非小细胞肺癌TUBB3基因表达调控的生物信息学分析

发布时间：2022-11-08 21:24

　　目的 应用生物信息学的方法研究β-微管蛋白亚型TUBB3在非小细胞肺癌（NSCLC）中的表达及其分子调控机制。方法 通过GEO数据集（GEO profile）、转录因子和miRNA调控关系数据库（TransmiR）、综合型的miRNA靶基因数据库（miRWalk）、转录因子结合位点搜索（ConSite）等,研究TUBB3上游转录因子、共表达基因及与其有相互作用的miRNA等,阐明NSCLC中TUBB3表达的分子调控机制及其可能的作用。结果 TUBB3的启动子存在Snail、n-MYC等多个与NSCLC相关的转录因子结合位点。其在转录后水平受到miR-200家族、miR-342-3p、miR-410等miRNA的调控,这些miRNA与NSCLC的增殖与侵袭有关。TUBB3与HDGF、GMPS、MRPL9、PMAIP1和SLBP有共表达行为,受转录因子Snail共同调控。其中SLBP、PMAIP1及转录因子Snail与细胞周期和细胞凋亡存在一定的联系。结论 NSCLC中TUBB3的表达受到多个层面的调控,其可能参与了细胞周期和凋亡,同时与NSCLC细胞增殖与侵袭存在一定的联系。 

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本文编号：3704584