和 Pathway分析
        3.4.2 藏族胃癌血浆与对照血浆组GO和 Pathway分析
        3.4.3 汉族胃癌组织与癌旁组织组GO和 Pathway分析
        3.4.4 藏族胃癌组织与癌旁组织组GO和 Pathway分析
    3.5 筛选出的待验证差异miRNA
第四章 讨论
    4.1 胃癌发病及预后现状
    4.2 芯片检测得到的差异miRNA
    4.3 待验证的差异miRNA
        4.3.1 汉族胃癌血浆与正常血浆实验组
        4.3.2 汉族胃癌组织与癌旁组织实验组
        4.3.3 藏族胃癌血浆与正常血浆实验组
        4.3.4 藏族胃癌组织与癌旁组织实验组
    4.4 本研究的优势与局限
第五章 结论
参考文献
致谢
综述 miRNA在胃癌诊疗中的研究进展
    参考文献
作者简历


【参考文献】：
期刊论文
[1]MicroRNAs在肿瘤相关成纤维细胞促进肿瘤发展进程中的作用[J]. 郭雪茹,徐克.  中国肿瘤生物治疗杂志. 2019(11)
[2]miRNAs在高级别浆液性卵巢癌中的作用[J]. 熊娇,李娜,王东红.  医学综述. 2019(22)
[3]miRNA与动脉粥样硬化炎症机制研究进展[J]. 顾燕妮,谢春毅.  中国免疫学杂志. 2019(20)
[4]药物性肝损伤与非编码RNA的研究进展[J]. 卢西雅,王菲,杨长青.  国际消化病杂志. 2019(05)
[5]microRNA集合富集分析工具的研究进展[J]. 李建伟,徐梦梦,杨宵月,刘磊波,杜燕波,韩小芬.  生理科学进展. 2019(05)
[6]微小RNA在心脏传导系统中的研究现状[J]. 朱烟朦,谢冰鑫,孙丽华.  中国临床药理学杂志. 2019(19)
[7]MicroRNA-320a suppresses tumor progression by targeting PBX3 in gastric cancer and is downregulated by DNA methylation[J]. Yong-Shuang Li,Ying Zou,Dong-Qiu Dai.  World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2019(10)
[8]miR-335、Survivin表达及对乳腺癌术后患者预后评估的价值[J]. 余进松,李忠,徐毅,李渊,贾韵豪,丁波.  现代肿瘤医学. 2019(13)
[9]下调miRNA-214表达抑制胃癌SGC-7901/DDP细胞顺铂耐药、迁移和上皮间质转化[J]. 朱艳,刘玮丽,吴明东,庄永卫,叶淑芳,施旭红.  世界华人消化杂志. 2019(12)
[10]miRNA调控肿瘤微环境的研究进展[J]. 李欣,罗小玲.  现代免疫学. 2019(03)

硕士论文
[1]胃腺癌肿瘤干细胞中异常表达的miRNA初筛及miR-199b-5p的初步研究[D]. 曹阳.河北大学 2017



本文编号：3681514