黄沙鳖β-防御素基因克隆及其表达分析

发布时间：2023-02-07 13:45

　　【目的】明确β-防御素在黄沙鳖先天免疫中的潜在作用,为开展黄沙鳖绿色病害防治及促进其养殖业健康发展打下基础。【方法】运用RACE克隆黄沙鳖β-防御素基因(Hs-BD1)cDNA序列,采用SignalP-5.0、PredictProtein、PSIPRED、Robetta和Clustal X等在线软件进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR检测Hs-BD1基因在黄沙鳖不同组织中的表达特征及细菌感染前后的表达变化。【结果】Hs-BD1基因c DNA序列全长493 bp,包括72 bp的5’非编码区(5’-UTR)、201 bp的开放阅读框(ORF)及220 bp的3’非编码区(3’-UTR)。Hs-BD1基因编码66个氨基酸残基,包括22个氨基酸残基组成的信号肽区、3个氨基酸残基组成的前肽区和41个氨基酸组成的成熟肽区。其中,成熟肽区具有6个保守的半胱氨酸残基(³¹Cys、⁵⁸Cys、³⁸Cys、⁵²Cys、⁴²Cys和⁵⁹Cys)及位于C1和C2间的甘氨...

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【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 RNA提取及c DNA合成
    1.3 引物设计及基因克隆
    1.4 Hs-BD1基因在黄沙鳖不同组织中的表达分析
    1.5 Hs-BD1基因在黄沙鳖感染细菌前后的表达变化
    1.6 生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 Hs-BD1基因克隆及序列分析结果
    2.2 Hs-BD1氨基酸序列比对及系统发育进化分析结果
    2.3 Hs-BD1蛋白空间结构预测结果
    2.4 Hs-BD1基因在黄沙鳖不同组织中的表达特征
    2.5 攻毒前后Hs-BD1基因在黄沙鳖脾脏中的表达变化
3 讨论
4 结论



本文编号：3736937