乳腺癌分型标志基因功能研究及其之间相关性研究

发布时间：2022-12-03 22:12

　　乳腺癌是一类复杂的异质类疾病,乳腺癌的分型方法很多,但都不够精确且对治疗没有很好的指导意义,尤其是恶性程度高、难治愈的三阴型乳腺癌,尚未寻找到对其准确有效的临床诊断方法和治疗靶点。寻找合理准确的分型标志基因,对乳腺癌及三阴型乳腺癌的分型鉴别、诊断和治疗起着至关重要的作用。在本研究中,我们探索了分型标志基因FOXA1、SOD2和IL6在三阴性乳腺癌中的分型效果及相关机制。采用生物信息学分析和分子实验验证相结合的方法:通过检测体外三阴性乳腺癌细胞的转录和翻译水平、分析数据库中乳腺癌细胞系和临床样本的基因表达水平,我们系统地分析研究了FOXA1、SOD2和IL6作为分型标志基因,对三阴型乳腺癌和非三阴型乳腺癌的区分效果;通过预测公共数据库转录结合情况、进行染色质免疫共沉淀和双荧光素报告基因实验等,分析和验证FOXA1与SOD2和IL6之间的相关性。我们还通过大量的体外细胞学实验,对FOXA1、SOD2和IL6的功能进行相关研究。结果显示:FOXA1低表达可导致恶性肿瘤增殖能力增强,且FOXA1通过转录抑制SOD2和IL6的表达,从而影响三阴型乳腺癌细胞的凋亡,迁移及干细胞比例,这提示我们:F... 

【文章页数】：56 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
    1.1 乳腺癌概述
    1.2 乳腺癌分子分型
        1.2.1 乳腺癌组织分子分型
        1.2.2 乳腺癌细胞系分子分型
        1.2.3 乳腺癌细胞系和组织分子分型联系
    1.3 三阴型乳腺癌研究现状
    1.4 乳腺癌分型标志基因简介
    1.5 立题依据与意义
    1.6 主要研究内容
第二章 材料与方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 细胞系
        2.1.2 抗体
        2.1.3 试剂盒和耗材
        2.1.4 试剂及试剂配制
        2.1.5 仪器设备
    2.2 实验方法
        2.2.1 细胞培养
        2.2.2 瞬时转染siRNA
        2.2.3 瞬时转染CRISPR基因编辑质粒
        2.2.4 qRT-PCR实验检测
        2.2.5 Western-blot实验检测
        2.2.6 细胞增殖实验
        2.2.7 细胞凋亡实验
        2.2.8 干细胞比例流式检测实验
        2.2.9 细胞迁移实验
        2.2.10 染色质免疫共沉淀实验
        2.2.11 双荧光素酶报告基因实验
    2.3 数据统计与分析
        2.3.1 公共数据库基因表达分析
        2.3.2 KM plotter预后分析
        2.3.3 实验结果统计分析
第三章 结果与讨论
    3.1 分型基因在乳腺癌细胞系层面的分型研究
        3.1.1 利用E-MTAB-181数据库分析分型基因分型效果
        3.1.2 利用qRT-PCR检测分型基因在不同亚型乳腺癌细胞系的mRNA表达差异
        3.1.3 利用Western-blot检测分型基因在不同亚型乳腺癌细胞系的蛋白表达差异
        3.1.4 小结
    3.2 分型基因在乳腺癌组织层面的分型研究
        3.2.1 利用TCGA数据库分析分型基因对乳腺癌组织的分型效果
        3.2.2 利用METABRIC数据库分析分型基因对乳腺癌组织的分型效果
        3.2.3 小结
    3.3 FOXA1基因的功能研究
        3.3.1 利用siRNA降低乳腺癌细胞中的FOXA1表达
        3.3.2 FOXA1低表达对乳腺癌细胞增殖的影响
        3.3.3 FOXA1低表达对乳腺癌细胞凋亡的影响
        3.3.4 FOXA1低表达对乳腺癌细胞干细胞比例的影响
        3.3.5 FOXA1低表达对乳腺癌细胞迁移的影响
        3.3.6 FOXA1对于乳腺癌患者的预后分析
        3.3.7 小结
    3.4 SOD2基因的功能研究
        3.4.1 利用siRNA降低乳腺癌细胞中的SOD2表达
        3.4.2 SOD2低表达对乳腺癌细胞增殖的影响
        3.4.3 SOD2低表达对乳腺癌细胞凋亡的影响
        3.4.4 SOD2低表达对乳腺癌细胞迁移的影响
        3.4.5 SOD2对于乳腺癌患者的预后分析
        3.4.6 小结
    3.5 IL6基因的功能研究
        3.5.1 利用siRNA降低乳腺癌细胞中的IL6表达
        3.5.2 IL6低表达对乳腺癌细胞增殖的影响
        3.5.3 IL6低表达对乳腺癌细胞干细胞比例的影响
        3.5.4 IL6低表达对乳腺癌细胞迁移的影响
        3.5.5 IL6对于乳腺癌患者的预后分析
        3.5.6 小结
    3.6 分型基因之间相关性研究
        3.6.1 利用数据库分析分型基因FOXA1,SOD2和IL6相关性
        3.6.2 FOXA1表达量改变对SOD2和IL6表达的影响
        3.6.3 FOXA1蛋白与SOD2和IL6启动子区域物理结合研究
        3.6.4 FOXA1对于SOD2和IL6的基因表达调控研究
        3.6.5 小结
主要结论与展望
    主要结论
    展望
致谢
参考文献
附录:作者在攻读硕士学位期间发表的论文


【参考文献】：
期刊论文
[1]IL-6、CCL-18表达情况对乳腺癌病理诊断的相关性分析及其临床意义[J]. 张晔,石海英,赵德芳,王震霞,张雅峰.  肿瘤药学. 2018(01)
[2]激素受体阳性晚期乳腺癌的内分泌治疗进展[J]. 徐绮腻,王鸿彪.  中国肿瘤. 2017(10)
[3]肿瘤标志物阳性率与乳腺癌病理分型的相关性分析[J]. 刘中,李希宁,罗志琴,张忠民.  检验医学. 2017(05)
[4]乳腺癌分子分型对治疗的影响[J]. 江泽飞,许凤锐.  中华普外科手术学杂志(电子版). 2015(06)
[5]雌激素受体阳性乳腺癌他莫昔芬耐药机制的研究进展[J]. 柳慧星,王燕忠,于海涛,张钧,谢鑫友.  肿瘤. 2015(09)
[6]三阴性乳腺癌分子特征与潜在治疗靶点[J]. 尉承泽,郝晓鹏.  中国实用外科杂志. 2015(07)
[7]乳腺癌分子分型与治疗策略[J]. 赵毅,邓鑫.  中国实用外科杂志. 2015(07)
[8]乳腺癌患者血清IL-6、IL-1β、TNF-ɑ的变化及其临床意义[J]. 凌存保,吴隽松.  标记免疫分析与临床. 2014(05)
[9]靶向治疗药物的分子靶点蛋白在三阴性乳腺癌中的表达及临床意义[J]. 王齐敏,于香莉,吕丽,唐颖,冯晓海,王莉芬.  肿瘤学杂志. 2014(09)
[10]三阴性乳腺癌化疗进展[J]. 倪晨,李婷,吴振华,胡夕春.  中国癌症杂志. 2014(04)



本文编号：3707078